Pese a las reticencias de Elias, Chise comienza su nueva etapa de estudiante. Tal vez sus nuevos estudios la ayuden a comprenderse mejor a sí misma y a no a arriesgar su vida para ayudar a otros como tantas veces hizo anteriormente.

Chise no se separa de Lucy, quien ya lleva diez días en coma tras el incidente en el que perdió su maná. Mientras, enfrenta la decisión que tomó para salvar su vida, se pregunta qué ocasionó el incidente y el profesorado descubre un serio incidente que podría tener relación con el tabú de lo que ocurrió con los Webster.

Elias decide participar activamente en la búsqueda de la causa de la pérdida de maná de algunas personas en la escuela, y todo debido a la implicación de ese libro tan peligroso conocido como 'El Testamento de Carnamagos'.

Mientras las cosas se complican bajo tierra para Chise y Zoe, en la superficie, la abuela de Philomela se prepara para hablar con la decana mientras esta se dispone a tomar medidas especiales ante los sucesos recientes.

La academia está confinada debido a los recientes incidentes, así que es momento de que el profesorado imparta unas clases especiales a los alumnos: supervivencia y defensa.

Estando encerrados, los estudiantes deben procurarse sus alimentos a la par que están atentos para un posible ataque, aunque a Chise le preocupa la situación de cierta persona a la que considera una amiga.

Los estudiantes siguen encerrados, pero el responsable de los ataques sigue su curso y se produce un nuevo acontecimiento que da un nuevo giro a las cosas.

El confinamiento sigue adelante, pero Chise comienza a sentir cerca el libro de hechicería y a su usuario.

Ahora que se ha descubierto que Philomela era quien poseía el Grimorio, la situación cambia por completo. Aunque algunas personas la dan por perdida, Chise no quiere abandonar a su amiga.