Le chef de l'organisation d'espionnage criminel P.A.N.D.R.A est emprisonné dans la prison pour espions, Deadlock. Il y rencontre un homme aux yeux d'une couleur inhabituelle qui attire son attention, Andy Hinomiya.

Alors qu'Andy commence à se familiariser avec le P.A.N.D.R.A, il se voit confier sa première mission : assassiner un chef de la mafia.

Hyobu Kyosuke a ordonné le retour de la Catastrophe au Japon où ils ont reçu un accueil chaleureux de la part de vieux amis.

Comme la catastrophe est en cours de réparation après leur affrontement avec les Enfants, Andy est chargé par les Rois Mages, Momiji et Yoh d'accompagner Yūgiri lorsqu'ils sont rappelés. L'équipage profite de son temps libre pour faire du shopping. Andy offre à Yugiri une gâterie spéciale, mais celle-ci est écourtée lorsqu'il reçoit la visite de B.A.B.E.L avec des informations importantes.

Non seulement le secret de la catastrophe est révélé, mais l'agenda caché d'Andy l'est aussi. A-t-il le pouvoir de s'opposer au major ?

Après la mort de son père, le baron Tsubomi a accueilli Kyosuke et l'a élevé avec sa fille Fujuko, une utilisatrice sensorielle. Avec d'autres utilisateurs sensoriels, ils ont contribué à la création de la première unité ESP spéciale du Japon.

Kyosuke a été choisi pour représenter l'unité E.S.P dans les jeux de guerre de la marine. L'avenir de l'unité repose sur ses épaules.

Le gouvernement américain a donné le coup d'envoi d'un assaut complet contre la catastrophe, mais leurs véritables intentions sont inconnues même de leur espion ; l'histoire va se répéter.

D'anciens ennemis, que l'on croyait disparus depuis longtemps, ont été démasqués alors que le cerveau des plans pour couler la Catastrophe s'empare de Yugiri. Cette nouvelle information ravive le feu de Kyosuke qui se secoue de la mort pour se venger.

New York a un nouveau maire qui soutient les relations avec les esper, en même temps Hyobu et Andy travaillent dans les installations de l'USEI pour découvrir...

Le plan Saotome se concrétise enfin et sans personne assez puissante pour l'arrêter, le monde sera sauvé de Hyobu Kyoskue.