Jackson, Jamie és Shaffer Ügynök keresnek egy kémikust Alabamában, akinek bizonyítéka van a Raiden Global szerepéről a növekedő állat probléma ügyben. Ezalatt Chloe, Mitch és Abraham elrepülnek Rio de Janeiro, hogy késleltessék a helyi önkormányzat tervét a tömeges denevér kiírtással kapcsolatban és összetűzésbe kerülnek egy könyörtelen drog báróval.

Jackson (James Wolk) és Jamie (Kristen Conolly) próbálnak a nyomára akadni Even Lee Hartley-nak. Akinek sikerült megszereznie az anyasejtet. Eközben Abraham (Nonso Anozie) Mitch (Billy Burke) és Chloe (Nora Anezeder) próbálják megoldani a Rio-i vészhelyzetet. Mert a várost ellepték a denevérek.

Jackson (James Wolk), Abraham (Nonso Anozie) és Chloe (Nora Anezeder) újabb megbízást kapnak. Elutaznak Massachussets államba, azon belül a Pender szigetre. Ahol állítólag több ezer patkány szállt partra egy raktárhajóról. Ezzel párhuzamosan a többiek tudta nélkül Mitch (Billy Burke) tovább folytatja titkos üzelmeit a Reiden-el, hogy megmenthesse haldokló kislánya életét.

Jackson (James Wolk), Jamie (Kristen Conolly), Abraham (Nonso Anozie), Mitch (Billy Burke) és Chloe (Nora Anezeder) azzal szembesülnek, hogy a megbízójuk is a Reiden Global-nak dolgozik. A helyzetet fokozza még, hogy Jamie és Chloe ellen is körözést adott ki az FBI, miután őket gyanúsítják egy FBI ügynök megölésével.

Jackson, Ab és Chloe értesülnek Mitch-től, hogy Jamie nem csak hogy életben van, de a megoldást jelentő leopárd is nála van. A csapat és a barátok elhatározzák, hogy újra összeállnak és mindent megtesznek azért, hogy megállítsák a közelgő katasztrófát, ami az emberiség kihalását is jelentheti...

Jackson, Robert, Ab és Dariela megérkeznek Pangea szigetére. Amit egy tudós konzorcium alapított meg, a Pásztorok. Ezen a szigeten található meg egyedül a világon, az a hármas spirálú kardfogú. Ami a megoldást jelentő ellenszer kifejlesztéséhez az utolsó láncszem. Mindeközben Mitch és Jamie megpróbálják szabotálni a Noé tervet, ami során egy nem is olyan régi ismerős tűnik fel és nyújt, nem várt segítséget..

Robert Oz miután feláldozta az életét, a fiáért és hogy Mitch előtudja állítani az ellenszert, amivel megmenthetik az állatokat. A csapat tagjainak azzal kell szembesülnie, hogy a Pásztorok átverték őket és egyelőre ismeretlen okból. De egész végig az volt a tervük, hogy az ellenszer és Noé terv egyszerre terjedjen szét a világban. De ez még nem minden, Robert is tartogatott még egy meglepetést a túlvilágról. Ami egy olyan eseményt tesz kézzelfoghatóvá az emberek és állatok számára, ami ezidáig elképzelhetetlennek tűnt…