Un soir, le quotidien de Shin’ichi se voit bouleversé par une sorte de serpent qui tente de s’introduire dans son corps. Assez rapidement, le garçon se rend compte que sa main droite a un comportement étrange depuis que le parasite y est entré…

Après l’attaque du parasite qui contrôle la mère de Shin’ichi, Migi doit traiter le garçon en urgence pour protéger leur vie commune. Le père, quant à lui, en vient à détourner les yeux de la réalité.

Avec l’aide de son nouvel allié, Shin’ichi a pu se débarrasser de son ennemi et quitter Sakurazaki. Seulement, les événements l’ont rendu plus froid, ce qui nuit à sa relation avec Satomi.

Migi accepte de se plier aux règles de Shin’ichi en laissant la vie sauve au détective qui les file. À la place, il imagine un nouveau plan qui devrait garantir leur sécurité, avec l’aide de leur seul allié.

L’opération militaire tend vers sa conclusion : au prix de lourdes pertes humaines, la plupart des parasites ont été éliminés. Seuls restent Hirokawa, encerclé par plusieurs soldats, et Gotô, dont les capacités hors normes vont donner du fil à retordre à ses assaillants.

Débarrassés de leur principal ennemi, c’est une vie plus paisible que peuvent retrouver Shin’ichi et Migi, dans un monde où les parasites semblent vouloir se faire beaucoup plus discrets. Quelques passes difficiles attendent toutefois encore le jeune homme…