17살의 프로 기사 키리야마 레이. 부모님을 잃고 혼자서 살아가는 레이는 세상에 혼자뿐인 외톨이다. 하지만 그런 레이를 따뜻하게 감싸주는 세 사람, 아카리와 히나, 모모. 시끌벅적한 세 사람 사이에 있을 때만큼은 레이에게도 조금씩 온기가 돌아오는데.

NHK배 예선 대회에서 마츠모토 잇사를 꺾은 키리야마는 잇사를 위로하기 위해 아카리가 일하는 긴자의 술집으로 간다. 그곳에서 서로의 만남을 회상하는 두 사람. 술에 취해 아카리에게 추한 모습을 보여버린 키리야마는 아카리의 따뜻한 호의를 거절하지 못한 채 세 자매의 집에 드나들게 된 것이었다. 그리고 다가온 추석, 서로 다른 아픔을 지니고 살아가는 키리야마와 세 자매들은 함께 추석을 지내며 아픔을 나눈다.

프로가 된 후 첫 시합. 키리야마는 상대인 하루노부와의 어릴 적 장기 대결을 떠올린다. 백화점 옥상 장기대회, 한 여름의 무더위 속에서 땀을 뻘뻘 흘리면서도 승리에 대한 열망을 불태웠던 하루노부. 그리고 또 다시 돌아온 대결에서 하루노부는 과거와 같은 더위 속에서 또다시 키리야마를 꺾기 위해 전의를 불태운다.

짝사랑하는 남자아이의 야구시합을 위해 도시락을 준비하기로 결심한 히나. 전날 저녁부터 도시락 계획에 여념 없는 히나의 모습은 키리야마의 눈에도 행복해 보이기만 하다. 다음 날 정신 없이 도시락을 만들고 야구시합으로 향하는 히나. 하지만 도시락을 건네주기는커녕 말 한마디 못 건네고 도시락을 쓰레기통에 버리려고 하는데...

보육원에 모모를 데리러 간 키리야마. 하지만 집으로 가는 길에 모모가 강아지에게 쫓겨 상처를 입고 만다. 울먹이는 모모의 모습에 과거를 떠올리는 키리야마. 가족들의 죽음과 함께 혼자 남은 자신. 그런 자신이 본격적으로 장기를 시작함으로써 상처를 입고 망가져 가는 한 가정의 모습. 이 모든 게 키리야마에겐 아물지 못한 상처로 남아 있다.

프로가 되고 처음으로 연패를 기록하며 슬럼프에 빠진 키리야마. 선생님의 격려에도 키리야마는 좀처럼 슬럼프에서 벗어나질 못한다. 그런 키리야마에게 히나는 자신의 집에서 함께 밥을 먹자며 기운을 북돋아 준다.

계속되는 슬럼프에서 헤어나오지 못하고 있던 키리야마는 우연히 히나의 짝사랑 상대 타카하시를 만나게 되고, 타카하시와의 대화를 통해 용기를 얻게 된다. 타카하시를 초대해 식사를 하게 된 키리야마와 히나. 세 사람은 타카하시가 가져온 장기 영상을 보게 되고, 영상 속의 니카이도가 하는 조언을 들으며 키리야마는 조금씩 슬럼프에서 벗어난다.

히나와 모모에게 장기를 가르치며 니카이도와 가까워지는 시간을 갖게 된 키리야마는 동료들을 통해 니카이도가 자신을 목표로 열심히 노력 중이라는 사실을 듣고 마음을 다잡으려 한다. 그러던 어느 날 자신의 집에 쿄코가 찾아오고. 쿄코의 모습을 보며 키리야마는 앞으로 자신에게 다가올 험난한 미래를 예감한다.

기사 경력 40년의 마츠나가 7단과의 대국을 앞둔 키리야마. 자신이 마츠나가 7단을 은퇴로 몰아넣을지 모른다는 생각에 고민을 거듭하는 키리야마였지만, 결국 마츠나가 7단에게서 승리를 거머쥐게 된다. 대국 후 우연히 계단에서 마주치는 두 사람. 마츠나가는 키리야마에게 저녁을 사라고 고집을 부리고, 결국 두 사람은 함께 저녁을 먹게 되는데...

12월, 야스이 6단과의 대국을 마지막으로 한 해의 대국을 끝마치게 되는 키리야마는 쿄코에게서 야스이 6단의 이혼 소식을 듣게 된다. 대국에서 지면 술에 취해 주정을 부리는 야스이 6단과, 그런 그와 크리스마스를 보내고 싶어 하는 야스이의 딸. 키리야마는 크리스마스를 하루 앞두고 야스이와의 대국에서 승리해야 할지 패배해야 할지 고민한다.

한 해의 대국을 모두 마친 후, 키리야마는 심한 감기에 걸리고 만다. 아카리에게 이끌려 세 자매의 집으로 오게 된 키리야마. 한 해의 마지막과 시작을 아카리의 집에서 보내게 된 키리야마는 알 수 없는 안도감과 편안함에, 오랜만에 깊고도 포근한 잠에 빠진다.

새롭게 시작한 사자왕전 도전자 결정 토너먼트. 키리야마는 츠지이 타케시 9단을 만나 힘겹게 승리를 거머쥔다. 그리고 시합 끝에 마주친 고토. 쿄코를 모욕하는 고토의 언행에 키리야마는 이성을 잃고 만다. 앞으로 1승이면 고토와 맞붙게 되는 키리야마. 키리야마는 고토를 목표로 또 다시 승리를 다짐한다.

고토와의 대국을 앞둔 스미스는 대국 준비에 여념 없는 키리야마의 모습을 보며, 자신의 부족함을 깨닫는다. 고토와의 대국. 아무리 공격해도 무너지지 않는 고토에게 결국 스미스는 한 번의 공격으로 무너져 버리고 만다. 한편 고토와 마주할 날만을 기다리며 시마다와의 대국에 들어간 키리야마는 어느새 밀릴 때까지 밀려버린 자신을 발견하고, 시마다는 그런 키리야마에게 흥미를 갖기 시작한다.

고토와의 대국에 눈이 멀어 바로 앞의 상대를 쉽게 생각했던 키리야마. 하지만 계속되는 상황 악화에 키리야마는 자신의 어리석음을 깨닫는다. 시마다에게 보기 좋게 패배하고 부끄러움에 달아나 버린 키리야마는 또다시 방황하기 시작하고, 그런 키리야마를 달래던 담임 선생님은 시마다의 연구회 가입을 권한다.

드디어 시작된 사자왕전, 도전자 결정 토너먼트 결승전. 3판의 대국의 첫날, 수업을 듣던 키리야마는 선생님의 도움으로 장기회관에서 대국을 관람할 수 있게 된다. 첫 대국이 고토의 승리로 끝나고 드디어 시작된 두 번째 대국. 장시간에 걸친 대국이 막을 내리고, 시마다가 힘겹게 승리를 거머쥐면서, 결국 두 사람의 대국은 세 번째 경기만을 남겨두게 된다.

드디어 시작된 마지막 대국. 8시가 넘어서야 장기 회관에 도착한 키리야마는 시마다가 고토를 꺾었다는 사실을 알게 되고, 시마다의 연구회에 들어가게 된다. 연구회 활동이 시작되고, 대국과 검토 논쟁을 통해 장기를 향한 열정을 쏟아 붓는 네 사람. 키리야마는 혼자가 아닌 우리가 되어 장기의 세계에 다시 한 번 발을 내딛는다.

드디어 시작된 사자왕전. 총 7번의 대국의 시작에서 안타깝게 시마다는 첫 패배를 맞이한다. 아버지의 질문공세에 못 이겨 키리야마를 찾아온 쿄코는, 언제나처럼 키리야마에게 온갖 심술을 부려대지만, 고토에 대한 마음과 자신이 처한 현실에 괴로워하며 키리야마에게 의지하고, 키리야마 역시 쿄코와 진정한 형제도 타인도 되지 못한 채, 무거운 마음으로 새 학기를 시작한다.

사자왕전 세 번째 대국을 앞두고, 키리야마는 시마다 씨에게 개인적인 장기 상대가 되어 줄 것을 부탁 받는다. A급 기사와의 일대일 대국으로 인한 피곤함에도, 뭔가를 얻어내겠다는 일념으로 끈덕지게 버티는 키리야마. 한편, 키리야마와 쿄코의 사이가 마음에 걸렸던 히나는 모모와 함께 키리야마를 찾아오고. 둘이 남매 관계라는 말에 안심하지만, 그 소식을 듣게 된 아카리는 불안한 마음을 감추지 못한다.

야마가타 시골 마을에서 자란 시마다는 지역 노인들에게서 장기를 배우게 되고, 중학생이 되어선 아르바이트로 돈을 벌어가며 매달 2번씩 장려회에 다니기 시작한다. 동갑내기 소우야가 장려회를 벗어나 순위전에서 승승장구 하는 모습에 좁혀지지 않는 차이를 뼈저리게 느끼는 시마다. 하지만 그 무엇도 시마다의 노력을 막을 수는 없었다. 고교시절부터 위장병을 앓아온 시마다는 식사조차 제대로 하지 못하고, 키리야마는 그런 시마다와 함께 사자왕전 경기를 위해 교토로 향한다.

사자왕전 제4국 2일째, 이대로 소우야에게 4연패를 당하면 시마다는 고향에서 대국을 치르기 전에 사자왕전이 끝나고 만다. 독감에 걸린 츠지이 9단을 대신해 장기 해설에 나서게 된 키리야마는 후지모토 기룡과 함께 대국을 지켜본다. 시마다는 위의 통증을 견뎌가며 적극적인 공세에 들어가는데…

4월, 시마다의 고향 야마가타 현 텐도 시에서 개최된 인간 장기에 참여하게 된 키리야마와 시마다, 니카이도. 공교롭게 비가 오는 바람에 행사는 실내에서 개최되었지만, 지역 장기 팬들은 기사들을 따뜻하게 맞아준다. 서로를 생각하는 시마다와 현지인들의 모습을 보며 따뜻한 감동을 받는 키리야마. 한편 미카즈키 당에서는 미카즈키 빵에 이은 새로운 인기 상품을 만들어 내기 위한 세 자매의 고심이 시작된다.

2학년 새 학기를 맞은 키리야마. 하지만 지금껏 신경 써준 하야시다 선생님과는 떨어지게 된다. 새로운 반에서도 친구를 만들지 못한 채 여전히 겉돌기만 하는 키리야마. 그런 키리야마에게 하야시다 선생은 장기부를 만들 것을 제안하고, 도망치기 싫었던 키리야마는 하야시다의 응원으로 장기부를 만들기로 결심한다.

5월. 키리야마는 하야시다 선생님과 노구치, 오오타와 함께 장기를 두고 명인전을 시청하며 장화부 활동을 시작한다. 노구치의 도움으로 라무네 캔디를 직접 만들며 자신이 진짜 부활동을 하고 있음을 깨달은 키리야마. 들뜬 가슴을 안고 직접 만든 라무네 캔디를 챙긴 키리야마는 아카리와 히나, 모모 자매를 만나러 발걸음을 옮긴다.

장기 회관에서 명인전을 관람하던 키리야마는 의도치 않게 고토와 마주치게 된다. 시마다를 비웃는 장기 기사들에게 쓴 소리를 퍼붓는 고토. 누나를 괴롭게만 하던 고토의 또 다른 모습에 키리야마는 괴리감을 느끼고 만다. 한편 마지막까지 접전을 이어가던 명인전은 쿠마쿠라가 투료하면서 소우야의 승리로 막이 내리고. 조용히 분을 삭인 쿠마쿠라는 하코네를 떠나며 다음 승부를 기대한다.

신인전 결승에서 키리야마와 대국하겠다고 으름장을 놓는 니카이도는 장래 명인이 된 자신을 망상하며 열변을 토한다. 초연히 그 모습을 바라보는 키리야마. 하지만 스스로도 깨닫지 못한 자신의 속내를 니카이도가 꿰뚫어보자 키리야마 역시 적잖이 동요한다. 한편 새로운 화과자를 개발하기 위해 가족들과 머리를 짜내던 아카리는 평소와 다른 시무룩한 히나의 모습에 의아함을 느낀다.

초등학교 때부터 히나와 친하게 지냈던 사쿠라 치호란 아이가 반에서 따돌림의 표적이 되고 만다. 못 본 척하는 동급생들 사이에서도 치호에게 끊임없이 다가가는 히나. 하지만 히나의 노력에도 불구하고 결국 치호는 전학을 선택하고 만다. 그리고 마침내 괴롭힘의 화살은 히나를 향하기 시작한다.

따돌림 사건에 대해 하야시다에게 상담하는 키리야마. 하야시다는 키리야마게 당사자가 어떤 해결을 원하는지 잘 들어주라고 충고한다. 히나를 위해 자신이 할 수 있는 일을 필사적으로 생각하던 키리야마는 해결에 필요한 경비를 조달하기 위해 대국에 열을 올리고. 그런 키리야마의 모습은 니카이도의 열정에까지 불을 붙인다.

친구인 치호의 전학과 반 아이들의 따돌림으로 인해 괴로워하는 히나. 키리야마는 옆에서 히나의 얘기를 들어주려 하고, 히나 역시 그런 키리야마에게 학교에서의 얘기를 하나 둘씩 털어놓는다. 한편 키리야마에게 히나 얘기를 전해 들은 타카하시는 히나와의 캐치볼을 통해 괴로움을 달래주려 하고, 히나는 치호를 기억해주는 타카하시를 통해 마음의 위안을 얻는다.

담임선생님에게 불려가 상담을 받은 히나는, 상황을 회피하기만 하는 선생님에게 크게 실망하고 만다. 히나의 힘든 상황에 도움이 되지 못해 안타까운 키리야마는 더욱 승리에 목을 매지만, 그런 키리야마의 앞에 나타난 하치야 스바루 5단은 키리야마의 결승행을 더욱 힘들게 만들 뿐이다. 혀 차기, 다리 떨기 등 거슬리는 행동을 당당히 일삼는 하치야 5단. 그리고 마침내 신인왕 결승전 티켓이 걸린 준결승전이 시작된다.

하야시다 선생을 찾아가 히나 문제를 상의하는 키리야마. 여전히 해답은 찾을 수 없지만 하야시다 선생님의 충고와 응원에 키리야마는 조금 더 용기를 갖는다. 그리고 들려오는 니카이도의 입원 소식. 키리야마는 니카이도의 건강에 대해 묻기 위해 시마다에게 달려가고 시마다는 니카이도의 이야기를 키리야마에게 털어놓는다.

교토로 수학여행을 가기 전날, 레이와 함께 저녁식사를 하던 히나는 위의 통증을 호소하며 식사를 남긴다. 히나의 스트레스를 걱정해 수학여행을 말리는 아카리. 히나는 후회하기 싫다며 여행을 향한 강한 의지를 보인다. 이틀 후, 오사카에서의 결승전에서 승리해 신인왕 타이틀을 거머쥔 키리야마는 위통에 괴로워하던 히나의 모습을 떠올리며 히나를 찾아 교토로 향한다.

키리야마의 결승전 상대, 야마자키 준케이. 프로 6년차의 야마자키는 프로의 세계에서 느끼는 벽과 아껴오던 경주 비둘기의 행방불명으로 알 수 없는 슬럼프를 겪는다. 그러던 중 준결승의 니카이도, 그리고 결승에서 마주한 키리야마에게서 끊임없는 노력과 근성을 목격한 야마자키. 그리고 행방불명된 비둘기가 자신을 찾아 날아오는 순간, 야마자키는 슬럼프를 털어내고 다시 한 번 싸워보기로 결심한다.

신인왕에 오른 키리야마에게 소우야 명인과의 기념 대국의 기회가 주어진다. 기대하고 있다는 격려 말과 함께 주어진 명인과의 대국 기회로 한없이 들뜨는 키리야마. 한편 학교에선 장화부 부원들이 키리야마의 신인왕 등극을 축하해 주고, 키리야마는 사람들에 둘러싸여 있는 자신의 모습을 깨닫고 감격의 눈물을 흘린다.

수학여행이 끝난 후, 타카기 무리의 괴롭힘은 담임 선생님에게까지 손을 뻗치고 선생님은 정신적 스트레스로 인해 쓰러져 버린다. 새로운 담임이 된 고쿠부 학년 주임은 삼자 면담을 위해 히나와 타카기의 보호자를 부르고 학교 역시 문제 해결을 위해 움직임을 보이기 시작한다. 한편 삼자면담을 위해 학교에 방문한 아카리는 타카기의 모친과 마주하고, 타카기 모친의 모욕적인 언사에 제대로 대응하지 못한 채 얼어버리고 만다.

히나의 반에서 일어난 따돌림 사건에 드디어 학교에서 적극적인 개입에 들어가고 주동자와 일당들이 반 전체에 사과를 하며 사건은 드디어 막을 내린다. 다른 지역에서 상처를 치유해 나가던 치호에게서 히나를 초대하는 편지가 도착하고, 반 친구들 역시 히나와 조금씩 가까워지면서 드디어 히나에게 평화가 찾아온다. 한편 적극적으로 따돌림 사건에 개입하지 못한 키리야마는 죄책감과 미안함을 느끼지만 그런 자신에게 고마움을 표시하는 히나를 보며 키리야마는 다시 한번 작은 충성을 맹세한다.

기장전 대국과 비슷한 시기에 소우야 명인과 키리야마의 기념 대국 준비가 시작된다. 기장전 때와는 달리 화려한 홍보가 계속되는 기념 대국. 덕분에 기장전의 주인공인 시마다와 야나기하라는 서운함을 금치 못한다. 마침내 대국을 하루 앞둔 전야제 날, 명인과의 대국에 대한 긴장감 속에서 키리야마는 기념 대국 전야제로 발길을 옮긴다.

키리야마와 현역 최강의 기사 소우야 명인과의 기념 대국이 시작된다. 크나 큰 실력 차에도 불구하고 명인을 상대로 버텨내는 키리야마의 장기에, 대국을 보고 있는 관계자들 또한 크게 달아오른다. 하지만 한 수의 실수로 인해 키리야마에게 패배의 그늘이 짙어진 상황. 키리야마는 패배가 확정된 상황에서 포기하지 않는 최선의 수를 찾아 대국을 이어간다.

태풍 때문에 소우야 명인과 센다이에 머물게 된 키리야마. 숙소를 찾아 한숨 돌린 키리야마는 신구지 회장과의 통화에서 소우야 명인의 비밀에 대해 듣게 된다. 도쿄로 돌아온 후에도 대국을 반추하면서 소야의 과거 기보를 살피는 키리야마. 한편 입원했던 니카이도는 퇴원 후 왕장전 1차전에 출전해 보기 좋게 승리를 올린다.

드디어 시작된 기장전 마지막 승부. 야나기하라 기장을 상대로 2대 2까지 추격해온 시마다는 자신에게 불리한 대국장의 분위기에도 승리를 향한 집념을 불태운다. 66살의 나이에도 A급 기사의 자리에 꿋꿋이 버티고 있는 야나기하라 기장 역시 지금은 퇴역이 돼 버린 동료들의 소망을 등에 지고 대국장으로 향한다.

야나기하라 기장의 영세 타이틀이 걸린 기장전 최종국. 막판에 접어들며 대국은 시마다에게 우세하게 기운다. 장기의 길을 포기하며 떠나간 동료들과 야나기하라 기장에게 맡겨진 수많은 기대. 하지만 무거웠던 기대와 중압감은 패색이 짙은 상황 속에서 강력한 무기가 되어 야나기하라를 승리의 길로 이끌어 준다.

여름 방학, 치호를 만나러 간 히나는 치호에게 보이는 마음의 상처를 보며 마음 아파한다. 돌아오는 길에 히나는 치호에게 선물 받은 매실청을 모두가 맛있게 먹는 사진을 보내주리라 마음 먹는다. 이후 산가츠 축제에서 노점을 열게 된 미카즈키당은 히나와 아카리의 아이디어로 냉 찹쌀 경단 시럽 판매를 시작하고 미카즈키당 노점은 치호가 전해준 매실청 덕분인지 대성황을 이룬다.

여름 방학을 맞이한 히나타는 계속해서 떠오르는 아이디어 속에서 공부와 입시 문제로 전정 긍긍한다. 레이는 그런 히나타를 자신의 학교로 초대하고, 학교에서 즐거운 시간을 보낸 히나타는 레이의 학교에 도전해 보기로 한다. 자신을 위해 공부를 지도해주는 레이와 손수 야식을 만들어 주는 아카리, 학비에 대한 부담보다 손녀의 행복을 빌어주는 할아버지를 보며 히나타는 최선을 다해 고등학교 입시를 준비한다.

고등학교 입시를 앞두고 필사적으로 공부하던 히나타는 동급생인 타카하시가 먼 곳으로 진학한다는 소식에 충격을 받는다. 언제까지나 가까이 있으리라 여겼던 사람들이 하나둘씩 떠나가는 현실 앞에 슬퍼하는 히나. 결국 시험을 이틀 앞두고 한바탕 병치레까지 겪은 히나는 레이의 도움으로 마음을 추스르고 씩씩하게 시험장을 향한다.

과거 신세 졌던 양아버지의 집에 인사를 온 레이. 웃음으로 거북함을 감추며 레이를 맞아들인 양어머니는 레이와의 과거를 회상한다. 열심히 장기를 공부하며 모든 일에 성실했던 레이와 전혀 그렇지 못했던 자신의 자식들. 그리고 레이로 인해 무너지며 어긋나기 시작했던 아이들의 모습을 떠올린다. 작별을 고하고 자리에서 일어나는 레이를 양어머니는 무거운 마음으로 배웅한다.