在二百四十三年前的圣战中被雅典娜封印的冥王哈迪斯率领108魔星同时从黑暗的深渊中复活。在刚从与海皇波塞冬结束战斗，暂时恢复平静的圣域，圣斗士的墓穴被挖开，新的危机已迫在眉睫。 在穆守护的白羊宫出现了一个谜一样的男子。他命令穆在十二小时内取下雅典娜的首级。知道这名男子真实身份的穆不能违抗他的命令，但同时也不能去杀雅典娜。在他苦恼之际，眼前出现了两个身影，原来是曾经身为守护圣域的巨蟹座的迪斯马斯克和双鱼座的阿布罗迪。两人被冥界之王哈迪斯赐予了短暂的生命。穆因为那个神秘男子的命令而不得反击，只能暴露在成为冥斗士的两人攻击之下。正在这时，天马流星拳在周围炸裂，原来是察觉圣域异变的星矢来支援穆。但是，穆却向星矢发动了攻击！

到达双子宫的撒加面前出现了双子座黄金圣斗士，但是撒加识破了这是加隆在远方操纵圣衣，直接向加隆攻击。击破加隆幻觉的撒加等人向下一宫进发。 天蝎座米罗因为感觉到了异样的小宇宙，来到雅典娜处探寻。由于撒加的攻击，他发现了教皇密室的加隆，于是不顾雅典娜的阻止，向加隆释放猩红毒针。加隆受到攻击后也完全没有反击，米罗虽然感觉到加隆的忏悔，但是为了让他谢罪仍继续释放猩红毒针。最后他原谅了一直忍耐到最后的加隆，承认他是双子座的黄金圣斗士，然后自己返回天蝎宫。 另一方面，在东西伯利亚怀念妈妈的冰河面前出现了成为冥斗士的白银圣斗士。被冰河的小宇宙打飞出去的白银圣斗士们，看到了青铜圣斗士们的成长，脸上露出了欣慰的微笑。

赶到巨蟹宫的穆面前出现了哈迪斯的真正的冥斗士，他们追问撒加一行人的去向。原来撒加他们在与沙加的小宇宙直接冲突时产生的爆炸中不知所踪了。在地暴星独眼人准备向穆发起进攻时，星矢出现了。但是，突然有人将二人的行动封住了，这人正是地妖星缪。他认为撒加一定先去雅典娜所在之处，所以命令独眼人先去前面的狮子宫。巴比隆在星矢面前现身，竟然是人类无法想象的一堆不定形物。穆对他发出攻击后突然变成了一条毒虫，并且从嘴里喷出了蚕丝，把穆赫星矢封进了茧中。然后缪把自己也包在了茧中，完成了最后的进化，穆让星矢先去狮子宫，自己一个人对付缪。面对冥界之蝶的缪，穆使用星光灭绝取得了胜利。

剩下的冥斗士成了沙加的对手，独眼人以为在冥想中的沙加是在躲避战斗，全力攻击之余却被沙加的“天魔降服”轻松击败。 把冥斗士们全部打倒后，沙加想问清楚撒加他们的真正心意，但是他们只是宣称要夺取雅典娜的首级。面对这三位黄金圣斗士觉悟到要死的沙加把他们带入了传说中的沙罗双树园，展开最后的战斗。沙加用最大奥义“天舞宝轮”将他们五感逐一剥夺。走投无路的三人只能使用神话时代以来就被雅典娜禁止使用的终极影之斗法——雅典娜之惊叹。为了不使复活并为哈迪斯的走狗失去意义，他们宁愿承受污名使出了雅典娜之惊叹。

史昂向星矢他们说出了沙加和雅典娜之死的意义，并且道明了全部真相。史昂手上沾满了神血，朝向雅典娜神像发出了召唤，因为这些血，雅典娜神像变成了女神的圣衣。 为了女神的圣衣的复活，必须要女神自己的血，知道这一切的只有当时是教皇的史昂一人。为了这个目的，史昂借着哈迪斯的诱惑，趁机进入了十二宫。因为一直处在哈迪斯的监视之下，撒加他们只能隐瞒真相，甚至不惜使用雅典娜之惊叹。史昂用雅典娜的血使青铜圣衣复活，他以教皇的名义命令青铜圣斗士深入哈迪斯城，打倒哈迪斯。 比星矢他们早一步到达哈迪斯城的穆等人受到了拉达曼提斯的攻击，无法前进。这时，穿着全新圣衣的青铜圣斗士们出现了。