Le chef de l'équipe Quinx, Kuki Urie, et son sous-fifre Ginshi Shirazu, surveillent Tokyo à la recherche du cannibal Torso, qui mange uniquement le torse de ses victimes.

Quand Sasaki enlève le masque d'Orochi pendant leur combat, il est surpris de découvrir son véritable visage, lequel fait vaciller ses souvenirs et le rend fou. Pendant ce temps, Torso rencontre le lapin pour devenir membre d'Aogiri Tree.

Kanae apporte à Shu Tsukiyama les sous-vêtements que Chie Hori avait recueillis chez Haise Sasaki. Pendant ce temps-là, l'escouade Quinx poursuit son enquête sur Nutcracker et se déguise pour rentrer dans une boîte de nuit où elle avait été vue.

Enlevée et proposée à l'achat lors d'une vente aux enchères, Toru est vendue à la Big Madam. Cependant, Suzuya lance une attaque contre la vente.

Takizawa, désormais devenu une goule borgne fou, massacre une escouade entière d'agents de la CCG, tandis qu'une autre escouade est tuée par Nutcracker. Pendant ce temps, Sasaki et les Quinx Squad affrontent Kanae, qui se blâme pour l'état de Tsukiyama.

Sasaki souffre de multiples hallucinations à propos de Ken Kaneki, tandis que Takizawa le bat dans la salle des ventes. Big Madam, elle, combat à la fois Urie, qui devient presque fou, et Mutsuki, qui libère son kagune.

Hinami est arrêtée par des agents de la CCG dirigés par Kisho Arima. Sasaki, ayant survécu à sa rencontre avec Takizawa, tente de la sauver de l'exécution en réclamant à ce qu'elle soit mise en détention.

Tsukiyama ne parvient toujours à contrôler sa faim, ni son kagune. Tatara refuse la demande d'Ayato de sauver Hinami de Cochlea et Sasaki est approché par les enquêteurs Nimura Furuta et Shiki Kijima concernant l'enquête Rose.

Tsukiyama souhaite voir Sasaki retrouver ses souvenirs. Sasaki, lui, se rend à la boutique d'Uta et commande des masques pour toute la Quinx Squad, afin de se faire passer pour des goules pour l'enquête Rose.

Kanae se retrouve face à face avec Eto qui l'attaque ensuite avec toute sa puissance. Le même soir, Sasaki enfile le masque de Kaneki et commence une patrouille avec l'escouade Quinx, où il est reconnu par certaines goules. Il est de nouveau assailli d'hallucinations.

Tsukiyama, prêt à s'enfuir, se retrouve sur le toit face à face avec Sasaki. Pendant ce temps, Kanae est devenue folle et attaque les enquêteurs de la CCG.

Alors que la bataille se poursuit, Sasaki est attaqué par Eto, qui lui révèle sa véritable identité.

Le CCG localise le quartier général d'Aogiri Tree. L'exécution de Hinami est prévue. Le rédacteur en chef de Takatsuki est interrogé sur le fait qu'elle soit ou non une goule. Cependant, avant que Takatsuki puisse être interrogée, elle fait une annonce publique stupéfiante.

Ayato dirige un raid sur Cochlea pour sauver Hinami, il est rejoint par Touka et Yomo. Haise essaie de mettre Hinami en sécurité, mais se heurte à Furuta. Alors que les autres s'enfuient par le sous-sol, Haise affronte Arima.

L'attaque de la CCG contre Aogiri sur l'île Rushima se poursuit et Urie et Saiko sont impatients de sauver Mutsuki. Tatara et Kurona prennent position contre les enquêteurs. Akira reçoit de l'aide d'une source inattendue.

Alors que les combats sur Rushima atteignent leur paroxysme, Akira prend une décision fatidique. Urie, avec les nouveaux membres de l'escouade Quinx, poursuivent leur recherche de Mutsuki. Arima fait une révélation surprenante à Kaneki.

Kaneki rassemble les autres membres d'Aogiri Tree et d'Anteiku pour annoncer la création d'une nouvelle organisation de goule. Le traitement d'Akira prend une tournure inattendue. Yomo et Touka essaient tous deux de faire la paix avec leur passé.

Les enquêteurs du CCG qui étaient proches de Haise ont réagi à son départ. Furuta prend la tête du CCG et propose une nouvelle stratégie pour faire face aux goules. Les Clowns commencent à se déchaîner, menaçant le quartier général du CCG.

Sous Furuta, le CCG réprime durement contre la communauté des goules, forçant Goat à passer sous terre. Takeomi et Yoriko ont fixé une date de mariage. Mutsuki localise Kaneki et l'invite à revenir. Touka passe à l'étape suivante avec Kaneki.

Mutsuki mène les Oggais dans le repaire souterrain de Goat. Urie et Kuroiwa affrontent Furuta dans son bureau au sujet de sa capacité à diriger. Kaneki et Suzuya se font face au combat. Kaneki se donne beaucoup de mal pour protéger Touka.

Alors que le Dr Kanou visite la tombe de sa famille, Kurona l'affronte. La CCG acquiert un nouvel allié et expert sur les goules. Hide sollicite l'aide d'Akira et d'Amon pour plaider sa cause devant le CCG. Un Mutsuki découragé s'en prend à Saiko et Urie.

Kaneki entretient un dialogue intérieur avec Rize, tout en sommeillant dans son kagune. Urie parle à Mutsuki des difficultés d'y aller seul. Une crise met la ville en état d'alerte, forçant la CCG et les goules à travailler ensemble.

Suite à l'augmentation de l'activité des dragons et à la découverte d'un deuxième noyau, Kaneki et Ayato se portent volontaires pour s'en occuper. Lorsque Kaiko et les membres de V lancent une attaque, la CCG et les goules doivent se battre ensemble pour les arrêter.

Kaneki et Furuta poursuivent leur duel sous les rues de Tokyo, alors que la CCG et Goat continuent de combattre ensemble les membres de V en surface. Kaneki s'adapte aux événements des dernières années.