저, 마가타 연구소에 다녀왔어요.′ 국립 나고노 대학의 부교수 사이카와 소헤이는 은사의 딸이자 지금은 자신의 제자인 니시노소노 모에가 천재 프로그래머 마가타 시키 박사와 면담했다는 이야기를 듣고 놀라움을 감출 수 없었다. 그 반응을 본 모에는 사이카와에게 어떤 제안을 하는데.

마가타 연구소가 있는 히마카지마로 세미나 여행 온 사이카와와 학생들. 세미나 학생들이 캠핑을 즐기고 있는 와중에 모에는 사이카와와 연구소를 찾았다. 연구소의 부소장인 야마네는 시키와 연락이 되지 않는다는 사실을 두 사람에게 전하고 그녀가 무사한지 확인하기 위해 15년 동안 시키의 허락 없이 열 수 없었던 시키의 방문을 열기로 결의한다.