Malgré les récents contretemps, Shirō décide de poursuivre son combat pour le Saint Graal. Rin suggère de nouer une alliance exceptionnelle avec Illyasviel.

Le groupe de Shirō se prépare à se battre contre Shinji. Une lutte à mort s'ensuit et l'identité du Servant de Shinji est enfin dévoilée.

Archer et Saber dévoilent leur passé. Qui a le mieux réussi à atteindre ses objectifs ? Archer souligne les similarités entre ses motivations et celles de Shirō.

Shirō est sur le point de perdre son combat contre Archer, mais tous deux sont hantés par des souvenirs, dont Shirō espère qu'ils joueront en sa faveur.

Rin et Shirō veulent détruire le Saint Graal dans le temple Ryūdō. Pendant ce temps, Saber s'engage dans une violente bataille contre le gardien du temple.

Tous les combattants restants s'affrontent lors d'une ultime bataille à mort qui décidera du sort du Saint Graal. Qui en sortira gagnant ?