평범한 중학생 츠구미는 어느 날 갑자기 무기로 변신하게 된다.

그로 인해 사무전으로 전학을 가게 된 츠구미는 같은 신입생 메메와 아냐를 만난다.

오리엔테이션이 끝나고 파트너를 정하려는데 불량한 동급생이 메메를 노리고 치근덕댄다.

그런 동급생을 말리지 못하고 돌아가려던 츠구미는 이래선 안 되겠다고 생각하고 마음을 다잡고 메메를 보호하고, 아냐 역시 불의에 맞서 나서게 된다.

스스로 변신을 못하는 츠구미는 과연 어떻게 될까?

츠구미와 메메, 아냐는 같은 여자 기숙사에 살게 됐다. 이터널 페더 선배 말로는 기숙사에 마녀가 산다고 한다. 잔뜩 긴장한 츠구미는 그날 밤, 츠구미를 메리로 만들려는 사감에게 습격을 당하고, 위기의 순간에 킴 딜이 나타나 구해준다. 다음 날 아침에 츠구미는 킴 딜에게 감사 인사를 전하지만, 그 자리에서 일주일 치 용돈을 빼앗기고 만다. 게다가 아냐는 시장에서 돈을 다 써버리고, 메메는 용돈을 잃어버리는데…

여자 기숙사의 마녀는 킴 딜이었다. 이터널 페더는 츠구미가 용돈을 갈취당할 때 도와주지 못해서 미안해 한다. 사무전 생활도 안정이 되지만, 무기인 츠구미를 사이에 두고 장인인 아냐와 메메는 여전히 약간의 신경전을 벌인다. 츠구미와 같이 수업을 받지 못한 아냐는 울적한 마음에 먼저 돌아가다가 트레이터를 만난다. 무기 없이 싸우다가 위험에 처했을 때 메메와 츠구미가 나타나지만, 무기로 변신하지 못하는 츠구미로 인해 다시 위험에 빠지는데…

트레이터를 만나고 자신의 진로를 고민하는 츠구미. 원해서 사무전에 들어온 게 아니라는 생각에 낫 클래스에 있지만, 무서운 일을 겪고 모두에게 도움이 안 된다는 것을 알고 고민에 빠진다. 다른 친구들의 이야기를 듣고 자신의 목표를 찾고자 하지만, 큰 도움이 되지 않는다. 그러는 중에 체력 측정일이 오고, 모두들 열심히 자신을 갈고 닦으며 실력을 키웠다는 것을 깨닫는다. 그리고 츠구미도 앞으로 목표를 정할 때를 위해서 열심히 노력하고자 다짐한다.

킴에게 마음이 있는 재클린을 돕기 위해 츠구미 일행이 나선다. 킴이 좋아하는 음식으로 유혹하거나, 재클린의 머릿결을 이용해서 대화를 유도하지만 쉽지 않다. 그러는 중에 킴의 정보를 입수하여 확인한 생일은 4월 31일.기숙사 학생들에게 물어도 정확한 정보를 알 수 없다. 킴이 일부러 자신을 숨긴다는 걸 깨달은 재클린은 조사하는 것을 그만두고 킴을 찾으러 간다. 그곳에서 다친 강아지를 치료하는 킴을 발견하고 킴이 마녀라는 사실을 안다.

데스 벅스 카페에 새로 아르바이트 직원이 들어왔다. 보호 관찰 중인 톰슨 자매는 태도가 매우 불량해서 츠구미 일행은 겁을 먹고 만다. 톰슨 자매는 어릴 적에 버려져서 살기 위해 악행을 저질렀다. 그런 자매를 거둔 것이 사무전이고 보호 관찰 중이었던 것이다. 무기인 톰슨 자매와 동질감을 느낀 츠구미는 매일 카페에 간다. 그녀들과 친해지기 위한 츠구미의 노력은 과연 통할까?

데스 시티에 바자회가 열려서 츠구미 일행도 구경하러 간다. 거기에는 이터널 페더도 나와서 옷을 팔고 있었지만, 킴에게 속아서 산 이상한 옷은 팔리지 않는다. 어쩔 수 없이 이터널 페더는 장사를 접으려는데, 맞은 편에 샤우란이 파는 액세서리를 사면서 암시에 걸린다. 한편 책을 파는 마카와 만난 츠구미는 마카에게 책도 선물 받는다. 기쁜 마음에 선물 받은 책을 들고 광장으로 나오는데 이터널 페더가 난동을 부리는 장면을 목격하는데…

슈타인 박사 덕분에 목숨을 건진 이터널 페더. 하지만 그녀는 자신이 저지른 일을 전혀 기억하지 못한다. 시간이 흘러서 한여름이 되고 이터널 페더도 퇴원하고 기숙사로 돌아오게 된다. 아직도 파트너를 정하지 못하는 츠구미. 그런 츠구미에게 아냐와 메메는 파트너를 정하지 않는 이유를 묻는다. 그리고 사무제가 열리는 핼러윈까지 파트너를 정하기로 약속한다.

* 열대야! : 열대야로 잠을 못 이루는 츠구미 일행의 일상을 담았다. * 망각! : 이상한 모습으로 나타난 메메, 잊어버린 기억을 찾으러 거리에 나선다. * 3인 야구! : 우연히 놓여 있는 배트와 공과 글로브로 츠구미 일행은 야구를 한다. * 데스 시티에서 사랑을 담아... : 집에 편지를 보내는 츠구미, 메메는 잊었다고 했지만, 잠든 채로 전서 박쥐를 보내는 것을 목격한다. 한편 시드와 아카네 일행은 마녀의 행방을 찾으려고 노력하지만, 쉽지 않다. 그러는 중에 사무전 비밀 서류가 도난당하는 것을 확인한다.

시드가 죽고 메메는 행방불명, 아냐는 귀국길에 오르고, 츠구미도 기숙사에서 외출 금지 명령을 받는다. 하지만 츠구미는 톰슨 자매에게 부탁해서 아냐를 쫓아가고, 아냐도 이대로 귀국할 수 없다고 버틴다. 결국 다시 만난 츠구미와 아냐는 슈타인 박사가 만든 해독제를 들고 샤우라와 함께 있는 메메를 구하러 간다.

메메를 찾아 해독제를 먹이기 위해 고군분투하는 츠구미와 아냐. 결국 해독제를 먹였지만, 정신 지배에서 벗어나지 못한 메메는 츠구미를 공격한다. 하지만 메메의 공격에도 진심으로 다가가는 츠구미 덕분에 메메의 정신 지배도 풀리게 된다. 그리고 셋은 이제 마녀 샤우라를 찾으러 가는데...