Neu in der Oberstufe trifft Nagisa seine ehemaligen Teammitglieder aus dem Schwimmclub wieder: Haruka und Makoto. Gemeinsam wollen sie die Zeitkapsel auf dem Gelände ihres alten Schwimmclubs ausgraben und werden dabei von dem vierten damaligen Mitglied, Rin, überrascht, der nach der Grundschule ins Ausland gegangen war.

Es kommt zum Wettkampf Haruka gegen Rin. Dieser hat sich während seiner Zeit im Ausland offenbar sehr verändert und scheint an der alten Freundschaft nicht mehr interessiert zu sein

Der Iwatobi Swim Club hält ein Trainingscamp ab. Da Rei als neues Mitglied das Gefühl hat, nicht mithalten zu können, will er nachts im Meer trainieren.

Die Mitglieder des Iwatobi Swim Clubs überdenken jeder für sich ihre Gründe zu Schwimmen und Makoto erzählt aus seiner Vergangenheit.

Nachdem er Harukas Geschichte gehört hat, möchte Rei von Rin wissen, was er eigentlich wirklich vom Iwatobi Swim Club will und Rin öffnet sich ihm gegenüber.

Das Finale rückt näher und der Iwatobi Swim Club muss im Staffelschwimmen gegen Rins Team antreten.

Haruka und seine Freunde haben sich seit dem Turnier im letzten Sommer sehr gesteigert. Inmitten der Hektik des Trainings für die Einzelwettkämpfe geht ihr alltägliches Leben wie üblich weiter. Doch eine neue Saison naht heran!

In gespannter Erwartung auf die bevorstehenden Präfektur-Wettkämpfe stellen die Mitglieder des Samezuka-Schwimmclubs enthusiastisch ihre individuellen Fähigkeiten zur Schau. Im Iwatobi-Schwimmclub ordnet eine ebenso enthusiastische Rin eine Inspektion der Frühstücksdosen an, um sicherzustellen, dass die Schwimmer die richtigen Nahrung für ihr Training zu sich nehmen. Allerdings.

Am Vorabend der Präfektur-Wettkämpfe beschließt Makoto, mit Haruka über ein bestimmtes Thema zu reden. Als das Turnier beginnt, ist der Iwatobi-Schwimmclub in Hinblick auf die Siegeschancen extrem motiviert. Aber schaffen es die vier auch, die Vorrunden in den Einzelkämpfen zu meistern?

In Samezuka geht es weiter mit dem heißblütigen Training im Angesicht der Wettkämpfe. Auch der Iwatobi-Schwimmclub trainiert jeden Tag ausdauernd bis die Sonne untergeht. Trotz Amakata-senseis Sorge bestehen Haruka und die anderen darauf, vor dem Turnier so viel wie möglich zu trainieren.

Das Training des Iwatobi-Schwimmclubs geht weiter. Doch die Zeichen der Unsicherheit in Harukas Schwimmleistungen werden immer deutlicher. Makoto und die anderen sind um ihn besorgt, aber geben sich weiterhin fröhlich und tun so als ob alles in Ordnung wäre. Doch plötzlich erscheint Sousuke, der mit Haruka sprechen will

Für Haruka und Makoto beginnt nun das Uni-Leben. Dazu gehört auch das erste Training im Uni-Schwimmklub, zu dem sich Haruka aufmacht. Dort trifft er auf einen alten Bekannten aus Kindertagen.

Der Schwimmklub der Iwatobi-Mittelschule fährt zusammen mit der Samezuka und der Soufuukan in ein Trainingslager. Dort stärken sie ihren Zusammenhalt.

Ikuya und Haruka treten beide beim Lagenschwimmen an. Endlich treffen sie erneut aufeinander. Wird Ikuya nun endlich begreifen, was sich seine alten und neuen Freunde für ihn wünschen?