Ryuko Matoi est une écolière vagabonde voyageant d'un endroit à l'autre à la recherche d'indices sur la vérité derrière la mort de son père. Le voyage mène Ryuko à l'Académie Honnouji.

Affaiblie par son combat, Ryuko fuit l'Académie Honnouji avant de s'effondrer dans la rue. Sauvée, elle reçoit de la nourriture et un abri pour la nuit, et à son retour à l'Académie, elle affronte Omiko Hakodate, la capitaine du club de tennis, pour lui rendre la pareille.

Ayant tenu sa part du marché, Ryuko demande des réponses à son professeur principal, Aikuro Mikisugi, et apprend le secret du pouvoir de Senketsu et des uniformes Goku.

Les sirènes réveillent les étudiants No-Star pour le début de "No-Late Day", où être en retard vous fera expulser de l'Académie Honnouji. Avec Senketsu dans le bain, Ryuko doit se battre seule pour passer à travers les pièges du comité de discipline et arriver à l'heure.

Un homme mystérieux arrive à l'Académie Honnouji et se révèle rapidement plus que capable de se battre contre un uniforme Goku deux étoiles. Mais quand il jettera son dévolu sur Ryuko, qui restera debout ?

Accablée par les événements récents, Ryuko demande des réponses à son professeur principal, Aikuro Mikisugi. Pendant ce temps, Uzu Sanageyama, président du comité des sports de l'académie Honnouji et membre de l'Elite Four, fait sa propre demande... de défier Ryuko en duel !

Mako se voit offrir une vie meilleure loin de la pauvreté. Pour ce faire, elle doit affronter Ryuko au combat.

Satsuki Kiryuin révèle son plan pour rétablir l'ordre à l'Académie Honnouji, un chacun pour soi dont les survivants pourront retrouver leurs uniformes Goku.

Le dernier tour de l'élection des Naturals de l'Académie Honnouji est sur le point de commencer et les Elite Four veulent tous être les premiers à combattre Ryuko. Son professeur principal, Aikuro Mikisugi, se demande si elle pourra survivre à un combat, sans parler des quatre !

La deuxième bataille contre les Elite Four commence ! Comment Ryuko va-t-il vaincre Houka Inumuta, qui utilise les données qu'il a collectées pour prédire chacun de ses mouvements ? En regardant l'action, Mako et sa famille font face à quelques surprises !

La bataille de Ryuko contre les Elite Four prend son envol ! Pendant ce temps, plus de spectateurs convergent vers Honnouji Academy. Mais qui est la mystérieuse fille qui se promène dans la ville et quels secrets détient-elle ?

Ryuko se retrouve face à face avec l'assassin de son père, mais peut-elle contenir sa rage ? Mako et les Elite Four la regardent se déchaîner, se rapprochant de plus en plus de la mort. Satsuki ou quelqu'un d'autre pourra-t-il l'arrêter ?

L'Académie Honnouji se mobilise pour le Raid des écoles de Tri-City ! Mais après son récent déchaînement, Ryuko se morfond dans son lit, ne voulant pas se battre. Cependant, Shinjiro Nagita, anciennement membre du Newspaper Club, est déterminé à lui remettre son uniforme !

Le raid des écoles de Tri-City a commencé ! Mais quel rôle Ryuko pourra-t-il jouer, avec Senketsu aux mains de l'ennemi ?

Satsuki Kiryuin rejoint la ligne de front d'Osaka pour combattre Kaneo Takarada, l'héritier du conglomérat Takarada.

Le victoire du raid des écoles de Tri-City revient à l'Académie Honnouji. Ryuko commence à découvrir la vérité sur la série d'événements qui l'ont rapprochée de Senketsu.

Les préparatifs sont en cours pour le Grand Festival Culturel et Sportif de l'Académie Honnouji !

Le Grand Festival culturel et sportif de l'Académie Honnouji arrive à une conclusion abrupte et très inattendue !

Une révélation surprenante bouleverse le monde de Ryuko !

Ryuko est réveillée et elle n'est pas contente. Dans l'intention de tuer Ragyo et Nui, elle part, laissant ses alliés derrière elle.

La fureur de Ryuko continue, et grâce à Ragyo et Nui, elle a un nouvel allié inattendu. Avec Satsuki comme cible, les Elite Four et Nudist Beach pourront-ils résister à l'assaut ?

Les événements prennent Nui Harime au dépourvu.

La bataille en cours se dirige vers l'Académie Honnouji, mais Ragyo et l'Original Life Fiber font obstacle.

L'affrontement final est proche ! Ragyo et Nui provoqueront-ils la fin du monde, ou Ryuko et les autres pourront-ils les arrêter ?