Весь світ ось-ось зміниться внаслідок приходу паразитів, які пожирають людські мізки. Одне з їхніх яєць потрапляє в будинок Ізумі Шінічі, ученя середньої школи. Паразит, що вилупився, атакує Шінічі, але стикається з несподіваним опором і упускає можливість проникнути в його мозок.

Шінічі та його паразит продовжують своє небажане співіснування. Шінічі розуміє, що паразити причетні до триваючої серії жорстоких вбивств. Відчуваючи себе самотнім у своєму відкритті, Шінічі бореться з розчаруванням. Сам того не підозрюючи, він збирається вперше зустрітися з іншим паразитом...

У міру того, як кількість жертв жорстоких вбивств зростає, Шінічі перебуває в сум’ятті, оскільки він єдиний, хто знає правду. Коли Правко раптом попереджає його про присутність ще одного паразита, він з жахом виявляє, що він знаходиться в його власній школі. Шінічі відвідує загальношкільні збори, де співробітники представляють симпатичну нову вчительку...

Життя Шинічі повертається до «нормального» після вбивства А, але Шинічі залишається в пригніченому настрої. Його мати, Нобуко, хвилюється, але Шінічі просто блефує, коли вона запитує його, що не так. Його батько, Казуюкі, припускає, що це може бути пов’язано з минулим інцидентом. Нобуко дивиться на старий шрам на своїй руці і згадує те, що сталося, коли Шінічі був маленьким хлопчиком...

Вражений тим, що його матір стала паразитом, Шинічі виживає лише завдяки зусиллям Правка. Прийшовши до тями, Шінічі спустошений усвідомленням того, що це не був сон.

Вважаючи, що він знайшов убивцю своєї матері, Шінічі натомість зустрічає Уду Мамору, людину в подібній ситуації, як і він сам. Уда співчуває Шінічі і пропонує їм працювати разом. Нарешті настав час помститися за матір! Шінічі прямує до прірви...

Шінічі відновив деяку подобу нормального життя. Внаслідок розповсюдження клітин Правка по всьому його тілу, його фізичні здібності значно зросли і тепер навіть Міцуо не становить загрози. Шінічі боїться, що ці зміни виходять за межі фізичних і переходять у психологічні. Як тільки спокій повертається в його школу, з'являється новий паразит!

Юко приваблює Шимада Хідео, але вона поступово розуміє, що щось серйозно не так із самим обличчям Сімади. Намагаючись розгадати таємницю Шимади, вона з’єднує крапки між ним і поліцейським розслідуванням свого брата.

Нездатний до раціонального мислення, Шімада Хідео є диким звіром, що лютує, і клас Сатомі став його здобиччю. Шінічі повинен пройти через бійню, щоб врятувати Сатомі...

Почуття Кани до Шінічі зростають з кожним днем, як і побоювання Шінічі щодо здібностей Кани. З поверненням звичайного життя, Сатомі бореться зі своєю зростаючою підозрою, що в Шінічі щось змінилося. Тим часом новий паразит, здається, сіє хаос у схованці місцевої банди. Життя кожного ось-ось знову зруйнуються.

Особлива здатність Кани набирає сили. Вважаючи, що ігнорування лише збільшує загрозу її життю, Шінічі розповідає Кані все про паразитів. Шінічі лише хоче врятувати Кану, але Кана вірить, що Шінічі їй бреше. Це два кораблі, що пливуть вночі...

Через кілька днів після смерті Кани все, здається, нормалізується для Шінічі. Сатомі та її друзів турбує його удавана байдужість, але сам Шинічі бореться з власним почуттям тривоги через свій неприродний стан розуму. Тим часом невідомийчоловік починає шпигувати за Шинічі...

Секрет Шінічі стає відомим Кураморі, приватному детективу, якого найняв Тамура. Шінічі намагається довіритися Сатомі, але його невдала спроба лише вбиває клин між ними. Шинічі залучає Уду на допомогу, щоб вийти з глухого кута.

Хоча Кураморі все ще сповнений сумнівів, він вирішує прийняти Шінічі. Незабаром після цього рішучість Кураморі серйозно похитнулася, коли він став свідком того, як паразит вбиває людину. Шінічі розчарований поворотом подій, але затишшя переривається, коли з'являється новий паразит...

Найновіший паразит відрізняється від інших. Балакучий і експресивний, паразит називає себе Мікі і негайно робить свій хід. Поки Правко спить, Шинічі може тільки бігти і бігти...

Визначивши Тамуру як загрозу, група Кусано вирішує усунути її. Тим часом Кураморі намагається помститися за смерть своєї родини, викравши дитину Тамури. З немовлям на руках Кураморі стикається з Тамурою та погрожує скинути дитину з крутого схилу — що зробить Тамура?

Шінічі та Правко прибувають у парк та зустрічають Тамуру, яка тримає свою дитину. Поки Шінічі намагається вгамувати свою лють, Тамура навалює на нього хвилю запитань про сенс існування паразитів і що для них означає людство.

Підозрюючи зв'язок Шінічі зі справами про паразитів, Хірама організовує зустріч Шинічі з Урагамі, засудженим із особливими здібностями. Незважаючи на те, що з нього знято будь-які підозри та він може повернутися до свого шкільного життя, невдовзі Хірама знову з’являється перед Шінічі. Урядова операція зі знешкодження паразитів за допомогою Хірокави ось-ось розпочнеться...

Почалася спільна операція поліції та ударної групи з усунення угруповання паразитів під керівництвом Хірокава. Підрозділ Yamagishi використовує свою спеціальну сенсорну систему для полювання на паразитів. Серед хаосу людська перемога здається майже невідворотною. Але все ось-ось переверне один-єдиний паразит...

Штурмовому загону вдається знищити Хірокаву, лідера паразитів, але вони опиняються в безвиході, коли з’являється головний паразит. Їхня нездатність усунути Гото вселяє страх у серце Шінічі — хто надасть йому сміливості протистояти Гото?

Мотивований Сатомі залишитися в живих, Шінічі вирішує битися з Гото. За підтримки Правка вони дають бій Гото в ізольованому лісі. Однак їм не вдається добити Ґото в критичний момент, через що Шінічі втрачає Правка та втікає, зазнавши поразки.

Не маючи шансів вижити, Шінічі робить відчайдушний крок.

З поразкою Ґотоу життя Шінічі нарешті повертається до «нормального». Хоча Шінічі засмучений раптовою втратою Правка, він продовжує своє життя. Однак з'являється остання загроза...