Kira Nerys et Miles O'Brien partent en mission pour Cardassia IV pour rammener un ancien héros Bajoran, Li Nalas, retenu prisonnier, car lui seul pourra apporter la paix sur Bajor entre les factions politiques et religieuses. Ces mêmes factions ne cessent de semer de plus en plus le trouble sur la station.

Li Nalas est nommé officier de liaison sur la station et Kira Nerys revenue à la vie civile, passe du temps sur Bajoran en compagnie de Vedek Bareil celui qui selon toute probabilité doit devenir le prochain Kai. Sur la station, Odo est prévenu par Quark qu'un coup d'État mené par « le cercle » se prépare sur Bajor. Sisko décide de s'y rendre. Le Ministre Jaroh chef de la rebélion, quant à lui s'associe avec Vedek Winn qui souhaite par-dessus tout devenir la prochaine Kai.

Le commander Benjamin Sisko se prépare à faire évacuer la station à la suite de la guerre civile qui menace sur Bajor et à la suite des ordres de Starfleet, mais celui-ci a aussi un autre plan, sachant que les Cardassiens alimentent "le Cercle" en armes et que ce même "Cercle" est au commande du Ministre Jaroh qui déteste les Cardassiens. L'armée régulière de Bajor ignorant les intrigues politiciennes et aux commandes du Ministre Jaroh envahissent la station sabotée. Pendant ce temps, Jadzia Dax et Kira Nerys (qui a rejoint de nouveau la Fédération), tentent d'apporter les preuves impliquant les Cardassiens et la trahison du Ministre Jaroh au gouvernement provisoire.