藤堂比奈子是警视厅搜查一科的新人刑警。她总是随身带着母亲的遗物七味罐，无论什么东西都要撒上七味粉，所以被大家视为怪人。这天，一科接到报案，有人发现了宫原秋雄的尸体。一听到这个名字，比奈子马上说此人因涉嫌猥亵曾被捕三次，让上司厚田严夫大吃一惊。实际上，比奈子把过去十年内市内发生的未解决案件和性犯罪嫌疑人的资料都记在了脑子里。因为记忆力超群，比奈子被指派随前辈东海林、仓岛敬一郎去现场调查。面对被用刀切开下半身的尸体，同行人一时间都惊得说不出话来，而比奈子却很平静。而且，她发现尸体的状况与三年被杀的女高中生的遗体一样。东海林在现场发现了宫原的手机。手机中存有宫原被人袭击的可怕视频。第二天，比奈子与东海林调查曾被宫原袭击的受害者时，在受害者宇田川早苗家门口遇到了心理医生中岛保。他们从宇田川早苗的父母中得知，四年前被宫原侵害的宇田川早苗在三个月前自杀了。她自杀的原因是再次遭到宫原骚扰威胁。与此同时，法医妙子主持的尸检结果表明，宫原的伤的确与三年前死去的女高中生一样。然而，这些伤是宫原本人自己弄出来了。这意味着宫原是自杀。不过，厚田无法认同这一结论。这时，网上出现宫原死去时的视频。视频是通过某非法APP自动向网站上传的，看起来是有人在案发前就策划好一切。因此，警方不能将宫原当成单纯的自杀案处理。正在此时，公园里又出现了一具女尸。这次的受害者是比奈子的同期、交通科巡查铃木仁美。她被害前的视频也开始在网上传播。警方调查发现仁美生前曾与宇田川早苗的未婚夫齐藤联系，而研发视频传APP的人也是他。齐藤承认有人告诉他仁美生前被宫原迫害的事，出于仇恨，他同意对方要求制作了APP，但否认杀了宫原和仁美。比奈子来到仁美被害的地方，意外地看到中岛。

　　空地上，扔着一辆被遗弃的冷冻车，不远处坐着两具经过冷冻的尸体。解剖结果显示，两名死者是兄弟，是在被害后才被冷冻、丢弃的。警察为了找出遗体的身份，开始追踪调查冷冻车的来源。另一方面，在东京拘留所内，死刑犯鲛岛离奇死亡。妙子说这和前几天在拘留所里被认为是自杀而死的杀人犯大友一样疑点颇多，因为他们都是用当初杀害他人的同样手法方式自杀的。传言是被害者的怨灵上了凶手的身，而妙子和比奈子都认为一定有科学的解释。为了验尸，比奈子与妙子一起来到拘留所。在那里，她又遇到来此给服刑者提供咨询的中岛。比奈子认为杀人犯的行凶动机是某种冲动，对此，中岛不以为然。他给比奈子的忠告是“犯罪者的心理绝非用普通方法可以判明的”。终于，追查冷冻车弃尸案的厚田等人找到了有相关冷冻设备的商店。然而，比奈子和东海林到现场时才发现这间店三个月前就关门了，如今只剩下空壳。本应住在那里父亲和三个子女也失踪了。而后院里的大型冷冻库却一直在运转。他们打开门一看，里面竟坐着一个老人和一个女性的冷冻尸体。经调查，老人是商店的店主霜川幸三，女性是他的长女由美，而早前发现的两兄弟便是幸三的儿子。比奈子注意到由美的脸上呈现出古怪的笑容。经鉴定，幸三死于两年前，是自然死亡，死后被冷冻。妙子解剖结果显示，霜川家的孩子身上都有旧伤，系长年受虐待所致，而由美则做过剖腹产。中岛看到案件报道后，给比奈子发邮件阐述了他对于犯人特征的分析。东海林也看到了中岛的信，他本想甩开比奈子独自调查却被比奈子跟踪，只得和她一起行动。与此同时，厚田等人发现霜川家还有其他人生活的痕迹。这时，东海林与比奈子找到了幸三买给情妇的房子。在搜查时，东海林被人用电击枪击昏，比奈子独自与凶手对峙。

　　比奈子家附近有个被居民们称为鬼屋的废屋，某天，那里发现了四具尸体，尸体各自都有一部分被切走。被害者全是年轻女性，犯人将她们杀害后，给尸体换上事先准备好的衣服，切走身体的一部分。厚田听东海林说，在前几天的冷冻杀人案中，中岛曾为警方提供了犯人的特点，于是，他决定这次的案件也请中岛做顾问。另一方面，比奈子与仓岛一起进行调查，遇到了少女吉田遥香，遥香证说发现尸体的前一天她曾在鬼屋看到一个穿雨衣的妖怪。而且，一周前，遥香在自家附近见过同样的妖怪。在调查中发现，遥香的母亲佐和附近开洗衣房的佐藤都夜交情莫逆。都夜对比奈子、仓岛说佐和以前被男跟踪狂纠缠，遥香所谓见到穿衣雨衣的妖怪可能就与此有关。比奈子从给受害者穿的衣服尺寸都很合身这一点，推测犯人可能是设计师。而根据妙子的检查结果，犯人切取受害者器官的凶器的确是设计师专用的特殊剪刀。这时，法医妙子对比奈子谈起前几天被认为是自杀的宫原、大友、鲛岛三人的共同点。这三人的大脑内相同的地方都发生了肿瘤，然而原因却不得而知。就在此时，中岛来到搜查本部。警方发现跟踪佐和的、自称是设计师的男人永山宗一郎与两名受害者有关联，但是，没有掌握决定性证据，不能逮捕他。不久，比奈子接到都夜电话，说佐和被一个男人用车子带走了。比奈子赶到时，公寓里只剩下失去意识的遥香。遥香被送往医院，为帮她拿换洗衣服，比奈子跟都夜去了洗衣房，随后坐上了都夜的车一起去医院。在途中，比奈子收到中岛的关于凶手特征的邮件，然而，她的意识开始渐渐模糊。东海林等人追踪永山来到鬼屋，在附近发现永山开的小货车。然而，当他们冲进鬼屋时，却见喉咙被切开的永山的尸体。作为警方请来的专家，中岛分析犯人切走受害人身体的一部分，是想变成她们那样，因此，他断定凶手是女人。正如他所言，比奈子清醒后看到站在她面前的正是身穿雨衣的都夜，而用最近的被害者的皮肤做的套装就放在一边。都夜说，只要再割走佐和背上的皮肤，她的“皮衣”就大功告成了。

　　四个女性受害者的遗体被切走一部分，在新的案发现场附近居住的佐和遭人绑架。与佐和关系亲密的佐藤都夜说佐和以前曾被跟踪狂纠缠。然而，实际上，连续杀人案和佐和被袭全是都夜所为。她的目的是拿到这些女人的美丽皮肤。而且，看上了比奈子脸部皮肤的都夜把比奈子也绑架了，准备用她脸上的皮做面具。都夜拿着剪刀就要对比奈子下手。发现犯人真面目的东海林和中岛四处寻找比奈子。比奈子割断绳索，与都夜搏斗。在千钧一发之际，在电视上播放了被认为是自杀但死状离奇的宫原和鲛岛死亡时的影像。据称是有人匿名将录像交给电视台的。节目中，中岛的上司、心理诊所院长早坂雅臣作为嘉宾出镜。他称这种现象为“神的裁判”，并说会凶恶犯罪起到遏制作用。警方从电视台没收了DVD。在DVD中除了早前离奇自杀的宫原和鲛岛的画面，还有一个穿白衣的医生用注射自杀的画面。再加上警方所知的杀害小学生的男人突然用刀自刺心脏，杀人犯大友在拘留撞碎自己的头，一共是五件自杀案。厚田指出这是有人要把一连串案件公之于众，他指示部下一定要彻底调查那些被故意引诱自杀的人，全力阻止新的犯罪发生。

　　比奈子和东海林得知某公寓发生血案，赶到现场后，发现一具少女的尸体，死者口中被塞满糖球，与五年前没有破解的猎奇杀人案极为相似，仿佛是五年前的犯人要炫耀自己的存在。东海林要求这次案件也请中岛协助调查。比奈子知道中岛是五年前案件的第一发现人，因此非常担心，不过，中岛却说这是他直面过去的恶梦的良机。与此同时，比奈子和厚田在妙子那里看到某篇未发表的论文。论文的主题是对犯罪者的大脑给予直接刺激、控制他们的情感，作者正是中岛和早坂。据说因为涉及伦理问题，所以他们的研究中途受挫，不过，妙子觉得那不过是障眼法。这天晚上，在空无一人的院长室，中岛打开了早坂的电脑。另一方面，东海林怀疑迄今为止的一起离奇自杀案件是早坂所为。他和比奈子一起去诊所，并指出自杀的五个人的交集正是早坂诊所。比奈子也提到论文中举过诱使人自杀的方法做例子。对于东海林的逼问，早坂矢口否认，反叫他们拿出证据。其实，早坂与中岛已经找到能潜入犯罪者内心的方法，并可通过装置控制犯罪者的神经。这时，中岛发现早坂为了向世人宣传神之裁判，操纵五前年杀死少女久留美的凶手久保再次杀人。深感被早坂背叛了的中岛决心报复。

　　中岛被捕后，比奈子一直没有精神，厚田和仓岛十分担心她，而只有东海林觉得比奈子情绪低落是假装的，而且对比奈子十分警惕。这时，公园发生了杀人案。被害者遗体口中塞入了大量的一百日元硬币。解剖结果显示，死者的死因是有人用特殊工具经由死者的嘴往其胃里灌入了大量硬币。那些硬币加起来足有一百万之多，媒体称之为“百万杀人案”由于遗体的指纹被毁，身上所有的物品也被拿走，所以，厚田指示部下收集可以证明死者身份的证据和目击者证言。厚田也和比奈子一起进行调查。不久，二人遇到在街上被自行车撞伤的老人稻富信吾。他们送稻富回家时，发现他所住的地方是一所无家可归的老人共同生活的合租房“十八家”。又过了数日，调查毫无进展，又有口中塞满硬币的死者被发现。另一方同，比奈子听妙子说中岛被送进了一家“精神、神经研究中心”SNRC。SNRC表面上是与人体研究有关的学术机构，实际上是专门针对犯了罪的天才科学家和猎奇杀人犯的隔离矫正设施。中岛在机构中负责在犯罪心理帮助警方调查异常犯罪案件，而他的联络人正是比奈子。这时，因为调查受挫，东海林再次与情报线人藤川接触，藤川不但拒绝向他提供情报，反而要他提供比奈子的履历。

　　正当东海林开始怀疑比奈子有异常犯罪的潜质时，经常为他提供情报的线人藤川被杀。由于与藤川有纠葛而受到怀疑的东海林被厚田排除在藤川一案调查之外。另一方面，辖区内连续发生四起服用除草剂自杀的案件。死者手中握着的遗书上都写着“把活过的证据托付给AID”，警方怀疑有人送毒药给受害者、协助他们自杀，于是从毒药入手进行调查。在调查中，比奈子再次见到“百万杀人案”中认识的派出所警察原岛。原岛正为藤川的事而担心东海林，他相信东海林深知生命的可贵所以不会杀死藤川。很快又出现了第五名服毒自杀者。在死者遗体旁边有临死前留下的信息——“AID”，这次的现场很像杀人案现场。妙子解剖遗体后发现，这一连串的自杀事件使用的除草剂都是25年前制造的，大约是协助自杀者在这种除草剂停止生产前保存的。而与此同时，比奈子听说原岛的儿子多年前因被一个跳楼自杀者砸中而意外身亡，其妻因悲痛过度也服毒自杀了。此后，警方发现AID是一个有自杀意愿的人集中的网站。鉴证班全体人员为了找到网站的幕后主使而奋战。比奈子也把这一案件向给中岛，请他分析犯人心理。另一方面，东海林接到电话，对方称有些关于比奈子的事要告诉他。

　　东海林谴责比奈子怀着杀人之心不配做警察。比奈子决定辞职。她前去看望中岛。中岛听了她的打算后，劝她再重新考虑一下，然而比奈子不为所动。与此同时，搜查一科接到消息，被送到拘留所附近医院就医的连环杀人犯在杀死看守后逃跑了。那个犯人正是连续杀害女性并剥取受害者皮肤的佐藤都夜。厚田告诉不了解都夜逃跑原因的比奈子。原来，都夜被捕后仍对比奈子怀着强烈的执念，所以提醒她对自己周围要多加注意。东海林秦命保护比奈子。另一方面，在市内出现了连警察也没见识过的奇异的动物死尸，尸体中被塞进了人类的器官。妙子说在其他地方也发生过类似事件，而最初的案件发生地，正是比奈子的故乡。

　　 被东海林看穿内心想法的比奈子决定辞职，不料这时对比奈子怀有强烈执念的佐藤都夜从医院逃跑。因为比奈子是都夜的目标，厚田命东海陪比奈子住在酒店。然而，就像是在嘲弄警方计划似的，都夜突然在比奈子住的酒店附近出现。刑警片冈在追踪都夜时，向一个女性询问，却突然被对方挥刀刺中。这人正是在比奈子高中时送匕首给她并诱导比奈子按本性杀人的神秘女子真壁永久。见到真壁，比奈子目瞪口呆。真壁留下一番话后消失了。另一方面，东海林被真壁绑架监禁起来。得悉真壁的恐怖计划后东海林也心惊胆战。被真壁玩弄于股掌之上的比奈陷入困境，不知该不该如真壁当初所言成为杀人者。一直以来怀着对杀人者强烈的研究兴趣与罪犯对峙，站在犯罪边缘的比奈子，与结下恶缘的女人真壁的重逢，让她最终得出了结论。