ここは木ノ葉隠れの里。忍者学校（アカデミー）の落ちこぼれの少年・ナルトは、今日もイタズラばかり。そして、またしても卒業試験に落第してしまう。そんなある日、里の英雄である初代火影が残した封印の書をが盗まれるという事件が発生した。犯人はナルトだったが…。

木ノ葉の里の長・三代目火影の孫である木の葉丸が、中忍選抜試験の会場にあらわれた。忍者アカデミーの学級新聞で中忍試験の特集記事をまかされて、モエギ、ウドンとともに取材にやってきたのだ。ナルトを兄貴としたう木の葉丸が、ナルトたちへのインタビューをとおして、これまでの彼らの活躍をしょうかいする。

An event has come to Konoha and it's for all ninjas, Jounin to Genin. The winner get to make one rule that will be put into play in Konoha and Suna. But you must have your crystal at the end. Naruto wants to fight Kakashi-sensei but will he ever find him? And when he does will he get Kakashi's crystal? Who will win?

舞台は木ノ葉の里のとあるスタジオ。我らが主人公うずまきナルトとヒロイン春野サクラが司会のマイクを握り、いよいよ番組の収録が始まった。「レディースアンドジェントルメーン！今日は『ＮＡＲＵＴＯ』初の特別企画をお送りしちゃうぜえ！」ゲストを交えてお送りする忍達の名勝負の数々！しかし突然スタジオ内にベルの音が鳴り響く。受話器の向こうから聞こえたのは、最近出演ご無沙汰の気になるあの人の声だった――！！