Nový papež Pius XIII. se krátce po svém zvolení setkává s kardinály Voiellem a Gutierrezem, kteří jej budou doprovázet po celou dobu jeho pontifikátu. Poznává vatikánské zákulisí a dává rázně najevo, že nastolí nové pořádky. Svou nesmlouvavostí a bezskrupulózním jednáním šokuje především státního vatikánského sekretáře Voiella. Silného zákulisního hráče, který byl zvyklý ovlivňovat veškeré dění. Svými vůdčími schopnostmi dokázal ovlivnit papežskou volbu ve prospěch Lennyho v naději, že pro něj bude představovat „pohlednou loutku“. Ten se však od samého počátku svého pontifikátu staví vůči jeho radám přezíravě a do exponované role první asistentky prosadí sestru Mary navzdory mechanismům kurie. Papeže totiž pojí se sestrou Mary dlouholetý důvěrný vztah. Vychovala ho poté, co ho rodiče odložili do sirotčince. Voiello začíná být chováním nového papeže znepokojený a začíná pátrat po jeho slabých stránkách.

Státní sekretář Voiello začíná být stále znepokojenější papežovým jednáním. Obává se, že by mohly být vážně ohroženy vatikánské politické vztahy a především narušen vztah s věřícími. Papež si totiž přeje, aby nebyla zveřejněná jediná reprodukce jeho obrazu. Chce se stát neviditelným a nedostupným, vytvořit obrácenou hyperbolu. Papež se připravuje na svůj první oficiální projev a o pomoc požádá svého celoživotního rádce, kardinála Spencera. Ten ale jeho nabídku, aby se stal prefektem kongregace pro klérus, odmítá. Voiellovy obavy o budoucnost církve se naplňují ve chvíli, kdy papež přednáší svůj první oficiální projev na balkóně baziliky svatého Petra. Ten svým kontroverzním a nebývale rázným projevem šokuje katolickou veřejnost.

Nový papež svým prvním oficiálním projevem přesvědčil kardinály o tom, že zvolili papeže, který se vymkl jejich kontrole. Mylně se o něm domnívali, že bude podléhat vlivu státního sekretáře Voiella. Lenny se dozvídá o machinacích, které vedly k jeho zvolení. Měl představovat papeže z kompromisu, most mezi konzervativním a pokrokovým křídlem katolické církve. Lenny se ovšem o svou papežskou suverenitu nehodlá dělit. S tím se odmítá smířit státní sekretář Voiello a hledá způsob, jak dostat nového papeže pod kontrolu. Lenny mezitím čelí velké společenské kritice a znepokojení z jeho nezvykle tvrdého postoje vůči věřícím.

Státní sekretář Voiello spřádá plány, jak zastavit nového papeže. Hodlá vyvolat veřejný skandál a zdiskreditovat ho tím, že naváže milostný poměr s ženou. Vydírá mladou Esther a nutí jí, aby papeže svedla. Esther ovšem v rozmluvách s papežem nalezne útěchu, pochopení a naváže s ním hluboké přátelství. Mezitím Lenny pokračuje ve svém boji s vatikánskými strukturami a plánuje katolickou církev očistit od homosexuality a pedofilie.

Voiellovy vytrvalé plány na diskreditaci papeže přetrvávají. Lenny se ovšem projeví jako mnohem protřelejší politik. Voiella upozorní, že zná všechna jeho tajemství a nenechá se jím vydírat. Voiello dochází k hlubokému přehodnocení svého chování a prosí papeže o odpuštění. Lenny mezitím tráví svůj volný čas ve společnosti přítele z dětství Dussoliera a rozmýšlí svou první promluvu ke kardinálům. Svým dlouho očekávaným projevem plánuje vyvolat revoluci v koncepci katolické víry. To se mu podaří, když se k tomu konečně odhodlá…

Po devíti měsících papež poprvé svolí k setkání s italským předsedou vlády. Ten si je vědom riskantních a nepopulárních opatření, která papež během své vlády učinil a cítí, že moc katolické církve oslabuje. Proto je premiér šokovaný, když ho Lenny seznámí se svými ultrakonzervativními požadavky. K jejich prosazení papež neváhá využít politických výhrůžek. Dále papež pokračuje ve svém tažení proti homosexuálním kněžím. Dussolier přijímá papežovu nabídku a stává se prefektem kongregace pro klérus. Stěhuje se do Říma a od papeže dostává za úkol, aby zkoumal minulost uchazečů o kněžství a byl důsledně dodržován slib cudnosti, který skládá kandidát kněžství. Důsledky tohoto opatření jsou ovšem okamžité a velmi tragické.

Papež se cítí příliš unavený, truchlí a má výčitky svědomí kvůli úmrtí svého přítele Dussoliera. Přemýšlí, jak ovlivnit osud církve a celkem překvapivě přistoupí na návrh podniknout svou první pastorační cestu do Afriky. Jeho první cesta a vyhlídka veřejného vystoupení z anonymity vzbudí velkou společenskou pozornost. V Africe se papež setkává se sestrou Antonií, respektovanou misionářkou a představitelkou vesničky dobra. Lenny k ní ovšem přistupuje se značnou nedůvěrou a brzy odhalí zvrácené poměry, které sužují tamější společnost. Papež posléze pronáší obyvatelům nádherný a inspirativní projev o míru.

Papež rozmlouvá se svým duchovním otcem Spencerem. Ten mu vyčítá chyby, kterých se během svého pontifikátu dopustil. Papež sice zavedl pravdivé koncepty, ve výsledku ovšem vytváří přehnaně rigidní systém. Mezitím v New Yorku shromažďuje kardinál Guttierrez svědectví a důkazy proti tamějšímu arcibiskupovi Kurtwellovi. Ten je podezřelý ze závažného zneužití svého mocenského postavení a čelí závažným obviněním. Vyšetřování ovšem probíhá bezúspěšně a zdá se, že se arcibiskupovi nepodaří vinu prokázat, protože svědci mají obavu veřejně vypovídat a ke všemu arcibiskup disponuje kompromitujícími materiály na papeže. Papež chce ovšem Kurtwella donutit za každou cenu, aby se sám nechal shledat vinným. Mezitím se Gutierrez uchýlí k riskantnímu kroku, jímž se konečně podaří arcibiskupa usvědčit a na veřejnost se dostávají papežovy utajované milostné dopisy…

Po zveřejnění papežových milostných dopisů se po celém světě mluví o lásce. Sociální sítě a novinové titulky se výjimečně věnují pozitivnímu tématu a zaměří svou veškerou pozornost na lásku. Lenny konečně pochopil, že je jeho osudem řadu postojů a rad přijímat. Plánuje pracovat na budoucnosti a mít správnou motivaci, aby mohl pohnout světem. Proto osloví kardinála Guttiereze, aby se stal jeho osobním tajemníkem. Mezitím probíhají ve Vatikánu debaty o papežově budoucím svatořečení. Jeho modlitby totiž vedly k zázračnému uzdravení smrtelně nemocné ženy, otěhotnění neplodné Ester a sestru Antonii stihl po papežově modlitbě boží trest. Papež proto přistoupí na návrh, že stráví Vánoce mezi nemocnými v Guatemale. Na poslední chvíli ovšem svou cestu ruší a konečně se odhodlá ke svému prvnímu veřejnému vystoupení. Svůj první veřejný projev symbolicky pronáší v Benátkách, domnělém bydlišti svých rodičů.