Analytikeren Joe oppdager at CIA har brukt en algoritme, som han har utviklet, for å spionere på amerikanske borgere. Han oppdager også en terrorplan som truer livet til flere millioner mennesker.

Joe unnslipper IEP, men han er fortsatt ikke trygg. Usikker på hvem han kan stole på, vender Joe seg til Bob Partridge. I mellomtiden etterforsker en spesialstyrke massakren.

Joe blir nødt til å flykte sammen med Kathy, og Marty mistenker at hennes team har en muldvarp. Reuel begynner å tvile på Bobs lojalitet.

Reuel og Marty håper at Caleb Woolf er nøkkelen til å fange Joe. Bob forsøker å presse Joubert for informasjon, samtidig som en avgjørende plan blir satt i verk i Riyadh.

Mae plages av spørsmål angående sin manns død. Caleb forteller Joe om sin CIA-kilde. Joubert og Boyd møtes ved Kathys hus, og gjør et kritisk funn.

Ytterligere en person som står Joe nær blir funnet død. Bob Partridge deler sin teori om IEP-angrepet med Sharla. Iris gir Mae informasjon som setter begges liv i fare.

Joe fortsetter å samle bevis. Bob initierer et oppdrag uten Reuels tillatelse. Mae får ny informasjon om Sam og Elden, og Nathan konfronterer Gareth.

Deacons traumatiske fortid havner i fokus. Mae gjør et skremmende funn. Målet for terrorplanen avsløres, og Joe prøver å overbevise Janice og Caleb om å hjelpe ham.

Joes moral blir satt på prøve, når han forsøker å stoppe epidemien fra å spre seg.