博人、佐良娜和巳月被木叶丸带去执行第一个任务，但任务仅是击退盗贼的D级任务，还与猪鹿蝶小队同一天出征。在第七班到达目的村庄绿之畔之后，木叶丸察觉到这次任务并非如委派的一样只是击退盗贼、保护粮仓，邻村苍之谷也委派忍者，试图对绿之畔发动攻击，而这样的任务评级至少在B级以上。新任村长伎璃在木叶丸的要求下说出苍之谷进行攻击的真相，即敌人希望获取大桥的所有权证。如木叶丸所预料的一样，敌人在夜间再次对村庄进行袭击，所有村民也都被施以幻术，正当第七班试图找出施术的忍者时，却发觉方才出现的村长消失不见。

苍之谷试图以村长伎璃为人质要挟对方交出桥的所有权证，而个性耿直的伎璃总是想要通过一个人承担一切来守护绿之畔，村民因此恳请第七班能够救出村长。木叶丸将任务进行分配后，第七班便携带着桥的所有权证前去敌人驻地，同时提醒各位要照计划相似。到达目的地后，一行人目睹敌方将一名中间人杀害的过程，以此提出以权证来交换村长的要求。木叶丸答应条件后伺机将救出的村长委托给第七班带回村里，可自己却在与敌人交手的过程中身陷囹圄，虽随后使用打穿树林威力的螺旋丸脱险并夺回权证，但也使得敌人追赶上博人他们。这一次，第七班没有独断专行，而是齐心协力将敌人击退，在一侧观战的伎璃也从其中感受到与同伴为伍的真正感觉。

堇、山葵和泪组成的第十五班受日向花火带领，接受捕捉动物的任务，花火希望三人之间能够互相信任完成任务，但堇因为以前鵺事件而犹豫是否向山葵和泪坦白。三人小队在身着动物服装后开始任务。山葵和泪在任务中发生一些不必要的争吵，泪却在独自捕捉狛猿的过程中遭遇大鬣狼。幸而，赶到的山葵与堇及时帮助泪脱离危险，三人通力合作完成任务。随后，堇也向队友坦白鵺会袭击村子是由于她的命令，最后依然得到同伴的谅解。

我爱罗前往木叶出席考试的途中遭到大筒木浦式偷袭，到达村子后对佐助和水影长十郎汇报。高层察觉到大筒木一族会袭击考试，但由于这是首次五大忍者村联合举办的中忍考试，因此决定进行考试的同时做好完全准备。由天天监管的第二场考试是在战斗中率先获得战场中的旗子，博人过于轻敌而险些使旗子落入敌手，只能借助科学忍具使出强力水遁将对方击败，巳月察觉到博人的意图但选择不说。片助的左右手躲在监控室旁观察博人的一举一动，但最终仍然让他们顺利晋级下一场考试。待博人回到家之后，鸣人专程回家鼓励并恭喜博人，嘱托他不要输给鹿太，得到父亲认可的博人也为此感到开心，而辉夜卷轴的解读仍然在紧张地进行着。

鸣人消失且生死未卜，雏田跑去阻止桃式却也身受重伤，就连巳月被抽走查克拉而在病房监护；其他村民则在得到鸣人的保护之后只受到少许的波及。博人醒后极为自责，承认自己的一时私心而伤害到身边的人，但佐助感应到鸣人还活着，而其余四影和佐助齐聚火影办公室研究敌人的弱点并商讨战术，准备出发去解救鸣人。佐助打算带博人一起去，向四影解释他相信着博人的缘故，稍作收拾之后，一行人前往鸣人的所在地。

鸣人因为自作主张将大蛇丸之子巳月带入村子而受到木叶长老的指责，同时他也获知博人和佐良娜私自出村。萌黄于是带领鹿太、小蝶和井野新前往追赶博人和佐良娜，希望尽早将他们带回来。博人在佐良娜的掩护下成功潜入大蛇丸的住所，却意外见到其他和巳月一样的试验体。大蛇丸通过博人带去的小蛇，发觉巳月已经进入第二阶段，让博人意识到自己从未真正了解巳月。在外的佐良娜遭受大和等多名监视研究所的上忍追赶，即将被抓之际巧被香磷救出。最终，大蛇丸将蛇自身会产生的思念告诉博人和佐良娜，并说明龙地洞之主白蛇仙人可以帮他们从小蛇中了解到更多信息。博人及佐良娜随后便前往追寻，但路途中却遇到萌黄班的阻拦。

离开龙地洞后，鹿太希望小蝶和井野新先回村汇报情况，其他三人则奔赴土之国继续寻找巳月。鸣人和鹿丸前往医院看望受伤的守卫，得知巳月被几位岩隐村忍者带去土之国。炸伤的有梨人侥幸生还，而爆炸物也被查明为岩隐村禁术起爆粘土。而巳月与岩隐忍者石英和黑曜即将靠近土之国边境，准备将巳月带回去见他们的头领“空大人”；他们一行人都是“人造”诞生，因此需要身为大蛇丸人造试验体的巳月，以此深入研究来延长他们当下短暂的寿命。井野新和小蝶在回村的路上发现几位被攻击的木叶追踪班，而鸣人致电土影黑土告知木叶遭到被岩隐忍者袭击的事实，并希望黑土给予帮助。同时，黑曜和人造生物“芥”在边境攻击几位木叶追踪班，而博人三人则恰好赶到现场，与黑曜正面交锋。

大野木在众人面前承认他身为空在内的岩隐“人造人”之创造者，称是为了守护未来和平而需要强大的战斗力来保护村子，因此需要类似巳月的人造“试验体”。博人等人把握时机跟空展开战斗，但面对成群的芥而只能先撤退，博人独自救出将被石柱压倒的大野木，而鹿太不慎被芥擒拿而关在黑土旁边的笼子里。黑土自责是自己间接导致这件事发生，源于五年前岩隐村受到村内叛忍攻击而死伤惨重，大野木便制造“芥”的原型借以提升村子战力，但被自己以五村协议及尊重为由而否定，但未预料到大野木会将计划继续实行。黑土和鹿太不希望对此袖手旁观，意图离开封印的笼子；除了博人带着大野木撤离村外以外，分散的佐良娜和小蝶也一同撤到村外。

受伤静养的大野木无法阻止空的行动，霎那间意识到这些人造人对生命的渴望，开始怀疑自己的过错。云母通过控制博人和佐良娜拿刀自相残杀，但后来得知空已经准备更换心脏，便丢下他们俩自生自灭。佐良娜也趁机为自己解除幻术，随后帮助博人脱离。两人及时赶到试图阻止准备将一颗人造心脏交给空的巳月，但巳月依然拒绝听从，刚达到目的的空开始放声大笑，但紧接着被身后的巳月一掌刺穿身体。空跌下楼奄奄一息，发现心脏仅是巳月用白蛇伪装，巳月仍旧表示这是“自己的意志”，博取对方信任再找时机反击，这让他回到博人和佐良娜身边共同作战。而此时，大野木终于醒悟而逃离监禁，刚被释放的黑土以及赤土则分头作战进行反击，释放所有被囚禁的忍者准备夺回政权。

偶然回村的佐助得知当天是亲子日，于是带正在修炼的佐良娜去集市逛一逛，但佐助没有带女儿的经验，并且也无法理解佐良娜的心思，导致他们父女无法像别的父女那样亲近。卡卡西用《亲热天堂》为佐助出谋划策，可反而让佐良娜更加心烦。博人随后劝佐良娜有什么事情想和父亲做，不如就直接说出来。在小樱的建议之下，佐助前往训练场找到练习手里剑的佐良娜，听到孩子坦诚的答案，陪佐良娜完成训练，也表示他会支持自己女儿将来当上火影。

在重吾和第七班的努力下，只剩下湖水北侧和部分隐蔽的木叶雁未能得到救助，佐良娜也按时提醒重吾注射药剂。随后的一天中，第七班将感染的木叶雁装进笼子里，随后却发现被莫名的人放走，寻找药剂的佐良娜也发现镇定剂全部丢失，重吾陷入完全咒印化。进入村内的重吾肆意破坏，川之国的人通过注射强力镇定剂暂时抑制重吾的暴走，村长极力拒绝木叶忍者继续协助他们村子。而另一边，第十五班在回村的路上遭到两名咒印化忍者的袭击，山葵和泪均感染咒印而被带回原先委托任务的村子看护，唯独堇在鵺的帮助下暂时才得以逃脱。博人一心想要救助的村民和木叶雁，却连咒印化的同伴都不知如何处理。

第七班在任务中抓寻偷窃宝石的盗贼后，警卫队由于证据不足只能将四位嫌犯释放。他们在执行完任务之后遇到一只走失的小猫，商量之后决定让巳月暂时照顾它。巳月在宠物商店为小猫买食物和玩具，并给它起名为“三日月”，巳月晚上回家之后也陪小猫一起玩。翌日，小猫突发不适，巳月带其前往宠物医院，而小猫在途中被一名嫌犯偷走，其先前让小猫吞下宝石。在博人和佐良娜的帮助下，警卫队将窃贼抓获，小猫也在治疗后恢复健康，并时不时会回到巳月身边。

未来听小巽说附近有可以见到死去之人的温泉，在内心犹豫之后还是与之前往。小巽向未来叙说自己想见其妈妈的原因，以及想要告诉妈妈的话；未来同时希望见到已故父亲阿斯玛。两人在路上遇到从温泉回来的人，便在其带领下前往复活温泉。见面的仪式需要至少20人才能凑齐，未来和小巽恰好补足欠缺的人数，遂被带往一洞穴内拜见所谓龙奇殿下。龙奇自称学习改进秽土转生之术，可以在不辱没望亡灵情况下，让人们见到亡故之人。然而，龙奇的真实身份却引起怀疑。

木叶丸和博人没能等到朝木，便主动去寻找她报告情况。负责调查的两人看到外出的柑橘，木叶丸对其进行跟踪却被发现，柑橘还要求对木叶村提出抗议。博人看到外出的朝木，朝木却对他不加理睬，并跟着柑橘前往祠堂里。博人私自跟去见到正打算毁坏发簪的柑橘和摔倒在地上的朝木婆婆。被发现后，博人和朝木相继被柑橘击中，失去一段记忆，带着发簪逃走的博人在崖边失足落水。木叶丸回到村中接受火影暂时对其禁足的处罚，并接受宵村的一切指控。柑橘决定提前举办婚礼，也将此事告知了柠檬。博人回家翌日与佐良娜、巳月一起去吃汉堡，咬下超酸柠檬汉堡的瞬间想起柠檬，却不认识她；回家路上碰到小蝶的博人，再次想起抱着柠檬飞跃的木叶丸，依然想不起来对方是谁；直到遇见那天的发卡，才逐渐回忆起发生的这一切。木叶丸也找到可能有效的解决方法，来帮助村民击败走马。博人找到木叶丸后，两人一同前往橙村拯救柠檬。

博人一早准备找佐助修炼，雏田不由得提起鸣人小时候找其师父自来也修炼，博人的好奇心也放在从未听过的自来也身上。博人和佐良娜一齐踏上寻求自来也所著小说《亲热天堂》系列作品的一天，分别碰到志乃、牙和丁次，但几乎每人都刻意转移话题，称呼这本书对他们来讲“还太早”。一天搜寻一无所获，博人和佐良娜只能作罢。回到演习场，博人从佐助口中得知鸣人和自来也之间亦师亦父的关系。当晚，电视里播放本地考古团队在海中寻找到疑似来自古代遗迹的神秘物件，而鹿丸向鸣人汇报消息，大筒木浦式正在火之国境内四处搜刮查克拉。

自来也辨识出佐助的身份，却仅将其视为一个玩笑，毕竟“根本不可能”。自来也随后希望佐助能提供浦式的情报和技能，答应不再追究他们的身份。博人再一次回到训练场与鸣人进行查克拉同步的训练，结束后一同吃一乐拉面时，博人问起了村里叛逃的下忍一事，知晓佐助为了替家族报仇、为了获得力量追随大蛇丸、意图斩断所有羁绊的真相。当博人与鸣人的训练逐渐熟练时，小樱由于先前捡到佐助掉落的纸条，上面即使浸水模糊但清楚写着“佐助”、“佐良娜”等字样，博人意识到这是佐良娜为佐助留下的晚餐信，只能尽可能搪塞过去。隔日，浦式再次偷袭训练中的博人和鸣人，两人无法招架其攻击，自来也和佐助虽然及时赶到，但浦式用鱼竿刺伤自来也，佐助最后也无力还击。

井野新执行任务时无法使出还未熟练的心转身之术，因此找小蝶与父母进行特训，但他也无法用心转身之术控制住小蝶想吃薯片的欲望。当井野新想半途而废时，井野和佐井开始争论谁能正确教导井野新，随后从争吵发展为激烈打斗。想让父母和好的井野新以此作为动力，正确使出心转身之术劝阻井野，再由小蝶说服佐井上前对井野拥抱，不仅成功让父母和好，并且还熟练忍术而一举两得。

博人充当天道的护卫期间，虽然对天道财大气粗的态度难以忍受，但发现天道也有着当忍者的梦想，于是答应教导天道投掷手里剑。天道练习时从不会到会、一直到抓到诀窍，最后投出去正中靶心而让博人十分欣慰，天道的管家山岗讲述天道从小同样缺少父亲陪伴，因此多年来靠收集的完整激·忍绘卷卡牌系列参加比赛，希望能引起父亲注意。博人逐渐从天道身上看到过去自己的影子，于是将自己的一张七代火影·鸣人之卡牌送给天道作为奖励，并认同天道为自己的朋友。但护卫任务结束的博人前脚刚走，山岗已被强盗团首领证城寺再次靠尸分身之术取代，躲在天道身边准备下一步行动。

小蝶得知她爱去的甜品店的货物补给被一群专抢稀缺资源的山贼盯上，于是自告奋勇陪红豆躲在运送车上保护货物。然而她们与山贼对抗过程中不慎造成山石崩塌，红豆负伤且受困山洞中，处于苗条状态的小蝶无法使用蝶化之术，只能迅速将一袋食物烹煮后食用来恢复体形。为了阻止山贼将货物抢跑，小蝶以保护她最喜欢的食物作为动力而熟练蝶化之术，一举抓获山贼以外还救出红豆，将货物顺利送到店家手中，恢复招牌甜品的供应。

博人一行人遇见由雷影亲信奥摩伊带领的云忍三人小队，得知他们同样知晓柱间细胞出现在默之国的传闻，为了安全起见而打算先回收。两队便达成共识一起行动、追踪敌人，过程中得知三兄弟来自以暗杀及禁术闻名的霞之国。然而不久，在默之国得到所需情报的迪帕现身拦路，奥摩伊的小队决定留下来断后，但三人即使联合作战都无法对敌身强体壮、拳速惊人的迪帕，仅能想办法拖延时间。逃亡中的三兄弟为了防止样本失控，只能尽可能慢速赶往边境，意识到他们即将会被追上后，三兄弟中的夕方同样决定留下来断后争取时间，将他们四胞胎的标志耳环交给大哥朝方后，一人堵住博人一行人的去路。

木叶村举行第四次忍界大战阵亡者的追悼会，全体村民纪念并缅怀各自在战争中牺牲的家人及战友。鹿丸和井野分别纪念在忍者联军本部的爆炸中牺牲的父亲鹿久和亥一，仔细思索他们彼此看着父亲背影长大、最后被他们托付打败十尾的使命，困惑当时父亲们是否相信他们能成功。追悼会结束时，麦野伴随着当天结识的前雾隐忍者青，一同前来纪念死去的战友。青作为联军本部爆炸的唯一幸存者，经过多年复健加上片助提供的义肢而恢复生活机能，巧遇鹿丸和井野而为他们讲述，鹿久和亥一在晴明最后一刻都相信着他们能成功。青的解答让鹿丸如释重负，使鹿丸同样决定有朝一日将使命传承给儿子鹿太。

博人一行人在片助和忍犬茶丸陪同下抵达飞艇坠落现场调查，转眼间就遭到飞艇周边的多具科学忍具构造的自律型傀儡攻击，身穿战斗动力服的片助使用两副护臂吸收所有攻击，最后使所有傀儡过热而停运。众人随后靠茶丸的嗅觉追踪至木叶丸和麦野的藏身山洞，双方都认为科学忍具技术已落入敌手。这时，手持加特林机枪的青来到山洞前准备将他们灭口，一行人难以相信不久前才见过面的好心人转眼间就拔刀相向。不听劝阻的青夺下片助的一副护臂、使他能靠此吸收忍术，麦野试图阻止却被青以双刃查克拉刀刺穿身体，最后之际使用土遁忍术引发山洞崩塌而与敌人同归于尽。众人仅能率先撤退出去，但青也很快爬出石堆继续追杀任务。

鸣人带领川木观摩木叶村各处，途中碰巧撞见在买鲷鱼烧的佐良娜和小蝶。随着鸣人大方请客，川木首次吃到街边的美味小食，但心里仍然提防着周围的外人。三人走进井野的花店购买一个新花瓶时，川木随意挑到一个手工制的浅绿色花瓶，但后来不慎将手中的花瓶看成自己受困慈弦残忍实验时的景象而受到惊吓。目睹川木被创伤阴影困扰，鸣人走上前拥抱并安慰他，佐良娜也慢慢决定接纳他。鸣人和川木共同享用完一乐拉面后回家，而博人虽然欣慰川木愿意赔礼道歉，但还是坚持他用强力胶将小葵的碎花瓶恢复原状。这时，果心居士和迪鲁达来到村外，居士命令迪鲁达原地待命后独身穿过感知结界，神不知鬼不觉地潜入村内寻找川木。

身心被桃式占据的博人轻松制伏怪物之身的博罗，靠吸取一部分鸣人的九尾查克拉施展巨大螺旋丸而将博罗彻底消灭，最后将身体主导权还给博人。而博人醒后却不记得这段经历，一行人便迅速将鸣人救回木叶。经过两天的住院养伤，鸣人在家人陪伴下平安苏醒，康复的佐助从佐良娜和巳月的供述中得知博人被“附身”的事情，意识到桃式的意识仍保存在楔中，并由之前的战斗细节得出慈弦本身也是容器的结论。川木因解救鸣人的英勇举动而得到博人其他同伴的信任，让他开始对其他人敞开心扉，即使得知他仍然受到鹿丸的质疑及监视。而木叶一方同时也决定不再对壳组织坐视不理，靠目前为止搜集到的所有关于组织的情报逆流而上。

佐良娜和小蝶作为从小一起长大的挚友，却也被迫在第三场决赛中对抗彼此，小蝶为了当上中忍而努力战斗过程中，佐良娜却不忍心对自己的朋友下重手。面对小蝶不留情的奋力攻击，佐良娜回想起前一晚被父亲佐助教导关于忍者的觉悟，纵使她醒悟而同样决定全力以赴。经过一连串的激烈战斗，两人分别发动最强招数千鸟和蝶化之术冲向彼此，最后是佐良娜的千鸟更胜一筹而获胜。落败的小蝶被同伴鹿太和井野新扶持离场，虽不甘心却也无怨无悔。另一边，博人和巳月偷看到阿玛多被一群来自川之国的敌忍挟持，目睹阿玛多并没有为了利益而投靠敌人，由此放心的博人迅速出手而轻松击退敌人、救出阿玛多，最后与巳月全速奔向考试会场。

电气奉命带领第五班执行自己成为中忍后的首个B级任务，携带片助最新研制的三架多功能自律性傀儡，抵达水之国雾隐村的一座以金矿开采闻名的邻岛“怒涛岛”协助危险地区的开采工作。在委托人的带领下，电气克服自己初次任务的紧张感，活用自己的科技强项，操控傀儡在狭窄岩壁中轻松采集到黄金。然而当中两名私吞黄金的矿工意识到即将暴露而立即抢一袋金子逃跑，走前将所有人反锁进密不透风的矿山中。但电气靠熬夜而事先熟悉矿山的布局，不费工夫就靠傀儡凿出一道出口，随后带领岩部和梅塔成功抓回两名内贼，出色表现使他们集体获得委托人称赞。而当科学忍具班的人前来会合时，使第五班准备进行任务的下一环节。

青炼隐藏身份潜入造船之岛上秘密会见弟弟竹筏，命令竹筏回归家人身边、协助一族的使命，声言她们急需竹筏运用与生俱来的强大力量、足以支配大海的“海龙之力”。然而已习惯和平及造船生活的竹筏拒绝与家人为伍，青炼只好强行使弟弟改变主意，但先决定等到当天夜晚进攻。与此同时，神乐获知雾隐村高层仅会为文淡、巨峰和蛇莓减刑三年，偷听到这一切的蛇莓不甘心毫无回报地返回监牢生活，决定暗杀神乐而脱离咒印控制。由于文淡和巨峰拒绝参与，独自去动手的蛇莓不巧被神乐抓到现行，最后不顾神乐的劝阻而败逃。然而当蛇莓思考下一步时，碰巧看到迎面而来的青炼舰队。

博人目睹神乐遭重伤而在愤怒的引导下再次觉醒楔的力量，爆发出强大实力将海蛆痛击至败逃。重伤濒死的神乐将保护村子的使命交托给博人一行人，并拿出自己事先写好用来保释三人众的请愿书，最后在众人的目视下英勇牺牲。葬礼后，佐良娜在众人全票支持下接替总队长一职，失去朋友的博人陷入悲愤，一心只想让舟户一族血债血偿，而佐良娜、巳月和川木逐渐担心博人会再次被楔控制。另一方面，海上战场逐渐形成持久战，天马按捺不住焦急的情绪，为了向当年收养自己的父亲荒海证明自己的实力，不顾一切率队攻向长十郎的舰船。然而长十郎早已预先设伏，造成天马的部队全军覆没，远处的渔利目视重伤的天马被长十郎击落至海中，同样决定让对方血债血偿。

第七班三人抵达雾隐村却发现去迟一步，长十郎早已率领舰队抵达东云一号机前进行严防死守。由于海上风暴的原因而没有船主愿意冒险，一筹莫展的博人一行人受到赶来的舵木师傅协助，开战前穿越风暴及时抵达东云前找到长十郎谈判，表示自己见过竹筏最好的一面，认为自己有能力劝阻他。即使许多人认为博人的想法是痴人说梦，但长十郎仍决定相信一次博人，但为以防万一而表示自己将不会撤军，第七班则独自乘船冲在舰队前方。而舟户一族舰队在竹筏的优秀驾驶技术及力量引导下成功穿越海上风暴，眼看东云近在咫尺而动员所有海盗准备迎战。随着大战在即，还在村庄中窝里斗的第五班及文淡和巨峰终于放下兵器，姑且达成共识而奔向战场。

竹筏目睹曾经携手同行的博人随同佐良娜和巳月前来谈判，当下发动海水力量摧毁三人搭乘的船而切断他们的后路。博人震惊于竹筏的改变，无论如何静下心劝阻就是无法让竹筏改变立场。而竹筏同时带出因博人而丧父的小鲋，声言自己与全体舟户一族只能与雾隐村拼个你死我活，除非博人为他取下水影长十郎的首级。与此同时，荒海驾驭修复完成的移动要塞抵达战场，开始为远射武器充能而准备一举摧毁东云。深感不妙的佐良娜和巳月希望博人能罢手，但博人最终在众人面前摘下护额，准备以自己一命终结憎恨。随着海上血战在即，第五班与二人众仍在想办法抵达，而不为人知的是，川木偷偷尾随第七班，并且潜伏在海盗移动要塞上。

鸣人一家因小葵抽中特等奖而得以享受一次温泉旅行，这也是川木首次体验舒适的温泉、美食及双打桌球。泡完温泉的博人和川木参与旅馆里的盖章寻宝活动，未知这间旅馆是未来伴随卡卡西和阿凯曾住过且折腾过一晚的“幽灵旅馆”。两人寻章过程中深感受人尾随，盖完章后得到全家福留念的奖励。离开旅馆的博人和川木看合照时惊恐地发现，照片中的他们俩身后站着不存在的武士幽灵。

花老师带领全班到学校附近森林进行野炊以及“三人一组”的实战演习，当向日葵、花咲与奏纱分为一组、并在训练中遥遥领先时，川木不巧与好胜心强的苏儿和油女羽理华分为一组，因此要同时暗中保护花咲免受伤害、以及尽量帮小组取得高分。而午餐期间，班上的男同学练切手揉由于隔天将参加点心制作比赛，因此打算向同样喜爱糕点的花咲征询一点建议，但无意间将她约在森林禁区的大树下。向日葵率先找到花咲后与她遭遇森林猛兽火焰熊的追杀，即使有花老师前来掩护却势单力薄，最后还是靠川木空手打倒熊而化險为惠比寿。手揉向花咲致歉后得到建议，同时就此崇拜川木而愿意拜他为师，而川木也及时回去帮小组在最后训练中取得第一名而挽回面子。

川木决定陪向日葵回到学校查实自己是否多心，与其他同学一起欢迎平安康复出院的花老师回课上教授，但花老师不仅自责未能保护学生免受伤害，还完全不记得自己为何会出现在爆炸现场。为了查实一切，花老师开始挖掘丧失的记忆，偶然遇到川木时突然浮现出自己两度对战川木的模糊记忆，返回家中还发现一间暗藏武器与面具的密室，惊恐地意识到盯上花咲的刺客其实是她自己；一直以来被自己童年时为了在刺客考核中生存而产生的“邪恶内在人格”牵着走，隐藏身份潜伏在木叶村长达数年。了解真相的花老师本想去自首，却直接被自己的邪恶人格掌控住身体主导权，本体意识则被锁入内心世界中，无助又无奈地看着自己即将对心爱的学生们下手。

佐助寻找考德踪迹期间路过烈陀国，回忆起自己多年前为帮罹患不明疾病的鸣人寻找治疗方案，远到烈陀国寻找曾在此国治愈过相同疾病的六道仙人之有关线索。而当时卡卡西前去接触烈陀国都城的纳纳拉王子来借阅有关资料，佐助则自告奋勇去调查六道仙人造访期间长居过的天文研究所。然而该研究所当时变成由神秘所长赞斯鲁监管的劳改营，佐助仅能靠冒充囚犯的卧底形式潜入，与三名友好囚犯吉吉、本吉拉和甘诺成为牢友。然而佐助很快发现该地异常凶险，赞斯鲁驯养着一头本已灭绝的“龙兽”“玛瑙”巡视着设施内外，而找线索过程中经过短暂试探，却发现无论是玛瑙或是具有特殊义眼的赞斯鲁均能抵御瞳术，而玛瑙受伤后甚至隔天就恢复如初，使佐助的潜入变得困难重重。