Depois de descobrir que é um "Ajin" imortal, Kei Nagai sabe que será caçado. Por isso ele procura a única pessoa em quem pode realmente confiar.

À medida que Tosaki se encarrega da procura do governo pelo novo Ajin, Kei e Kaito são atacados por rufiões ansiosos por receber o dinheiro da recompensa.

Kei começa a aceitar os seus poderes de Ajin depois de ser empurrado para fora da estrada por um motociclista. Izumi visita a irmã de Kei para desvendar o seu passado.

Izumi riposta contra a figura misteriosa no quarto do hospital de Eriko. Depois de se separar de Kaito, Kei recebe um convite misterioso.

Quando Kei é alvo de terríveis experiências às mãos do governo, Tanaka pede-lhe que liberte o seu lado negro. Entretanto, Sato planeia uma missão de salvamento.

Quando Sato começa a chacinar trabalhadores no laboratório, Kei intervém para o impedir e descobre que os Ajin têm uma vulnerabilidade importante.

Com o seu emprego em jogo, Tosaki recorre a medidas extremas para descobrir mais sobre os Ajin. Sato aproveita os 15 minutos de fama para pôr em prática um novo plano.

Quando Sato revela os seus terríveis planos, um jovem Ajin chamado Ko foge. Kei encontra refúgio no campo e pratica a invocação do seu "fantasma".

À medida que Sato se prepara para iniciar os ataques, Ko encontra o esconderijo de Kei e pede-lhe ajuda. Tosaki tem uma visita surpresa.

Tosaki descobre novos detalhes acerca dos "fantasmas negros". Entretanto, os vizinhos da Sra. Yamanaka ficam desconfiados de Kei, e Sato finaliza o seu plano.

No dia previsto para os ataques, uma cena chocante ocorre na cidade. Sato prepara-se para um confronto com o esquadrão SAT.

Com o país inteiro a acompanhar a situação através da transmissão em direto, Tosaki aplica uma nova tática para parar Sato. Na aldeia, a identidade de Kei é descoberta.

Encurralado pela polícia, Kei invoca a matéria negra invisível numa tentativa desesperada para fugir com Ko. Sato anuncia a próxima vaga de ataques contra a Humanidade.

Enquanto se atrasava para ir a uma festa, Shinya Nakamura morre em um acidente de moto, mas revive e descobre que é um Ajin.

Quatro contos humorísticos do ponto de vista de Sato e Tanaka (2 histórias), Izumi e Tosaki (1 história) e Ko e Kei (1 história).

Sato inicia a sua "segunda vaga" e escolhe 15 pessoas que terão de ser eliminadas. Kei e Ko percebem que terão de obter ajuda exterior, e fazem uma proposta.

Kei e Ko habituam-se à vida na equipa de Tosaki e são visitados por alguém que pensavam estar morto. Sato disfarça-se para se preparar para um voo fatídico.

Tosaki elabora um plano para apanhar Sato, mas Kei sente-se deslocado na equipa. Entretanto, Sato avança para o segundo nome da sua lista.

O Departamento de Defesa dos EUA faz uma visita. Kaito, ainda prisioneiro, protege o seu companheiro de cela, Takeshi, vítima de um grupo de delinquentes.

Almeida e Myers interrogam Tosaki mas não consideram as suas respostas convincentes. A equipa prepara-se para o próximo alvo da lista de Sato, o ministro.

Com Tosaki capturado, Kei e os restantes membros da equipa são obrigados a alterar os seus planos. A ligação de Izumi a Tosaki é revelada numa analepse.

Kei e a equipa tentam intercetar o carro de Almeida, antes que consiga fugir para a embaixada dos EUA. Entretanto, Sato prepara-se para o próximo assassinato.

Kei tem uma última oportunidade para intercetar Sato, mas antes tem de pedir um favor desconfortável a Tosaki. Sato prepara uma arma secreta.

Culpando-se a si próprio pelo plano falhado, Kei abandona a equipa. Na posse de novas armas, Sato inicia a sua terceira vaga e invade uma base militar.

As Forças Especiais Anti-Ajin estão em vantagem, mas Sato inverte a situação. Kei e a sua equipa iniciam os preparativos para a batalha final.

As negociações de Sato com o governo não trazem resultados e o exército dos EUA é chamado a intervir. As tensões internas no grupo dos Ajin têm efeitos nefastos.

O exército dos EUA intervém, mas Sato parece estar sempre um passo à frente. Kei regressa à equipa. Tosaki é abordado pelo Ajin Okuyama, que tem uma proposta.

Sato pode ter sido apanhado desprevenido, mas tem um último trunfo na manga. Ele começa a eliminar os membros da equipa, um a um, e só Kei o pode parar.

Tem lugar imediatamente após a cena do prólogo do Episódio 1, o passado de Satou é explorado.