미도리야는 힘겨운 노력에도 불구하고 체력 테스트에서 최하위를 기록한다. 하지만 미도리야의 가능성을 본 아이자와는 성적에 따른 제적 처리를 없던 일로 한다. 한편, 무개성이라 알고 있던 미도리야가 개성을 사용하자 카츠키는 잔뜩 화가 난다. 유에이 고교에서 새로운 친구들과의 고교 생활이 시작되고 드디어 올마이트가 담당하는 히어로 기초학 시간이 된다. 두 사람이 한 팀으로 각각 히어로, 빌런 역할을 맡아 전투 훈련을 하게 된 1학년 A반. 미도리야와 우라라카의 A팀은 히어로, 카츠키와 이이다의 D팀은 빌런으로 맞붙는다. 처음엔 움츠러들었던 미도리야도 카츠키에게 지기 싫은 마음에 마음을 다잡는다.

전투 훈련에 돌입한 네 사람. 미도리야는 카츠키를, 우라라카는 이이다를 각각 상대한다. 아직 개성을 조정할 수 없는 미도리야는 개성을 사용하지 않은 채 작전을 세우며 맞서고, 카츠키는 코스튬 장치를 이용해 점점 더 압박해 온다. 우라라카 역시 이이다를 상대하기가 쉽지 않다. 점점 격해지는 훈련을 지켜보던 올마이트는 교사로서의 입장과, 격정적으로 감정을 표출하는 미도리야를 멈추기 싫은 입장 사이에서 갈등한다. 무개성인 척 자신을 속여 왔다고 오해한 카츠키는 미도리야의 진심어린 말에도 아랑곳없이 달려들지만, 미도리야와 우라라카의 합동 작전에 빌런팀은 히어로팀에 패하고 만다.

힘겹게 노우무를 물리친 올마이트. 시가라키와 쿠로기리는 끝까지 올마이트를 상대하려고 하고 올마이트의 활동 한계 시간은 다 되어간다. 이를 눈치챈 미도리야는 그들에게 달려들고 시가라키에 의해 목숨이 위험해진 순간 유에이 고교의 교사들인 프로 히어로들이 도착한다. 시가라키와 쿠로기리는 탈출 후 빌런 연합의 배후들과 훗날을 기약한다. 올마이트는 프로 히어로 못지않게 용감히 빌런에 맞선 1학년 A반 학생들을 자랑스러워 한다. 한편, 또 다른 적은 어둠 속에서 모습을 드러내는데...

히어로 킬러 추종자인 토가, 다비가 빌런 연합에 찾아오자 시가라키는 화를 낸다. 모두 다 함께 합숙을 떠나게 된 1학년 A반은 들뜬 마음에 쇼핑몰에 가기로 한다. 혼자 남게 된 미도리야는 시가라키를 만나서 이야기를 나누게 되고 우라라카 덕분에 위험한 순간을 벗어난다. 시가라키는 올마이트에 대한 적개심을 불태우고 여름방학을 앞둔 미도리야는 히어로를 향한 노력을 계속한다.

호크스가 준 책에 충격적인 경고가 암호로 숨겨져 있었다니! 이번 인턴 교육의 진짜 목적도 이해하게 된 엔데버. 결국 현재 넘버 원 히어로인 그가 직접 학생 지도에 나선다.

미도리야는 역대 계승자들의 개성을 이용해서 레이디 나강에게 맞서지만 실패한다. 전직 공안 직속 히어로였던 레이디 나강은 자신이 히어로 사회를 혐오하며 올 포원의 계획에 가담한 이유를 말하는데...