MacGyver und Jack suchen mit Hilfe einer Mikrowelle und einer Steckdosenleiste nach Riley, nachdem sie auf mysteriöse Weise verschwunden ist und sich in die NSA gehackt hat, wodurch möglicherweise der Dritte Weltkrieg ausgelöst wurde. Außerdem geht Bozer auf seine erste offizielle Mission, und Jack erzählt von seiner Vergangenheit mit Rileys Mutter Diane.

Nachdem sich einer von Murdocs Auftragskillern bereit erklärt hat, Murdoc im Tausch gegen 10 Millionen Dollar an MacGyver auszuliefern, muss das Team Murdoc vor seinem ehemaligen Mentor Nicholas Helman beschützen, der ihn töten will. Außerdem wird Jack klar, dass er immer noch Gefühle für Rileys Mutter Diane hegt.