スミレが、念願だった“科学忍具班”に行くことになり、ワサビとなみだだけになった第十五班に新しいメンバーが入ることになった。そのメンバーとは、“侍（さむらい）”と呼ばれる者たちが暮らす“鉄の国（てつ　の　くに）”から来た少女、鉄（くろがね）ツバキだった。ツバキは、忍者は侍と違って誇りも信念も持たない者たちだと考えていて、忍者を見下していたが、これに対しワサビは、「忍者にも信念はある」と反論。第十五班は険悪なムードになってしまう。

いのじんが、母のいのが使う“心転身の術（しんてんしん　の　じゅつ）”を使いこなせるようになろうと考え両親に相談。チョウチョウにも手伝ってもらい、早速修業をすることになる。父のサイも見守る中、母との修業を開始したいのじん。だが、自信のなさもあってかうまく術をかけられず母をいらだたせる。見かねた父がなだめようとするものの母のいらだちはおさまらず、ついには夫婦ゲンカへと発展!?　何とかしようと焦るいのじんにチョウチョウがかけた言葉とは？

脱獄の準備を整えているはずのサラダから「準備完了」の合図がないまま、脱出用の船の到着時間が迫っていた。この機会を逃せば計画は台無しになってしまうため中止するわけにはいかないと考えるボルトは、サラダを信じ、ミツキやコクリとともにこのまま計画を進める決意をする。　一方、鬼灯城の地下に落下したサラダは、そのときの衝撃で気を失ったままでいた。

数々の難関と看守の目をくぐり抜け、ボルトたちの脱獄作戦が始まった！

テントウの護衛任務を終え、サラダやミツキとともに、新たに高難度の“Bランク”任務につくことになったボルト。大張り切りのボルトだが、ポケットの中から、欲しかった“ゲマキ”のレアカードを見つけたボルトは、それがテントウの仕業だと気づき、カードを返すためテントウ父子が滞在するホテルを訪れる。ところがボルトはそこで、テントウの身に危険が迫っていることを知る。

大切な“友達”のため、ボルトが下した決断は!?

”科学忍具（かがくにんぐ）班”に異動になったスミレに代わり、”鉄の国（てつ　の　くに）”から来たツバキが加わった第十五班。ところが、優秀な“侍（さむらい）”であり、高い能力値を誇るツバキが加わったにもかかわらず任務の成績は思ったよりも振るわず、共同任務ではイワベエたち第五班に手柄を奪われる始末。そこで第十五班はツバキの提案により、己の力を磨きつつ、任務で誰が一番活躍できるかを競い合うことになる。だが、この勝負がさらなる任務の失敗を招くことになる。

Using intel obtained from Shojoji the leader of the Mujina Gang, Sai and Sasuke journey to the Hidden Rain Village to find a location thought to be the hideout of an organization known as "Kara, the Husk.

Leaving Mitsuki in the care of Yubina, a doctor and friend of Mugino, Boruto and the others go to a black market in the Land of Silence, a dangerous and lawless gathering place for disgraced ninja. Team 7 make it to a shop located in the most dangerous district whose owner knows all the latest news. After a scuffle with the bodyguards, the team finally gets ready to ask the shopkeeper for information.

Boruto and the team finally catch up to the real thieves, two ninja brothers from the Land of Kasumi. Yuga uses a Forbidden Jutsu to summon a monster, and seals it and the team inside a strong barrier. Naruto insists on defeating it and getting out of the barrier. But Mugino argues that unnecessary fighting should be avoided since they don't know how to counter this special jutsu.

Boruto and Sarada convalesce at the Leaf Hospital while Mitsuki returns to Orochimaru's for treatment. For Boruto and Sarada, their inability to fight back against Deepa turns from frustration to resolve. Meanwhile, Konohamaru gives the Hokage his report regarding the incident, and in order to investigate the connection with the Kara more thoroughly, he asks that he be allowed to conduct surveillance on Victor's company.

Under Kakashi's watchful eye, Boruto succeeds in powering up his own style of Rasengan. And he demonstrates his progress in a battle against an opponent of Kakashi’s choosing. Meanwhile, Sasuke and Sakura switch places to train their daughter. With firm resolve, Boruto and Sarada continue their training and begin to see the results of their hard work.

Boruto and Sarada rush to Victor's research lab where they find a horrifying plant stealing the chakra of the people near it. As they work with Konohamaru to try to bring it under control, Deepa appears!

The Yamanaka Clan, who have been tracking the village’s ingoing and outgoing traffic with their advanced sensory abilities, spearheads a plan to create a new sensory system and an operational test is conducted.