Brillant entrepreneur de la Silicon Valley, Jeffrey Tanner est un visionnaire en matière de technologie. Sa nouvelle invention, Sophie, est une plateforme en ligne de partage d'informations destinée à réunir des indices susceptibles d'aider à résoudre les affaires criminelles. En premier lieu, Tanner espère retrouver l'assassin de sa fille, Mia. Pour l'aider, il implique Tommy Cavanaugh, le policier qui enquêtait alors sur le meurtre de sa fille avant d'être retiré de l'affaire. D'abord réticent, celui-ci comprend très vite le potentiel d'une telle technologie...

La disparition d'un adolescent de 13 ans est signalée. Jeffrey Tanner et son équipe vont tout mettre en oeuvre pour le retrouver. Ils comptent énormément sur l'application "Sophe"...

Les données de criminalité sont introduites dans le logiciel "Sophe", créé par Jeffrey Tanner. L'objectif est de rechercher des liens avec le meurtre de sa fille Mia. Au lieu de cela, le logiciel relie à présent trois cas qui semblaient pourtant ne présenter aucune similitude. Pire encore, lorsque Tommy Cavanagh ajoute un indice à "Sophe", il relie plus de quatorze cas. Avec une aide extérieure, le chiffre risque d'augmenter encore considérablement. Parallèlement, Carlos Ochoa subit des menaces en prison...

Jeffrey Tanner fait face à des cyberattaques lorsqu'on lui demande de résoudre le meutre d'un suprémaciste de la race blanche. Tanner et sa femme sont en désaccord au sujet d'informations privées, qui concernent leur fille décédée, et qui ont été transmises à "Sophe" pour faire avancer l'enquête...

Un inspecteur, qui avait arrêté de travailler en raison de gros soucis de santé, est assassiné. Cavanaugh n'est pas autorisé à s'occuper de l'affaire, en raison des contacts qu'il a eus au préalable avec l'épouse du défunt. Il se rend alors chez Tanner, afin de lui demander de l'aide. Pendant ce temps, l'entreprise de Tanner affirme qu'il est à l'origine du vol du code qui a permis la création de "Sophe"...

Un expert en informatique a créé un jeu qui cible les adolescents fragiles, les poussant à se suicider. Pendant ce temps, un indice qui concerne la fille de Tanner apparaît sur une photo...

Alors que Cavanaugh tente de reprendre contact avec son fils de 14 ans, il est interrompu dans sa démarche lorsque l'équipe identifie un terroriste en liberté. Les problèmes juridiques en cours creusent un fossé entre Tanner et Sara. Quant à Alex, elle décide de confronter Tanner au sujet de l'enquête sur le congrès. L'équipe perd le contrôle de la situation, ce qui pourrait avoir des conséquences dramatiques, voire mortelles...

Une attaque numérique déclenche une situation de crise puisque la plateforme ne fonctionne plus. Tanner et son équipe s'empressent d'arrêter les coupables, les contraignant à conclure un marché avec un rival indigne de confiance. De leur côté, Cavanaugh et Sara interrogent trois suspects au sujet du décès d'un PDG de la Silicon Valley...

Tanner espère enfin pouvoir obtenir de nouvelles preuves dans l'affaire "Mia". Mais uniquement si le programme "Sophe" arrive à prouver l'innocence d'une personne dans une affaire de meurtre. Tanner et Sara commencent également les dépositions avec la société "AllSourcer" concernant des droits d'auteur du travail de Sara et du code de "Sophe"...

L'équipe va devoir utiliser "Sophe" pour traquer un tueur particulier, qui cible les personnalités. Le mode opératoire du meurtrier est classique. Il s'attaque aux célébrités et diffuse ensuite leurs derniers moments de vie, via une plateforme. Parallèlement à cette affaire, Sara va enfin savoir si elle est légalement autorisée à travailler avec Tanner sur le programme "Sophe" ou si elle est à jamais bannie de la plateforme...

Tariq doit faire face à une affaire délicate qui concerne son ami d'enfance, qui est la cible d'un harceleur qui semble violent. L'équipe décide d'utiliser «Sophe», mais aussi la foule, afin de permettre à la personne ciblée d'éviter des attaques. Tanner tente désespérément de localiser un individu récemment expulsé. «Sophe» a réussi à l'identifier comme un témoin clé dans le meutre de Mia...

Jeffrey et Tom parlent à Carlos, qui a été reconnu coupable d'avoir tué Mia. Il leur fournit de nouveaux éléments, qui concernent leur suspect inconnu. Il se souvient en effet d'un homme en train de prendre un selfie avec Mia sur son téléphone et donne un indice précieux qui permettrait de trouver cette fameuse photo...

Tanner et Hale se rendent au tribunal pour convaincre le juge de libérer Carlos. Pendant ce temps, un homme, littéralement obsédé par «Sophe» et par le meurtre de Mia, est retrouvé mort. Avant son décès, il a rempli son sous-sol de preuves en lien avec la théorie du complot. L'équipe n'est d'ailleurs pas encore au bout de ses surprises. En enquêtant sur cet homme, Tanner découvre des informations qui le relient à l'assassinat d'un responsable municipal...