בפרק הראשון לעונה השנייה, רופאי שיקגו מד נתקלים בכמה שינויים. ד"ר צ'רלס משכנע מישהי להתמחות אצלו.

ד"ר צ'וי מדריך איש חיל הים שעומד לצאת למשימה בחו"ל. בינתיים הרופאים מטפלים בשני תינוקות חולים מאוד, וייאלצו לקבל החלטה קשה.

סודות משפחה מתגלים כשאחותה של מגי באה לביקור. ד"ר רודס מנסה להימנע מהיתקלות בד"ר לייתם.

הבת של ד"ר צ'רלס מצטרפת למחלקת האפידמיולוגיה וחוקרת מקרה של הידבקות בזיהום נדיר.

תאונה במרתון שיקגו מכניסה את עובדי הרפואה לפעילות נמרצת. ילדה ההולכת ומאבדת את שמיעתה גורמת לצוות לתהות על קנקנה של האם המלווה.

ד"ר מנינג מטפלת בחולת סרטן צעירה ונסחפת למעורבות רגשית עמוקה. נערה חובבת מדעים מגיעה עם חסימה לא ברורה במעי.

אהוב נעוריה של שרון מגיע לבית החולים. הלסטד מנסה להשיג הכנסה נוספת. ד"ר צ'רלס מנסה להגן על מטופלת.

ד"ר הלסטד וד"ר מנינג מתמודדים עם שני אחים מסוכסכים שנפגשים כשאחד זקוק נואשות להשתלת כליה. ד"ר רודס וד"ר לייתם מטפלים בנערה עם תסמונת גנטית הזקוקה לניתוח, אך אמה מסרבת שתעבור ניתוח מחשש לחייה.

אפריל מגלה שהתרופה נגד שחפת עלולה לגרום לבעיות נוספות. ד"ר צ'וי לומד לקח חשוב כשהוא מטפל בשני אמני לחימה שנפצעו קשה.

מגי מתמודדת עם העבר שלה כששוטרת שעצרה אותה מגיעה לבית החולים עם פציעה קשה.

ד"ר ריס עוברת משמרת לילה קשה במיוחד. ד"ר רודס מתבקש לבצע ניתוח יוצא דופן.

צעיר בן 19 מגיע למיון במצב מצוקה שמעמיד בסכנה את הסובבים אותו. ד"ר לייתם מתבקש לבצע ניתוח שמעמיד במבחן קשה את ההפרעה האוטיסטית שלו.

ד"ר לייתם נוסע עם ד"ר רודס לביצוע ניתוח מחוץ לעיר. אישה הסובלת מהפרעת אישיות מציבה אתגר בפני ד"ר ריס.

הרופאים מטפלים בפצועים רבים שמגיעים לחדר המיון עקב תאונת שרשרת שאירעה בעיצומה של סופת שלגים. הם מתמודדים עם החלטות רפואיות קשות ועם הקשיים שמערימה הסופה.

אפריל נתקלת בחולה צעירה שסובלת מבעיות לב. ד"ר רודס מטפל בבחור ששרד בנפילה מגובה של 33 קומות. נאט וד"ר צ'וי מטפלים בגבר משותק שלא מוצאים את מקור הזיהום שהוא סובל ממנו.

אפריל מתקשה להתמודד עם ההפלה שעברה, ומסרבת לקבל תמיכה מעמיתיה. ד"ר ריס נתקלת במטופלת צעירה שמנסה לשכנע אותה שאשפזו אותה במחלקה הפסיכיאטרית על לא עוול בכפה.

אירוע טרגי מטלטל את צוות הרופאים. צ'וי והלסטד מתווכחים לגבי הדרך הנכונה לטפל בנער המפגין סימני שבץ. ד"ר מנינג מטפלת בילד שנפל לתוך נהר.

ויל מטפל במנטורית שלו לשעבר ומתקשה לא לערב את רגשותיו בטיפול. ד"ר ריס מנסה להתגבר על ההתאבדות של ג'ייסון.

המערכת הממוחשבת של בית החולים מושבתת על ידי תוכנה זדונית, והצוות נאלץ לעבוד "כמו פעם". בעלה לשעבר של גודווין מגיע עם חברתו החדשה ומערער אותה.

נער שהכו אותו בבית הספר מגיע לבית החולים, ובפיו בקשה יוצאת דופן. ויל צריך לטפל באביו ורותם את רודס לעזרתו.

ד"ר רודס מנסה לסייע לאמא הנחושה לעזור לבתה להתגבר על לוקמיה בדרך לא שגרתית. ד"ר צ'רלס מתקשה שלא להתערב בטיפול בבתו.

ד"ר רודס מתעמת עם ד"ר צ'רלס ועם חברי סגל אחרים לגבי דרך הטיפול ברובין. נערה בת 13 מגיעה למיון כשהיא סובלת מתסמינים שסיבתם לא ידועה.