Dans la Zone Neutre, Juliana Crain rencontre un irlandais nommé Wyatt. Elle doit fuir et demander de l'aide à Tagomi. Les Japonais testent une bombe atomique. Joe Blake est envoyé en mission diplomatique à San Francisco. Kido embauche un nouveau sergent. Nicole Dormer arrive à New York et dirige une nouvelle campagne de propagande. Les Smiths luttent contre les conséquences de la mort de Thomas.

Juliana admet que son destin et celui de Tagomi sont trés liés. Tagomi et l'amiral Inokuchi comprennent que le Reich dissimule un embargo pétrolier sur les États du Pacifique. Le Reichsmarschall Rockwell et J. Edgar Hoover complotent contre John Smith. Helen suit une thérapie pour surmonter sa perte et prend des mesures drastiques pour protéger sa famille. Kido et Tagomi s'affrontent sur Juliana.

Juliana et Tagomi enquêtent sur les films et Juliana reconnecte avec un vieil ami. Childan est impatient de retourner à San Francisco car les représailles ont cessé, mais une nouvelle romance rend Ed réticent à partir. Kido reçoit des renseignements qui le conduise sur une nouvelle piste. Smith se voit célébrer par la haute société nazie lors d'une projection du nouveau film de Nicole sur Thomas.

Une nouvelle communauté se bat pour survivre dans la zone neutre. Juliana et Joe se reconnectent, et Joe continue son travail d'infiltration pour Himmler. Wyatt voit Juliana à San Francisco. Le passé de Smith revient le hanter. Ed et Childan relèvent un défi en rentrant à San Francisco. Alors que les tensions montent entre le Reich et l'Empire, Tagomi découvre que sa vie est peut-être en danger.

Le Reichsführer continue de provoquer les États du Pacifique japonais. Juliana échappe de justesse à une situation mortelle et découvre des secrets nazis. John Smith s'embrouille avec son adversaire politique. Les nazis se préparent pour l'« Année Zéro ». La relation de Joe et Juliana prend un tournant.

Avec l'aide de Wyatt, Juliana fuit San Francisco avec les secrets nazis volés. Childan peut enfin rentrer chez lui. Ed décide de rester dans la zone neutre. Tagomi fait des révélations à Kido qui changent sa perspective. La carrière de John Smith prend un tournant.

Juliana se lance dans une mission pour arrêter les nazis et se réunit avec de vieux amis. Thelma et Nicole se rapprochent, malgré les risques. Smith en apprend plus sur les recherches des nazis sur les mondes parallèles Kido demande à Tagomi d'avouer la vérité à propos des films et de sa capacité à voyager. Kido amadoue une intelligence cruciale de Childan.

Juliana se rend compte que le temps presse, et trouver des soutiens continue de s'avérer difficile. Tagomi se retrouve dans une dangereuse lutte pour la vie ou la mort. En thérapie, Helen Smith dépasse une limite. Kido poursuit sa cible dans la zone neutre.

La mission de Juliana et Wyatt les emmène encore plus à l'est et dangereusement près du centre d'un projet nazi top-secret. Essayant d'améliorer les relations de leur côté, Tagomi tend la main à Smith. Smith fait une découverte cruciale. Kido tourne la page.

La tentative de Juliana pour arrêter les nazis la met dans une position dangereuse. Himmler et John Smith célèbrent somptueusement l'Année Zéro. Au milieu d'une série de succès, Smith fait face à un contretemps. Kido revient à San Francisco avec un prix et fait preuve de gentillesse pour un ami. Tagomi prend une décision difficile. Ed retourne à San Francisco et se reconnecte avec Childan.

Juliana Crain se retrouve dans un nouveau monde. Suite à une attaque contre le ministre Tagomi, l'inspecteur en chef Kido lance une répression contre les coupables présumés : les Rebelles communistes noirs. John Smith se rend en Zone neutre pour capturer Wyatt Price et son armée rebelle. La nouvelle indépendance d'Helen Smith est mise à l'épreuve quand John demande à récupérer ses filles.

John Smith reçoit des renseignements par ses officiers au complexe du Nebenwelt. Chez lui, il est confronté à des changements familiaux. Bell Mallory et les Rebelles communistes noirs s'allient avec les rebelles de Wyatt Price. Kido essaie de renouer avec son fils Toru. Childan se lie avec son assistante japonaise. Juliana découvre qu'un ennemi dans un monde peut être un ami dans un autre.

Les rebelles de Wyatt et les Rebelles communistes noirs s'allient pour attaquer l'élite de Tokyo à la vente aux enchères de Childan. Helen revient dans le Reich afin de protéger ses enfants. Kido reçoit un appel inattendu des Yakuzas. Smith charge un assassin de tuer Juliana.

John et Helen reçoivent Himmler et sa femme à dîner ainsi que le dangereux Obergruppenführer Goertzmann, une nouvelle menace pour John. Juliana retourne dans le monde du Haut Château, dans les ruines du "District de la contamination". Kido est contraint par son général de se retourner contre la princesse héritière. Désormais prisonnier, Hawthorne Abensen partage de nouveaux contes du Haut Château.

John Smith est confronté aux choix qu'il a faits. L'empire tente d'entamer des pourparlers secrets avec les Rebelles. Kido arrête un traitre, menaçant de diviser les Japonais entre eux. Malgré ses protestations, Helen se voit confier une nouvelle garde rapprochée. Juliana rejoint Wyatt pour planifier la chute du Reich américain.

John Smith découvre que l'on peut se perdre sur le chemin qu'on n'a pas pris. Juliana tente de décoder les messages secrets d'Abendsen. Au milieu des dissidences, Bell conçoit une nouvelle stratégie pour les Rebelles. Kido doit décider où va sa loyauté, même si cela doit lui coûter l'Empire.

Les Rebelles lancent un assaut massif dans les États du Pacifique et Kido se retrouve avec le destin de l'Empire entre les mains. Childan est capturé par les Kempetaï. Helen se résigne à épauler son mari en revenant à la vie publique. Juliana et Wyatt arrivent à New York pour planifier une nouvelle stratégie audacieuse contre Smith.

C'est le moment de vérifier si les intuitions de Juliana à propos d'Helen sont vraies. Pendant l'évacuation de San Francisco, Kido part à la recherche de son fils mais se fait capturer. Un courrier va changer pour toujours la vie de Childan et Yukiko. Les Rebelles reçoivent l'aide inattendue des Yakuzas. Abendsen condamne Smith avec sa dernière prédiction.

La loyauté de Smith et d'Helen est durement testée par l'intervention d'un vieil adversaire. Les Rebelles luttent pour maintenir l'ordre dans les États du Pacifique. Kido doit affronter les atrocités qu'il a commises. Des bandes de miliciens errants menacent Childan et Yukiko.

Au bord d'une inévitable invasion nazie, les Rebelles se tiennent prêt. Kido est engagé dans une course contre la montre pour retrouver son fils. Childan offre tout ce qu'il a pour rejoindre Yukiko. Helen doit choisir entre la trahison et la loyauté envers son mari, tandis qu'elle et Smith se rendent au portail par le train rapide. Pendant ce temps, Juliana et Wyatt font le guet.