Shintaro est un adolescent reclus tous les jours chez lui. Il parle avec un programme informatique appelé Ene, matérialisé sous forme de fille, et va devoir aller à l'extérieur se procurer un nouveau clavier, avant de finir séquestré au centre commercial par des terroristes. Il va rencontrer parmi les otages des personnes étranges.

Momo Kisaragi est une lycéenne qui attire sans cesse l'attention une fois dans la rue du fait de sa célébrité. Cela l'empêche de mener une scolarité saine et de se faire des amis, car cette attention ne semble pas naturelle. Afin d'acheter un strap qu'elle aime, elle décide de sortir légèrement cachée par sa capuche et fait la rencontre de Hibiya.

Momo fait la rencontre de Kido, membre et chef du gang Mekakushi. Elle va être embarquée malgré elle dans leur QG et y faire la rencontre de Seto, Kano et Marry. Les membres semblent tous avoir un pouvoir particulier lié à leurs yeux. Ils décident de se rendre au même centre commercial que Shintaro et se retrouvent eux aussi pris au piège dans l'attaque terroriste.

Hibiya est interloqué par sa rencontre avec Momo, qu'il finit par reconnaître après un de ses passages à la télé. Il passe ses vacances d'été aux côtés de Hiyori, une amie pour laquelle il a le béguin, mais qui ne lui rend pas vraiment la pareille. Hibiya cherche à parler avec elle de ses rêves étranges où il tente désespérément de la sauver.

C'est au tour de Shintaro de se faire intégrer au sein du gang Mekakushi et de connaître chacun des membres. Malgré la présence de sa sœur, il ne leur fait pas confiance et part en ville sur un coup de tête, où il va faire la rencontre de Konoha. Pendant ce temps-là, les autres membres du Mekakushi vont faire la connaissance du membre fondateur du groupe.

Haruka est malade, Takane s'en veut. Deux ans plus tard, elle raconte devant la tombe d'Ayano comment elle est devenue Ene et ce qu'elle essaie d'accomplir avec Shintaro.

Suite à l'incident auquel il a assisté, Shintaro décide de retourner voir les Mekakushi pour en savoir plus. Les membres discutent des origines de leurs pouvoirs respectifs et essaient de comprendre ce qui a fait disparaître Hiyori, l'amie de Hibiya.

Retour dans le passé : on voit comment Ayano s'occupait de ses trois frères et sœur adoptifs, Kido, Seto et Kano. Ces derniers étaient bien accueillis par Ayano malgré leurs pouvoirs… Qu'en était-il des parents ?

Azami, le monstre de la légende, attend en compagnie de sa fille Shion le retour de Tsukihiko, son mari. Mais les villageois des alentours ne semblent pas prêts à accepter leur existence.

Momo et Kido poursuivent Hibiya et essaient de le raisonner en l'intégrant au groupe. Kano, de son côté, continue de penser à sa défunte sœur, aux événements du passé et aux objectifs du serpent possédant son père.

Tous les membres du gang Mekakushi sont rassemblés et se serrent les coudes pour sortir de l'immeuble. Mais il semblerait que le sort les conduise jusqu'au professeur Tateyama, et que la même tragédie va de nouveau clore cette histoire.