夜斗是个为了5元的香火钱，连跑腿送货的委托都能接受的无家可归的流浪神。身为他的“神器”的同伴伴音对他“生理上就排斥”，而伴音随后也向夜斗提出辞职，不再担当他的神器。

于是某一天，没了神器的夜斗接了个寻找走失的小猫的委托。在寻找走失的小猫的途中，差点被卡车撞到的夜斗，被一位名叫壹岐日和的少女所救。

因为车祸的关系，日和成了时不时就会灵魂出窍的“半妖”。为了治好这种不方便而危险的体质，日和向夜斗寻求帮助，但夜斗以“没有神器没办法”而拒绝行动。

没办法，日和只好亲自帮忙去找适合成为神器的死灵，但却误打误撞引来了妖怪。夜斗没有神器无法战斗，只好带着日和的魂魄一起逃走。在逃到住宅区的时候，一个如雪般的死灵的身影映入了夜斗的眼睛……

雪音成了夜斗的新神器，但由于待遇很差，雪音对夜斗很是不满。“那就让你见识一下我的力量吧！”说着，夜斗叫来了日和，但结果却只是让她请客。

好不容易来了委托的电话，结果前往的地方居然学问之神“天神大人”——菅原道真的神社。由于天神气场强大，神器众多而美丽，很有神明的风范，让雪音和日和都不禁顶礼膜拜。而反观夜斗那副不正经的轻浮姿态，让人不得不怀疑他到底是不是真正的神。

夜斗和天神一番贫嘴后说起了正事，而这次的委托是因为应考季节很忙，所以天神想让夜斗帮个忙……

即使雪音成为了夜斗的新神器，但夜斗的“经营状况”依旧惨淡。面对没多少长进的夜斗，日和没少数落他，多次提醒他别忘了自己的委托，也别让雪音受苦，“请更振作一点，即使是为了雪音也好。”随即，夜斗突然一本正经地对她说“有几个人想介绍给你认识”。说着，夜斗把他们带到一位名为“小福”的女子家中。这位小福其实是名为“惠比寿小福”的神祇，有一位名为大黑的面相可怕的神器。而夜斗带他们过来，也有着自己的打算。

“其实……夜斗是一个很可怕的神哦”众人闲聊间，夜斗接到了久违的委托，于是夜斗拉上雪音和日和，瞬间移动到委托人所在的地方——某栋高楼的屋顶。但夜斗的出现，好像刚好把坐在屋檐的委托人给撞了下去！

刚刚成为神器的雪音渐渐掌握起神器所特有的能力。然而夜斗的种种表现，让日和坚信夜斗无法成为合格的监护人。因此日和决定把雪音接到自己家里，由自己照顾。

日和让雪音再度像普通人般生活，但这也让雪音感觉到自己已不再是人类了。一次，雪音在陪日和出门买东西的时候，突然顺手取下货架上的滑板“就当借用一下”，“那不就和小偷一样了吗！”被日和严厉地阻止下来。可当日和放回滑板后，雪音却不见了踪影。这时，察觉到雪音异状的夜斗出现在了日和面前，想向她了解雪音的情况。神器如果动了邪念，作为主人的神祇就会被刺伤，代神器受罚。而神器的邪念积累到了一定程度，就会招来“魔”的侵蚀，渐渐堕落为与妖怪无异的恶灵。日和、夜斗都意识到了雪音的情绪波动正在愈演愈烈。

另一方面，一直留意夜斗的动向的毘沙门，也得知夜斗获得了新的神器。

雪音正在被“魔”不断侵蚀，终于，在他经过上次的体育用品店时没抵抗住邪念，仗着自己已是不容易被别人认知到的死灵，把滑板偷了出来。逢魔时刻，夜斗找到了雪音，面对夜斗的诘问，雪音撒谎说滑板是日和给他买的，而这时日和也恰巧赶到，夜斗便让雪音与日和对质。一番犹豫之后，日和还是心软袒护了雪音，说这滑板确是自己买给雪音的。

正当不和的气氛在三人之间蔓延的时候，“最强武神”毘沙门突然地出现在他们面前。她驱使着数把神器，不由分说地向夜斗发起猛攻。

在夜斗仓促应战匆匆逃离之后，被留下来的日和想起了之前夜斗的告诫——“如果我出了什么事的话，就去找他们”。于是日和急忙前往小福和大黑的住处求援。

夜斗与毘沙门一役，以突然赶到的小福用大黑打开了通往黄泉的“风穴”，“时化”骤起妖怪大量涌出而暂靠一段落。

雪音在之后离开日和的家，来到天神的神社，想离开夜斗，让天神把自己收为神器，但被拒绝。雪音依然在邪念的驱使下继续做出刺伤夜斗的举动，夜斗也因身上的“安无”（ヤスミ，也称“恙”，神明因神器的堕落而被不洁的异质感染）而越来越虚弱。

正当雪音一个人跑到公园里时，被夜斗叫做“野良”的少女再次出现在了他的面前。

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夜斗与雪音新接到委托，来自于日和同校的学生——荻原学，一个面对同级生的欺凌，只会懦弱地独自流泪而不去行动起来勇敢反抗的孩子。

然而，面对这样的场所——只要是活着的学生每天都能来的的学校，已是死灵的雪音的心中又会生出怎样的感触、掀起怎样的波澜呢？

由于雪音所犯的种种错误，夜斗被“恙”折磨得越来越严重，陷入了极度危险的状态。为了拯救夜斗，必须对让他陷于此境的神器——雪音进行“禊”，让他对自己的种种罪行做出真正的忏悔。然而，要进行“禊”，则需要有三名其他神器……

日和参观附近的神社来迎接新年。野良和一个名叫“蠃蚌”的邪恶灾难之神对她有其他计划，不过……

日和神奇地失去了对夜斗的所有记忆。当夜斗努力帮助她记起时，野良和蠃蚌继续着他们的计划。

夜斗和雪音在最终决战中面对蠃蚌和野良。

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“5日元”香钱就帮助别人并自称“派遣神”的夜斗、“神器”雪音和“半妖”壹岐日和一起，仍然作为二流穷神过着每一天。直到有一天，夜斗在斩杀妖怪的现场找到了一张“面具”。另一方面，夜斗的天敌“最强武神”毘沙门，面临着神器数量持续增加的状况。兆麻担心这样对她身体的负担过重。尽管如此，毘沙门仍然做不到对“死灵”见而不救……

雪音第一次交到了朋友，日和与小福都很高兴。但是，雪音有个没说出口的秘密。这个朋友是毘沙门的神器“铃巴”。同为神器的二人每天见面聊天，距离渐渐缩小。擅长照料草木的铃巴十分珍惜一株樱花树，那里寄托着他难以忘怀的一个约定……雪音开始思考此岸和彼岸之人的关系，并把铃巴的身份告诉了夜斗，意外却在某处发生了……

毘沙门的神器中，有一人死去了。毘沙门的身体状况进一步恶化，作为药师的陆巴能很快指出原因，让作为道标却一无所觉的兆麻感到动摇。毘沙门原谅了勇敢的陆巴。但是，隐藏其下的陆巴的阴谋正逐步推进。另一方面，夜斗想阻止要去见铃巴的雪音。而雪音摆脱了阻碍，赶去看到的却是，在樱花树下放着花束祭祀的兆麻的身影。知道了铃巴一切的雪音……

陆巴抓走了日和与兆麻，将他们关在下了咒的洞窟里。背叛了毘沙门的陆巴……推断出他的目的的兆麻，向日和讲述了麻之一族过去的故事。曾经毘沙门的神器都以“麻”字命名。兆麻是唯一的幸存者，其他的麻之一族都被夜斗斩杀而全灭……为了救出日和，雪音和夜斗前往高天原。在那里的是早已有所提防的毘沙门。因缘的对决终于开始了……！

为了保护夜斗、被毘沙门斩倒的雪音，他的身体完成了到“祝之器”的新的转变。“恙”的折磨让毘沙门陷入劣势。操纵着面妖、一个个袭击毘沙门的神器的陆巴让情况雪上加霜。为神器的死亡而痛苦，毘沙门失去自我，开始暴走……。继续战斗的夜斗和毘沙门、努力想阻止两人的兆麻、渐渐衰弱的日和……然后，因缘的对决有了意想不到的展开……

“麻之一族”被袭击的悲剧重现。毘沙门仿佛听到了兆麻的安慰和所有死去神器的呼唤，也流下了长久隐忍的眼泪。眼前一连串的情景都是陆巴导致的，他却在指责毘沙门的无能，并提醒毘沙门应该明白，要用自己的生命为这惨状负起责任。对他的话囷巴表示抗议，但毘沙门反而因此成长，她选择解放陆巴代替对他的惩罚，与被妖吞噬的曾是她的神器们战斗，来阻止情况进一步恶化……

毘沙门战争后，日和、夜斗和雪音三人间的距离缩短，变得更加亲近了。春天来到，日和通过了晋升考试，不用担心升入高中的问题，也已经习惯新的制服，她和朋友们开始期待新的校园生活。这时候耀眼的七福神之一，穿着笔挺西装的惠比寿出现了，说要买走雪音。他的态度不温不火，却扰乱了雪音的心……

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夜斗获得了属于自己的神社，十分高兴。另一方面，雪音开始有了作为道标的自觉，为了变强而拜托兆麻传授他术法。对夜斗如此高兴有些在意的日和，从小福那里听到了有关神明的事­­——“无名之神被人遗忘的话会消失”。得知了此事的日和，开始思考夜斗的过去。尽管夜斗试图迈出新的一步，野良却像要阻止他似的出现了。她的本意是……

自从夜斗消失之后，已经一个月过去了，小福这些彼岸的人们十分担心，而此岸的日和与夜斗相关的记忆也逐渐淡薄下去。这时在高天原的神议上，关于“傀儡妖兽术师”有了新的进展，七福神们被宣告了原型，众神惊愕不已，无法相信术师在七福神中。另一边，得到从黄泉带回一名术师就可以解放，摆脱父亲的束缚这个约定后，夜斗与野良一起出发，他们遇到的人是……

对于突然发生的亲吻事件，日和很是郁闷。与雪音的再会，让日和找回了过去一个月里忘记的“关于夜斗的记忆”，但夜斗依然不知所踪，日和对此十分焦急。另一边，夜斗，野良和惠比寿一面躲开伊邪那美的攻击，一面寻找着出口，但在黄泉伊邪那美拥有绝对的优势，他们陷入了困境。看着即便如此依然“立誓”不肯放弃的惠比寿使夜斗产生了困惑……

毘沙门等人为了拯救惠比寿很快来到黄泉的入口。在他们的面前突然出现了一个巨大的风穴。与此同时，雪音和日和也因为夜斗在黄泉的可能性而正打算到风穴去。但是，两人的面前出现了被毘沙门放逐的陆巴。雪音为了保护日和发动了兆麻教的束缚术“缚布”，但因不知陆巴的真名而无法束缚他变得越来越焦躁。从容的陆巴，用语言把雪音逼退……。

恢复了意识的惠比寿，提出了从黄泉救出了夜斗的“一个可能性”。“呼魂”——就是此岸的人窥视着黄泉的深渊，呼唤真名的方法。在风穴即将封闭的过程中，日和拼命呼唤着夜斗的名字……。另一方面，为了抢救夜斗而去了黄泉的毘沙门，也被伊邪那美所困。此外，在地面上，追逐惠比寿的天的讨伐队的身影终于出现了。

夜斗从黄泉平安返回地面。他们的喜悦是短暂的，等待他们的是与天的讨伐队激烈的战斗。为了守护惠比寿，夜斗用满身创伤的身体继续战斗。但是，夜斗最后亲眼看到的是，太过残酷的现实。全部都结束了，雪音和日和担心着失落的夜斗。和惠比寿的相遇，夜斗现在还有所心动，心里满是思念……。

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