Een van Gibbs boten wordt teruggevonden met twee vermoorde soldaten aan boord. Om een mogelijke internationale confrontatie te voorkomen, moet Gibbs noodgedwongen de betrokkenheid van zijn mentor Mike Franks onderzoeken.

Als eindelijk de identiteit van de Port-to-Port moordenaar bekend is, komt het hele NCIS-team in groot gevaar.

Gibbs en McGee reizen naar Afghanistan als een moord hen leidt naar een Afghaans vrouwenonderkomen waar Mike Franks zich jarenlang stiekem voor heeft ingezet.