W czasach Świętej Wojny w XVIII-wiecznej europejskiej wiosce żyje dwóch przyjaciół, Tenma i Alone. Ich świat staje na głowie, gdy Alone spotyka Pandorę.

Złoci Rycerze spotykają się z Ateną w jej Sanktuarium, by przygotować się do nowej Świętej Wojny przeciwko Widmom Podziemia. Tenma rozpoczyna szkolenie.

Tenma i inni Rycerze wyruszają do wioski we Włoszech w poszukiwaniu Widm Podziemia. Tenma martwi się o Alone.

Sasha dowiaduje się, że Tenma nie żyje, a jej brat jest kolejną inkarnacją Hadesa. Jednak powstrzymuje łzy i z determinacją zmierza do celu.

Jeden z najpotężniejszych Widm, Gryf Minos, wykorzystuje sytuację, by zaatakować niedostępne Sanktuarium. Albafica staje twarzą w twarz z Widmem Niobe.

Albafica zostaje pokonany. Minos niszczy wioskę w pobliżu Sanktuarium, którą Albafica próbował chronić.

Tenma, Yato i Yuzuriha dowiadują się, że nieśmiertelne Widma można pokonać za pomocą owocu z drzewa Złotego Deszczu.

Tenma odpiera atak Asmity. Drzewo Złotego Deszczu nagle reaguje na energię kosmiczną Tenmy i zaczyna wydawać owoce.

Aldebaran, Złoty Rycerz Byka, wykorzystuje swoją olbrzymią siłę, by pokonać widma próbujące dostać się do Sanktuarium. Wtedy na scenę wkracza Bennu Kagaho.

Aldebaran odpiera atak Kagaho znany jako „Podmuch Korony”. Atak jest tak silny, że wywołuje trzęsienie ziemi.

Legenda głosi, że obraz, który zakrywa niebo — „Zaginione Płótno” — zabije wszystkich ludzi. Tenma uświadamia sobie, że cichy Alone chce zniszczyć ludzkość.

Tenma odchodzi, aby prowadzić walkę samodzielnie. Teraz już wie, że widma nie spoczną, dopóki nie zobaczą go martwego, a nie chce, by ginęli dla niego kolejni rycerze.

Pandora zamyka Alone w studio, by skończył malować „Zaginione Płótno”, dzięki któremu powstanie Król Hades.

Po wejściu do Lasu Śmierci Yuzuriha zostaje oddzielony od reszty. Yato zostaje zaatakowany przez gigantycznego owada.

Tenma, Yato i Yuzuriha zostają otoczeni przez zombie Veroniki. Ratuje ich Manigoldo, który przekazuje rozkaz Mędrca, by chronić Tenmę.

Manigoldo znajduje kryjówkę bliźniaków, jednak jest bezsilny wobec mocy Tanatosa, boga śmierci. Z pomocą przychodzi mu Mędrzec.

Manigoldo rani Tanatosa, przez co ten wreszcie zaczyna traktować sprawę na poważnie. Mędrzec nie waha się jednak nawet, gdy sytuacja robi się bardzo trudna.

Hypnos zwołuje czterech bogów, którzy kontrolują sny. Jeden z nich, Icelus, zjawia się w Domu Strzelca, co pozwala mu uniknąć walki z El Cidem, Rycerzem Koziorożca.

Gdy Tenma, Yuzuriha i Yato zbliżają się do zamku Hadesa, otacza ich gęsta mgła. Nagle Tenma zostaje przeniesiony do miasta, w którym dorastał.

Fantasos, jeden z czterech bogów, upada, więc teraz El Cid musi zmierzyć się z Icelusem. Tymczasem wyzwaniem dla Tenmy jest jego własny sen.

Tenma i El Cid podejmują beznadziejną walką z Oneirosem i trzema pozostałymi bogami. Atena pojawia się w Świecie Snów, aby uratować Syzyfa.

Atena wkracza do snu Syzyfa, gdzie ten zmaga się z poczuciem winy wywołanym rozdzieleniem Tenmy i Alone’a.

Przygotowana przez Hypnosa Osłona Snu zostaje zniszczona. Teraz siły Wojowników Sanktuarium mogą rozpocząć atak na zamek Hadesa.

Hakurei samodzielnie wkracza do zamku Hadesa, dzierżąc w dłoni miecz nasączony krwią Ateny. To początek końca wszystkich widm.

Hakurei z pomocą dusz swoich poległych towarzyszy próbuje zapieczętować Hypnosa. W czasie ataku zjawia się Król Hades.