Hell's Kitchen, New York. Matt Murdock, un bambino di nove anni, nel tentativo di impedire a un anziano di venire travolto da un camion carico di sostanze chimiche, finisce investito al suo posto e perde la vista.

Tempo dopo, ormai adulto, apre uno studio legale assieme al suo migliore amico Foggy Nelson, affittando dei locali rimasti compromessi durante l'invasione aliena di qualche anno prima. Contemporaneamente, grazie ai sensi ipersviluppati ottenuti dopo l'incidente, intraprende in segreto l'attività di vigilante sfoggiando un costume nero artigianale.

Il sicario professionista John Healy uccide a mani nude un uomo su una pista da bowling e si fa in seguito arrestare chiedendo un avvocato. Il caso viene affidato allo studio legale Nelson & Murdock da James Wesley: pur sospettando che l'uomo nasconda qualcosa di losco, Matt convince Foggy ad accettare l'incarico scoprendo, poco dopo, che Wesley ha comprato la giuria. Nel frattempo Karen viene contattata dai legali dell'ormai disciolta Union Allied Construction, che le offrono una forte somma di denaro affinché firmi un contratto che la vincolerebbe a non parlar più pubblicamente dello scandalo della società; disgustata, Karen si rivolge al reporter del New York Bulletin Ben Urich, noto per l'impeccabile etica professionaleprofessionale, mantenuta nonostante le ritorsioni subite da lui e dai suoi cari nel corso degli anni.

Dopo essersi esposto all'opinione pubblica con la sua attività filantropica Wilson Fisk viene visto dall'opinione pubblica di Hell's Kitchen come una sorta di "messia" vanificando completamente il lavoro d'indagine compiuto da Ben, Karen e Foggy in quanto ora non risulterebbe più credibile associare la figura dell'uomo a quella di un criminale. Contemporaneamente Fisk fa un'offerta al rialzo anche alla donna guatemalteca a rischio sfratto, cliente della Nelson & Murdock e ai suoi condomini, che, tuttavia, rifiuta di troncare gli accordi precedenti e viene assassinata apparentemente in seguito ad un tentativo di scippo.

Contrariamente a quanto voluto da Owlsley, Fisk decide di rimanere al capezzale di Vanessa fino a che questa non si sarà completamente ripresa e disponendo tutti i suoi uomini sul luogo. Contemporaneamente Foggy si allontana da tutti e riaggancia una relazione puramente fisica con la superficiale Marci Stahl, mentre Ben inizia ad indagare approfonditamente sulle vere origini di Fisk e Matt, dopo aver cercato conforto nella fede, viene ispirato a diventare un simbolo dalle parole del suo confessore, padre Lantom; motivo per il quale rintraccia Melvin Potter, un idiot savant costretto da Fisk a costruirgli armature in una speciale lega sottilissima sotto minaccia di ritorsione verso i suoi cari. All'uomo, Matt promette che lo libererà dal suo oppressore se realizzerà per lui una delle sue speciali fabbricazioni.

Dopo il funerale di Ben Urich, Matt e Foggy si riappacificano e tornano a lavorare assieme a Karen per riuscire a incriminare Fisk che, nel frattempo, scopre della cospirazione di Owlsley contro Vanessa e lo uccide brutalmente, nonostante questi tenti di minacciarlo rivelando di aver nascosto il detective Hoffman, che è disposto a testimoniare contro di lui. Dai documenti della Landman & Zack sottratti da Marci, la Nelson & Murdock scopre a sua volta del detective e inizia dunque una corsa contro il tempo per trovarlo prima degli uomini di Fisk, che sotto suo ordine stanno passando a setaccio Hell's Kitchen.

Il violento e instabile gangster Finn Cooley giunge a Hell's Kitchen per vendicare il figlio, ucciso e derubato da Punisher, iniziando una serrata caccia all'uomo per tutta la città. Intanto Karen, dopo aver trovato nei dossier su Punisher la radiografia del cranio di un uomo che ha subito un colpo di pistola alla testa rimanendo in vita, intuisce che non si tratta di una vittima del vigilante ma di lui stesso. Pertanto indaga fino a scoprire la sua vera identità: Frank Castle, ex-Marine sopravvissuto allo sterminio della sua famiglia.

Dopo essere stato gravemente ferito da un edificio crollato su di lui, Daredevil si salva grazie al sistema fognario di New York City che lo scarica su una spiaggia. Successivamente un tassista, dopo averlo trovato, lo porta da Padre Lantom che affida Matt alle cure di suor Maggie al Saint Agnes Orphanage, luogo in cui Matt è cresciuto. Mentre si riprende lentamente, Matt ha una crisi di fede per cui afferma che avrebbe preferito mettere la sua vita in pericolo e continuare a combattere come Daredevil che tornare alla sua vita civile.

Nel frattempo gli amici di Matt, Karen Page e Foggy Nelson, ignari di tutto, iniziano a perdere la speranza che il loro amico possa essere ancora vivo.

In prigione, il criminale Wilson Fisk decide di fare un accordo con l'FBI per proteggere il suo amore Vanessa Mariana. Il caso viene assegnato all'agente dell'FBI Ray Nadeem, il quale lotta per risolvere i propri problemi finanziari e per ricevere una promozione.

Le informazioni di Fisk portano all'arresto dei leader sfuggenti del sindacato albanese e Nadeem convince i suoi superiori a lasciarlo continuare a lavorare con Fisk, nonostante i suoi problemi finanziari che potrebbero renderlo un facile bersaglio della corruzione.

La notizia della collaborazione di Fisk con l'FBI si diffonde rapidamente e, per rappresaglia, viene attaccato in prigione da un altro detenuto. Nadeem accetta di spostare Fisk fuori di prigione in detenzione domiciliare, ma il loro convoglio viene attaccato dagli albanesi lungo la strada e la maggior parte degli agenti dell'FBI vengono uccisi. Fisk viene salvato dall'agente "Dex" Poindexter, che ha abilità di tiro incredibilmente accurate.

Matt salva un padre e una figlia da un'aggressione; in seguito rintraccia i tentati rapitori e li picchia, facendoli arrestare. Karen è incaricata di scrivere un articolo sul tentativo di rapimento, che ha coinvolto la nota Neda Kazemi.

Lottando con il fatto che sia suor Maggie che padre Lantom gli stessero nascondendo la verità, Matt va in un club di boxe abbandonato dove suo padre era solito combattere.

Manning minaccia la famiglia di Foggy, a meno che non si scusi pubblicamente per aver parlato contro Fisk al dibattito. Karen decide di fuggire da Fisk, e suor Maggie si offre di aiutarla a nascondersi.

Nadeem racconta ai suoi superiori, Tammy Hattley e Winn, della cospirazione dell'FBI che coinvolge Fisk e Dex. In una serie di eventi, Hattley uccide Winn con la pistola di Nadeem, rivelando che lavora per Fisk. Quindi produce prove con le quali può incastrare Nadeem per l'omicidio di Winn, ricattandolo per lavorare per Fisk con l'aiuto di Manning.

Nel flashback, una giovane Karen rimanda il college perché sa che suo padre e suo fratello Kevin non sarebbero in grado di gestire il ristorante di famiglia dopo la morte di sua madre per cancro. Si annoia della sua vita in una piccola città e inizia a usare e vendere droghe con il suo ragazzo Todd. Un giorno Kevin rivela a Karen di averla iscritta nuovamente al college, così Paxton, il padre, decide di festeggiare con una cena in famiglia, ma questo porta a una discussione e Karen scappa con Todd. Dopo essersi ubriacati e drogati insieme, tornano alla roulotte dove vive Todd per scoprire che Kevin la sta bruciando. Todd attacca Kevin e Karen ferisce Todd con la sua pistola per fermarlo. Lei e Kevin partono in macchina ma durante una discussione hanno un incidente, si schiantano e Kevin muore. Lo sceriffo locale copre il coinvolgimento di Karen, ma suo padre le chiede di andarsene.

Dex fa assumere a Nadeem il controllo della scena del crimine alla chiesa e l'FBI cerca Matt e Karen. Grazie all'aiuto di Maggie riescono a restare nascosti.

Il Dipartimento di Giustizia lascia cadere tutte le accuse contro Fisk, che annuncia la sua libertà al pubblico con un discorso che proclama Daredevil come nemico pubblico. Con Vanessa sulla via del ritorno a New York City, Fisk va a recuperare il dipinto che gli ha dato quando si sono incontrati per la prima volta: è in possesso di Esther Falb, una sopravvissuta dell'Olocausto la cui famiglia era la proprietaria originale del dipinto. Fisk decide di lasciarglielo tenere.