“樱花庄”这栋学生宿舍，聚集了一堆水明艺术大学附属高中的问题学生。平凡的普通科二年级学生神田空太，因为厌倦了被一群怪胎包围的生活，决定要“脱离樱花庄！”。身为樱花庄舍监的美术老师-千石千寻把空太叫来，并交给他一张年约五岁的少女的照片，要他到车站去接人。空太到了车站，却看到一名怎么看都跟他年纪相仿的白皙少女，独自一人坐在长椅上……

樱花庄众人开会的结果，大家无视空太的推辞，让他负责照料连内裤都不能自己穿的少女椎名真白，也就是担任“负责照顾真白的人”。隔天，空太很快地着手照料真白；他因为错过了早餐，就到便利商店去买早餐。他们在那里遇到打完工的同班同学青山七海，便三个人一起上学。空太将真白介绍给七海认识，因为真白一句无心的话，七海误会两人的关系。

空太在得知真白的经历后，开始对自己是樱花庄里唯一一个一无所有的人这件事感到不安。空太原本想对樱花庄里的学长三鹰仁诉说自己的想法，却被三鹰回说他跟想回到普通宿舍的空太没关系，被一口拒绝。空太为了能实现“脱离樱花庄”的目标，开始认真替他养的猫找主人。之后，某个礼拜天，住在201号房的学姐上井草美咲跑来踢破空太的房门，还大声嚷嚷说真白跟仁要去宾馆约会。空太跟美咲担心他们两个，便开始跟踪……

因为猫的饲主也逐渐确定了，空太于是准备要搬出樱花庄。这个时候，美咲和真白穿着浴衣出现，要在樱花庄的中庭进行七夕活动。大家将各自的愿望写在许愿签上。真白不知道要写些什么，空太便建议她写赢得新人奖。然而，真白却说她要靠自己的力量得奖，不需要许愿。就在这时候，真白的手机响了，新人奖结果即将揭晓……

真白考试得零分，需要补考。明天就要考试了，真白却什么都没准备。千寻把她这个烫手山芋整个丢给空太，而美咲这时却又突然举办游戏大赛。隔天，真白与空太揉着惺忪的睡眼迎接补考的到来……回家路上，空太帮助因为突然站立而晕眩快倒下的七海。他建议为了自己赚生活费而努力打工的七海搬到房租很便宜的樱花庄……

接手照顾真白的七海，不但要照料什么都不会的真白，还要打工、轮流准备樱花庄的餐点，以及为了训练班的期中发表会练习，一直做得面面俱到。空太担心七海，想要找仁商量，却在偶然的机会下，知道仁的秘密！仁希望空太能对美咲保守秘密。过没多久，美咲却因为仁的事情跑来找空太商量，让他措手不及。在这期间，七海的期中发表会到来了，她却因为连日积劳，弄坏身体……

空太的妹妹优子突然出现在樱花庄。最喜欢哥哥的优子，偶然在玄关目击了空太被裸体的真白压倒在地，不由得僵住。自此以后，她对真白就有着明显的敌意，而真白看到优子与空太之间的亲密互动，也对她燃起敌意。后来连七海和女仆都出现了，樱花庄大事不妙！另一方面，美咲为了考取驾照，在驾训班做出一连串的驾车动作！

有一天，空太收到两封信。一封是“一起做游戏吧”选考委员寄来的。另一封则是只写着“教我恋爱”的谜样信件。空太对此摸不着头绪，之后真白出现，空太于是得知决定真白新漫画连载的会议与他“一起做游戏吧”的简报在同一天。空太勉励她要彼此加油，他找樱花庄的人当对象不断地练习简报。然后，简报的那一天终于来临！

空太一早睁开眼睛，就看到真白与美咲在他房里的一面墙上作画。美咲滔滔不绝地解释这幅画是她从幼儿园就开始构思的长篇动画“银河猫喵波隆”的设定图，而真白则默默地在一旁继续画。因为这样，空太第二学期第一天上学就差点迟到，而等着他的是，一群对他和七海的关系捕风捉影的同班同学。当天晚上在樱花庄的饭厅，七海呼吁大家要注意平常的行为，但众人却回答得很敷衍。这个时候，突然出现了一名金发的美少女……

樱花庄的人开始制作校庆节目“喵波隆”。空太担任导演，但分镜图却完全没有进展。几天后，进度开始慢慢落后，这时学生会却说他们要提出企划内容以及简报才能参加校庆。空太为了弥补落后的进度，决定增加人手。就现状来看，真白在英国的前室友丽塔是最合适的人选，空太于是打算游说她……

校庆开始了，“喵波隆”的制作也渐入佳境，连日熬夜的空太眼神空洞。美咲见状，想用视觉冲击让空太清醒，便往穿猫娘装的真白所在的美术科作品展移动。空太将这装扮妄想成猫娘版的兔女郎，而他最后看到的会是！？另一方面，龙之介和丽塔独自在樱花庄进行作业。比起校庆，丽塔对龙之介更感兴趣。她在女仆的骂声中，仰望地慢慢向龙之介逼近！！

《银河猫喵波隆》上演的日子终于来了。空太看到一堆人在放映厅前面等着而畏缩。仁硬是要学生会长馆林维持现场秩序，自己则往会场移动。千寻和游戏制作人藤泽和希出现在关系者席位。而七海独自在舞台侧面一直练习到最后一刻。观众都进来后，美咲命令大家集合。他们全体人员手叠着手围成一圈，自我激励。接着，舞台的布幕终于要升起了！

空太他们午休在顶楼上吃便当时，美咲带著她亲手为仁做的便当出现。大家看到里面的文字都很震撼。在这当中，只有真白不知为何一直盯着便当看。当天傍晚，七海从仁那里得到两张在圣诞夜公演的舞台剧门票，开始烦恼不知道要邀谁……之后某一天，空太在房里换衣服，真白却不知何时站在后面。空太生气地要真白敲门，她却径自告诉空太说她“想做便当”。

真白默不吭声地将年轮蛋糕放在空太房前。空太对这样的真白感到很烦躁，几乎都没跟她说话。而七海和这样的空太圣诞夜要去看舞台剧，她被朋友点出这就是在约会，瞬间紧张起来，烦恼当天的服装。仁离开樱花庄，在图书馆为大阪的艺术大学的考试做准备。美咲决定要在圣诞夜对仁告白，为此十分紧张。他们各自怀着心事，迎接圣诞节……

因为千寻要去澳洲度假，众人寒假期间不能留在樱花庄。空太于是带着无法回老家的七海，不想回去的美咲，以及没打算回家的真白，搭乘新干线回福冈老家。在那里等着他们的是，事先未被告知女孩子会来访，因而很震惊的优子、觉得好玩而将她蒙在鼓里的罪魁祸首妈妈，还有大声地说“我不记得我有承认一夫多妻制喔！”的爸爸……

空太终于迎接简报当天的到来。空太不想再经历先前失败时的那种感觉，鼓足了干劲。空太热切地回应真白的鼓励，但千寻却叫他不要加油。放学后，空太带着干劲十足又夹杂紧张不安的心情前去简报。途中，他受到七海的简讯鼓舞。在冬天灰暗的天空下，到达游戏公司的空太，即将迎战简报的时刻！

是情人节同时也是七海要甄选的那天早上，空太目送紧张的七海出门，看到振奋精神独自准备好要外出的真白而吃了一惊。这时候，丽塔突然上门，匆忙打声招呼后就赶紧拿巧克力给龙之介。在学校，美咲等者要将亲手做的巧克力交给仁。后来空太收到真白的简讯，放学后满心期待地往顶楼移动。但是他在知道七海面临大危机后，赶紧跑去帮她。

空太结束了与和希针对主题审查会所做的讨论。之后，他打算和七海去看优子的考试放榜；真白说优子的考试结果攸关她日後的计划，所以也跟去。真白看他们两个人感情很好，径自生闷气；一行人到了学校后，得知仁来报告考试的消息。他们因为不想看到仁与美咲就这样擦身而过地毕业，为了拉近两人的距离，各自跑到仁与美咲的身边！

仁和美咲终于和好了，但是千寻却告诉他们樱花庄将要被拆除。空太偶然在房间里发现了刚搬进来时拍的照片，于是就回忆起了刚来时的“遭遇”以及美咲准备的新人欢迎会，不过这一切都已经成了美好的回忆。于是，大家鼓起勇气，准备阻止拆除樱花庄！

龙之介成功侵入了学校的服务器，知道了拆除樱花庄的真正原因，而其他人则为了集齐全校2/3学生的签字（这样就可以阻止樱花庄被拆）而努力着，但是比想象的要困难许多，龙之介又把联名活动放在了学校的主页上……

大家都一如既往地努力着，直到毕业典礼的前一天——也是最后一天，下起了雨。空太陪因为再次落选而伤心过度的七海去了保健室，而这时他也接到了没有通过的电话。在保健室空太不知不觉地睡着了，因而错过了最后一次和大家一起争取学生签字的机会，签字的人数还是不够。这时真白决定要自己来保护樱花庄……

到了毕业典礼这一天早上，真白却不见了踪影。等他们找到学校，真白在美术室里只留了一幅画。空太在车站找到了真白，原来真白想以自己离开来保护樱花庄。在空太和七海的劝说下，真白终于选择留下来。这时龙之介和刚从英国回来的丽塔也赶到了，大家一起奔向学校参加毕业典礼……

在毕业典礼上，毕业生代表被前学生会长馆林他们换成美咲。美咲总结了这几年在樱花庄经历的苦辣酸甜，最后向大家说出了樱花庄将要被拆的危机，含泪恳求大家帮忙，美咲恳切的语言博得了同学们的同情。校长让老师把美咲拉下来，这时空太夺过话筒，说出了对美咲的感谢……就在会场完全站在学生这边时，千寻、馆林、仁让校长被迫撤回拆除樱花庄的决定。樱花庄的危机就这样解决了，可是樱花庄的这些人却要到外边罚站……