De overlevenden rapen alle restanten van de crash bij elkaar om te overleven. Sommigen schieten in paniek, anderen hopen op een reddingsactie. De klanken van een mysterieus monster in het oerwoud boezemen angst in het hart. Gelukkig zijn er Jack en Kate om de groep te leiden. Maar iedereen heeft geheimen. Daar zal de groep snel achter komen.

Ontsnapt aan het wezen ontvangt de groep een mysterieuze oproep en komen ze één van de andere eilandbewoners tegen. In het kamp verzorgt Jack een gewonde man en komt hij één van Kate's geheimen te weten.

Jack en Hurley ontdekken dat Kate niet is wie ze lijkt. Ondertussen overpeinzen Kate, Charlie, Sawyer, Sayid, Boone en Shannon de mysteries van het eiland, en vragen ze zich af of ze dit wel met de rest moeten delen. De vriendschap tussen Locke en Walt valt niet in goede aarde bij Michael, maar deze is meer bezorgd over het vinden van zijn hond.

De overlevenden worden wakker geschud door wilde dieren die hun kamp binnendringen. Kate en Michael vergezellen de mysterieuze Locke op zijn jacht naar voedsel, en komen tot een verbazingwekkende ontdekken over Locke. Jack ziet iemand die er niet zou moeten zijn, en we ontdekken dat iemand kan lopen, terwijl hij dat niet zou moeten kunnen.

Boone komt in levensgevaar als hij een vrouw probeert te redden uit de zee. Jack heeft last van hallucinaties door een tekort aan slaap; hij blijft maar denken aan hoe hij op het eiland terecht is gekomen. Claires gezondheid gaat achteruit door een tekort aan vocht.

Walt en de anderen zijn geschrokken als Michael wordt aangevallen. Sun en Jin weten niet precies wat er aan de hand is, omdat ze geen Engels spreken. Jack en Kate ruziën over waar de mensen moeten gaan 'wonen', aan de kust of in het oerwoud. Locke ontdekt het geheim van Charlie.

Charlie probeert met veel moeite van zijn drugsverslaving af te komen. Locke helpt hem hierbij, maar het is niet duidelijk om welke reden hij Charlie helpt. Ondertussen proberen de andere overlevenden Jack te bevrijden uit een ingestorte grot. Sayid, Kate en Boone worden gesaboteerd wanneer zij het signaal van de Franse vrouw proberen te traceren.

Shannon's inhalator is verdwenen verdwenen. Boone verdenkt Sawyer, maar hij weigert de inhalator af te geven. Na een escalatie blijkt Sawyer niet wie hij zegt te zijn.

Op zijn individuele tocht over het eiland ontdekt Sayid een touw op het strand dat leidt naar de jungle. Gedreven door zijn nieuwsgierigheid besluit hij het touw te volgen. Het lokt hem in een valstrik. Wanneer hij terug bij bewustzijn is bevindt hij zich in de schuilplaats van een Française. Het wordt Sayid al vlug duidelijk dat zij de persoon is die de noodoproep heeft uitgezonden. Ondertussen heeft Hurley het perfecte ontspanningsmiddel gevonden: hij heeft een golfterrein aangemaakt. De bewoners kunnen zich, na dagen in angst geleefd te hebben, eindelijk een beetje ontspannen.

Claire heeft de afgelopen nachten nachtmerries over haar ongeboren kind gehad. Die zijn zo levendig dat ze gelooft dat iemand haar kind pijn wil doen. Jack gelooft haar niet en Claire vlucht terug naar het strand. Ondertussen doet Hurley de ontdekking dat één van de overlevenden, Ethan Rom, niet op de passagierslijst staat.

Na de verdwijning van Charlie en Claire volgen Jack, John, Kate en Boone hun sporen. Op een bepaald moment wordt Jack aangevallen door Ethan, die de uitgeputte Jack uiteindelijk overmeestert. Iets later vinden Jack en Kate Charlies lichaam opgehangen in een boom, terwijl John en Boone stuiten op een geheimzinnig luik.

Kate en Sawyer nemen een frisse duik in een meer, waar ze een koffer aantreffen op de bodem. Het blijkt de koffer van de federale agent te zijn, waar hij al zijn pistolen in hield. Sawyer, niet op de hoogte van de inhoud van de koffer, weigert het koffertje af te geven. Daarom schakelt Kate de hulp van Jack in. Wanneer ze uiteindelijk toch de koffer bemachtigen en openen vindt Jack vier pistolen en een envelop die voor Kate grote waarde heeft.

Het wordt Boone duidelijk dat er al gauw een relatie zal ontstaan tussen Sayid en Shannon, zijn stiefzus. Hij heeft moeite dit te aanvaarden en laat hen dat ook weten. Locke merkt hoe afhankelijk Boone van Shannon is en besluit hem te helpen. Door middel van een verdovend middel op zijn hoofd begint Boone te hallucineren, niet wetende dat alles wat hij nu zal meemaken geen werkelijkheid is.

Michael verbiedt zijn zoon Walt om nog langer met Locke om te gaan, en vraagt hem in plaats daarvan te helpen met het bouwen van een vlot, waarop ze kunnen ontsnappen. Walt loopt echter de jungle in, waar hij bijna wordt opgegeten door een ijsbeer.

John en Boone vinden Claire terug, en brengen haar terug naar het kamp. Ze blijkt haar geheugen kwijt te zijn. De volgende dag zegt Ethan tegen Charlie en Jin dat ze Claire moeten teruggeven; anders zal hij elke avond iemand vermoorden. Ondanks de uitgebreide bewaking wordt Scott vermoord. Jack haalt de pistolen uit de koffer tevoorschijn, en Claire wordt als lokaas ingezet om Ethan gevangen te kunnen nemen. Charlie kan zich echter niet beheersen en schiet Ethan dood voordat ze hem kunnen ondervragen.

Op een nacht wordt Sawyer bruut wakker gemaakt door een everzwijn, dat het zeil van zijn beschuttingsplaats meeneemt. Als Sawyer het zwijn achterna gaat hoort hij in de jungle gefluister. Hij herinnert zich dat Sayid hetzelfde heeft meegemaakt. De volgende dag besluit hij het everzwijn te gaan zoeken, met Kates hulp. Bij een drinkspelletje bij het kampvuur onthullen de twee een hoop over hun verleden.

Op een avond vat het vlot van Michael vlam. Ondanks de bluspogingen is het vlot te zwaar beschadigd. Iedereen verdenkt Jin ervan de brand te hebben aangestoken, en Sawyer en Michael vallen hem aan. Sun komt tussenbeide en onthult zo dat ze Engels spreekt. Jin weigert haar nog langer aan te kijken, omdat ze hem in het openbaar heeft vernederd. Hij wil niet langer bij Sun blijven, en helpt Michael met de bouw van een nieuw vlot om zo snel mogelijk te kunnen vertrekken.

Hurley heeft vroeger de loterij gewonnen met de nummers 4, 8, 15, 16, 23 en 42, maar eigenlijk zijn het eerder ongeluksnummers voor de mensen om hem heen. Hij ontdekt dat de nummers ook in de papieren van Rousseau voorkomen. Hij confronteert haar hiermee, en vraagt hoe zij aan de nummers komt. Aan het einde van de aflevering blijkt dat diezelfde reeks nummers ook op het luik dat Boone en Locke hebben gevonden staan.

Boone verliest de hoop het luik ooit nog open te krijgen, maar John wacht en krijgt een teken van het eiland. Hij droomt van een vliegtuig dat neerstort, en wanneer ze dat de volgende dag op de rand van een klif vinden klimt Boone aan boord. Het vliegtuig zit volgeladen met heroïne, maar Boone vindt wel een werkende radio. Hij krijgt heel even contact, maar door zijn gewicht stort het vliegtuig van de klif af. Boone raakt zwaargewond. John draagt Boone naar het kamp, maar verdwijnt daarna in de jungle.

Jack probeert Boones leven te redden, en stuurt Kate naar Sawyer om alcohol te halen voor het ontsmetten van de wonden. Onderweg komt Kate Claire tegen, die op het punt staat om te bevallen. Jack, die inmiddels met een bloedtransfusie voor Boone bezig is, zegt Kate dat zij de baby ter wereld moet brengen. Met de nodige moeite weet ze Claires zoontje ter wereld te brengen. Jack maakt ondertussen aanstalten om Boones been te amputeren, maar Boone vraagt Jack om hem rustig te laten sterven. Vlak voor zijn dood onthult hij nog dat Locke en hij een luik hebben gevonden.

Alle overlevenden zijn geraakt door Boones dood. Vooral Jack en Shannon hebben het er moeilijk mee. Jack besluit John te gaan zoeken voor tekst en uitleg. Na eindeloos in de jungle te hebben gelopen vindt Kate Jack terug, en ze vraagt of hij terug wil komen naar het kamp voor Boones begrafenis. Na een korte ceremonie daagt Jack Locke uit. Locke zegt dat het hem spijt, maar daar neemt Jack geen genoegen mee. Hij valt John aan, maar hij wordt tegengehouden door Michael en Sayid. Uiteindelijk valt Jack uitgeput neer. Nadat hij wat heeft geslapen, merkt Jack dat er een pistool weg is. Sayid vreest dat Shannon John wil vermoorden en hij blijkt gelijk te hebben. Sayid, Jack en Kate treffen Shannon aan terwijl ze Locke onder schot houdt. Sayid kan ervoor zorgen dat Shannon mist, maar hun relatie loopt hierdoor wel een forse deuk op.

Tijdens een drinkpauze stort Michael in elkaar van de pijn. Jack onderzoekt hem en ontdekt dat hij vergiftigd is. Diverse mensen worden verdacht, en Sawyer onthult dat Kate degene was die door de federale agent werd bewaakt. Ondertussen ruziën Jack, Locke en Sayid over wat ze met het luik moeten.

Er stijgt een zwarte rook op uit de jungle, en Rousseau waarschuwt de overlevenden dat de Anderen er aan komen. Om iedereen in veiligheid te kunnen brengen worden voorbereidingen getroffen om het luik op te blazen. Michael, Walt, Sawyer en Jin vertrekken met het vlot.

De voorbereidingen om naar het luik te verhuizen gaan door. Rousseau ontvoert Claires baby, Aaron, en Charlie en Sayid gaan achter haar aan. Ondertussen overvallen de Anderen het vlot, met dramatische gevolgen.

Jack, Locke en Kate ontdekken het geheimzinnige luik, maar Jack besluit om nog even te wachten met naar beneden gaan. Kate en Locke zijn niet zo geduldig. Als Shannon op Vincent (de hond) jaagt, ontmoet ze een bekend gezicht in de jungle.

Met de ontvoering van Walt vers in gedachte, hun vlot vernietigd, en Jin die ontbreekt, vechten Michael en Sawyer voor hun leven in de oceaan. Ondertussen moet Locke afdalen in het luik als Kate binnen vermist blijkt te zijn. Jack volgt niet veel later. Ten slotte zien we in een flashback meer van de moeilijke relatie van Michael met zijn ex-geliefde Susan en hun baby Walt. Ze vechten om de voogdij van Walt en Michael moet hem uiteindelijk laten gaan.

Jack, Locke en Kate ontdekken meer geheimen over het luik. Ondertussen, nadat ze zijn geslagen en gevangen genomen, vragen Sawyer, Michael en Jin zich af of hun ontvoerders zijn collega-overlevenden zijn of dat ze te maken hebben met de gevreesde 'Others'. De flashbacks onthullen meer over het verleden van Locke.

Hurley worstelt met een toegewezen taak binnen het luik. Ondertussen komen Sawyer, Michael en Jin achter de identiteit van hun ontvoerders op het eiland. Claire ontdekt een verrassend stukje informatie over het vlot.

Michael vertrekt naar de jungle, vastberaden om Walt terug te vinden. Al snel ontdekt hij dat hij niet alleen is. Ondertussen worden Sawyer en Jin bevolen om de ontvoerders mee te nemen naar hun kamp. Sun is op zoek naar haar vermiste trouwring.

Sawyer's wond begint levensbedreigende vormen aan te nemen. Hij is samen met Michael en Jin op weg naar hun eigen kamp. Ondertussen wordt Shannon weer achtervolgd door visioenen van Walt.

De eerste 48 dagen van de levens van de andere overlevenden worden vertoond. Flashbacks onthullen het verhaal van Ana-Lucia, Mr Eko, Bernard, Libby en andere overlevenden nadat ze zijn neergestort aan de andere kant van het eiland. Als ze besluiten het eiland in te gaan trekken om te proberen The Others een stap voor te blijven, beseffen ze dat er iemand onder hen is die niet op vlucht 815 zat.

Geweld barst los als Ana Lucia en haar groep tegen Sayid en de andere schipbreukelingen op het eiland aanlopen. Ana Lucia houdt Sayid gevangen. Kate en Jack houden een oogje op Sawyer wanneer Mr Eko hem terug brengt naar het kamp. Flashbacks onthullen het onrustige leven van Ana Lucia als agent.

In het vervolg van Kate's flashback, zien we haar oorspronkelijke misdaad. Locke en Eko doen een interessante ontdekking over de film en Michael heeft een mysterieuze ontmoeting met de computer.

Deze aflevering laat zien waarom Mr. Eko zijn mysterieuze 40-dagen stilte in stand houdt. Claire begint het geloof in Charlie te verliezen nadat Mr. Eko hem stevig begint te ondervragen over de Maria standbeeldjes. Kate geeft de herstellende Sawyer een nieuw kapsel.

Jack, Locke en Sawyer volgen Michael de jungle in, als hij vastbesloten is om Walt terug te gaan halen. Ondertussen reageert Sun verrast op de wens van Jin om mee te zoeken. Hurley en Charlie discussiëren over het eeuwenoude raadsel van wat vrouwen nou precies willen.

Charlie heeft angstig realistische dromen, die hem vertellen dat baby Aaron in gevaar is. Als hij dit aan Locke vertelt, denkt Locke dat Charlie weer drugs heeft gebruikt. Ondertussen moedigt Sawyer Hurley aan om op Libby af te stappen.

Een deel van de overlevenden zijn bang dat The Others terug zijn gekeerd, nadat Sun ernstig gewond is geraakt. De vertrouwensband tussen Locke en Jack wordt op de proef gesteld aangaande het opsluiten van de wapens. Ondertussen is Sawyer een geamuseerd toeschouwer als het escaleert tussen Jack, Locke, Kate en Ana Lucia. Wanneer Jack met opzet de medicatie van Sawyer afpakt, duwt hij hem meer in de richting van Locke.

Wanneer Danielle Sayid naar een mysterieuze plek in de jungle brengt, is hij vastberaden om erachter te komen of ze een van The Others is.

Een mysterieuze ziekte die baby Aaron plotseling treft brengt een wanhopige Claire, Kate en Danielle terug naar de plek waar Claire in eerste instantie werd ontvoerd. Ze gelooft dat ze daar medicatie voor Aaron kan vinden. In de tussentijd doen Jack en Locke hun best om een geheim verborgen te houden van de rest van de overlevenden op het eiland.

Sun komt tot de ontdekking dat ze zwanger zou kunnen zijn. Ze twijfelt erover het aan Jin te vertellen. Ondertussen, nadat pogingen van Jack en Sayid zonder succes bleven, is Ana Lucia gevraagd door Locke om de nieuwe gevangene, Henry Gale, te ondervragen. Ze moet proberen om meer informatie uit hem te krijgen over de luchtballon, waarmee hij en zijn vrouw zogenaamd landde op het eiland.

Wanneer het luik plotseling een eigen leven begint te krijgen, is Locke gedwongen om de hulp van een onwaarschijnlijke bondgenoot in te schakelen. Ondertussen gaan Ana Lucia, Sayid en Charlie de jungle in om achter de waarheid over Henry Gale te komen. Ze gaan kijken of er echt een ballon in de jungle te vinden is.

Libby ontfermt zich over Hurley die denkt dat het eiland een vreemde invloed op hem heeft. Hurley denkt dat hij Dave ziet op het eiland, een vriend die hij heeft leren kennen in de psychiatrische inrichting.

Rose is verrassend fel tegen het plan van Bernard om een SOS-signaal te maken. Er slaan romantische vonken over tussen Jack en Kate als ze samen de jungle intrekken voor een tocht naar The Others. Locke begint zijn geloof in het eiland te verliezen.

Nadat ze Michael uitgeput in het bos hebben gevonden, brengen Jack en Kate hem terug naar het kamp. Als hij wakker wordt, heeft Michael een aantal nieuwe details over The Others. Hurley is bezig met het plannen van een date met Libby.

Mr Eko heeft dromen over zijn broer. Ondertussen moeten Jack en de andere overlevenden om zien te gaan met de verschrikkelijke situatie in het luik, na de dood van Ana Lucia en Libby.

Een vastberaden Michael overtuigt Jack en een aantal andere schipbreukelingen om hem te helpen Walt terug te halen van The Others. Wanneer Jack weg gaat, is Locke verantwoordelijk geworden voor het luik. Hij moet beslissen of hij Henry kan geloven.

Na weer een verrassende ontdekking, komen Jack en Sayid met een plan om The Others aan te spreken Walt terug te halen. Tegelijkertijd komt er een antwoord op de vraag waar Michael is. Ondertussen vliegen Eko en Locke elkaar in de haren als Locke een potentieel catastrofale beslissing maakt over de knop en het luik. Ten slotte keert Desmond terug. Hij verteld over zijn ervaring op het eiland in de afgelopen drie jaar.

Na weer een verrassende ontdekking, komen Jack en Sayid met een plan om The Others aan te spreken Walt terug te halen. Tegelijkertijd komt er een antwoord op de vraag waar Michael is. Ondertussen vliegen Eko en Locke elkaar in de haren als Locke een potentieel catastrofale beslissing maakt over de knop en het luik. Ten slotte keert Desmond terug. Hij verteld over zijn ervaring op het eiland in de afgelopen drie jaar.

Jack, Kate en Sawyer zijn gevangen genomen door de mysterieuze Others. Nadat hun ontvoerders hen bedwelmd hebben en bloedmonsters hebben afgenomen, worden ze gevangen gehouden in afzonderlijke verblijven. De leiders - Ben en Juliet - proberen om de schipbreukelingen zich op hun gemak te laten voelen.

Sun en Jin's leven komt in gevaar wanneer Sayid probeert Jack en de andere vermisten terug te vinden. Sayid bedenkt een plan om de aandacht van de Others te krijgen. Ondertussen doet Ben een verleidelijk aanbod aan Jack, in ruil voor zijn medewerking. Kate en Sawyer hebben moeite met het aanpassen aan de moeilijke omstandigheden die hen worden voorgeschoteld door The Others.

Locke, Eko en Desmond komen verspreid over het eiland weer bij, na de implosie van het luik. Locke krijgt een boodschap van het eiland, waarin hem wordt gevraagd om de situatie die hij heeft veroorzaakt op te lossen. Hurley keert terug naar het kamp met de mededeling dat Kate, Jack en Sawyer gevangen zijn genomen. Desmond is extreem veranderd door de implosie, waardoor hij ineens mysterieuze nieuwe krachten bezit.

The Others voorkomen dat Sawyer en Kate kunnen ontsnappen. Sawyer is verbijsterd door de omvang van de maatregelen die zijn genomen om ze gevangen te houden. Jack krijgt de vraag om zijn medische kennis te gebruiken met het redden van het leven van een van The Others. Op het strand trekt Desmond's vreemde gedrag de aandacht. Hij begint aan de bouw van een mysterieus apparaat.

Een aantal schipbreukelingen gaan naar het 'Pearl station' om een computer te vinden die ze kunnen gebruiken om Jack, Kate en Sawyer te lokaliseren. Jack weet niet wie hij moet vertrouwen wanneer twee van The Others op gespannen voet met elkaar leven.

Jack maakt een beslissing over Ben's aanbod. Sawyer's leven komt in gevaar wanneer Pickett besluit om zijn dreigement uit te voeren. Locke ontdekt een verborgen boodschap die kan helpen met het ontrafelen van de geheimen van het eiland. Kate's herinneringen uit het verleden laten haar een belangrijke keuze maken.

Jack heeft The Others in een houdgreep wanneer hij Ben's leven in zijn handen heeft. Ondertussen proberen Kate en Sawyer te ontsnappen van hun onderdrukkers.

Nadat Desmond Claire heeft gered van de verdrinkingsdood, proberen Charlie en Hurley erachter te komen waarom Desmond de toekomst kan voorspellen. Desmond weet precies wat er wanneer gaat gebeuren.

Wanneer Kate en Sawyer terugreizen naar het kamp, krijgen ze een discussie over het wel of niet redden van Jack.

Kate heeft het nog steeds moeilijk met de beslissing om Jack achter te laten bij The Others. Ondertussen heeft Hurley een oud busje gevonden in de jungle.Kate heeft het nog steeds moeilijk met de beslissing om Jack achter te laten bij The Others. Ondertussen heeft Hurley een oud busje gevonden in de jungle.

Tijdens hun missie om Jack en Kate te redden, lopen Sayid en Locke tegen een mysterieus gebouw aan. In het kamp speelt Sawyer een tafeltenniswedstrijd, met al zijn bezittingen als inzet.

Claire heeft een idee over hoe ze een bericht kunnen sturen naar de buitenwereld. Charlie is echter sceptisch over het idee. Ook Desmond ziet het niet zitten en hij probeert het plan te saboteren. Als Claire probeert te achterhalen waar de tegenstand van beide heren vandaan komt, herinnert ze zich enkele traumatische gebeurtenissen uit haar verleden.Claire heeft een idee over hoe ze een bericht kunnen sturen naar de buitenwereld. Charlie is echter sceptisch over het idee. Ook Desmond ziet het niet zitten en hij probeert het plan te saboteren. Als Claire probeert te achterhalen waar de tegenstand van beide heren vandaan komt, herinnert ze zich enkele traumatische gebeurtenissen uit haar verleden.

Wanneer Kate en Locke aankomen bij het kamp van The Others, belooft Ben dat hij Locke het geheim van het eiland zal vertellen als hij stopt met zijn plannen. Kate's weerzien met Jack verloopt niet zo soepel wanneer ze erachter komt dat de anderen hem een deal hebben aangeboden.

Als de waarheid over haar ontvoering onder Sun's aandacht komt, begint Hurley het gedrag van Sawyer erg verdacht te vinden.

Kate en Juliet zijn gestrand in de jungle nadat Kate erachter is gekomen dat er een verrader onder hen is. Ondertussen kan een slechte houding van Sawyer hem duur komen te staan. Er gaan stemmen op om hem te verbannen van het strand, als hij zijn gedrag niet snel verandert.

De vreugde over de terugkeer van Jack is van korte duur als hij Juliet, een van The Others, aan de rest voorstelt. Ondertussen wordt Claire bedreigd door een vreemde ziekte.

Desmond overtuigt Hurley, Jin en Charlie ervan om met hem mee te gaan op een tocht door de jungle, nadat hij een reeks visioenen heeft gehad. Ondertussen trekt een wanhopige Kate meer naar Sawyer toe voor gezelschap als ze merkt dat Jack en Juliet het heel goed met elkaar kunnen vinden.

Sun laat Juliet haar onderzoeken wanneer ze erachter komt dat alle zwangere vrouwen van The Others hun zwangerschap niet hebben weten te overleven op het eiland. Ondertussen werkt Desmond samen met een onwaarschijnlijke vijand om een leven te redden.

Nadat hij The Others heeft verlaten neemt Locke Sawyer mee op pad door de jungle. Ze proberen samen een gemeenschappelijke vijand uit te schakelen. Ondertussen heeft Naomi cruciale informatie over vlucht 815.

Ben geeft informatie over het eiland aan Locke. Hij neemt hem mee op reis naar diverse locaties en brengt hem naar de mysterieuze Jacob.

Terwijl Jack een plan bedenkt om voor eens en voor altijd van The Others af te komen, ontdekt Sayid een fout in het systeem. Deze fout kan tot de redding van iedereen leiden. Maar Charlie moet hiervoor een zware en gevaarlijke taak op zich nemen. Eentje die Desmond's voorspelling uit kan laten komen.

De overlevenden bereiden zich voor op een invasie van The Others. Charlie en Desmond ontdekken de betekenis van het glazen luik.

De overlevenden bereiden zich voor op een invasie van The Others. Charlie en Desmond ontdekken de betekenis van het glazen luik.