Le 6 novembre 2009, un tremblement de terre d'une magnitude de 7,8 a frappé le quartier de Shibuya a Tokyo. Au même moment, un étrange feu noir s'est propagé et a provoqué la panique des habitants. Ces événements auront causés 3851 morts et 30 927 blessés.

Nous voilà désormais dans le nouveau quartier de Shibuya en octobre 2015. Une série de morts mystérieuses semblables à celle de 2009 commence à faire parler. Très vite, la panique s'installe...

La présence des stickers de sumos correspond toujours aux scènes de crime. Le club de journalisme de Hekihô mène alors l’enquête, mais leurs membres seront vite dépassés par les événements…

Suite à l’agression de Nono, le club de journalisme doit se faire petit. Ses membres auront pourtant l’occasion de rencontrer Watabe, celui qui a repris leur vidéo, lors de la fête du lycée. Toutefois, les festivités seront de courte durée…

Takuru, Onoe et Shinji se rendent à l’hôpital AH Tokyo suite aux informations qu’ils ont obtenues. Alors qu’une atmosphère étrange règne dans les lieux, ils découvriront un passage dans le sous-sol, endroit qui semblait pourtant bien caché.

Shinjô essaie d’interroger la jeune Uki, mais cette dernière insiste pour retourner d’où elle vient, à l’hôpital AH Tokyo. Par ailleurs, Takuru apprendra qu’il possède des pouvoirs et qu’il est en fait un Gigalomaniac.

Uki est confiée à la pension Aoba, et il s’avère qu’elle était la camarade de classe de Yui en primaire. Plus tard, Takuru et ses camarades essaieront d’en savoir plus sur l’identité de la femme qui utilise la pyrokinésie.

Nono décide de tout avouer à Takuru concernant le passé de Senri, et elle finira par lui faire une révélation-choc. Le jeune garçon, Mio et l’inspecteur Shinjô tenteront plus tard de comprendre les objectifs du coupable…

Nono a trouvé qui se cachait derrière les crimes récents, mais elle devra en payer le prix… Takuru sera ensuite accusé d’être le coupable de la nouvelle folie New Generation et cherchera de l’aide auprès de Hinae, Mio et l’inspecteur Shinjô.

Takuru raconte à Mio, Hinae et l’inspecteur Shinjô les souvenirs de son passé aux côtés de Serika, jusqu’au jour du séisme de Shibuya et la raison pour laquelle le jeune garçon a terminé dans le sous-sol de l’hôpital AH Tokyo…

La deuxième fête de la résurrection de Shibuya commence, et tous attendent avec impatience le suicide programmé de Takuru Miyashiro. Malgré les avertissements de Serika, ce dernier décide quand même de se rendre là où tout a commencé…

Takuru est maintenant prisonnier des mains de Sakuma. Totalement perdu et impuissant, il tentera alors le tout pour le tout en faisant appel à celle qui a toujours répondu présente pour lui : son amie d’enfance, Serika.