O Prof. Franxx confronta o alto escalão da APE, discordando do que fizeram com Kokoro e Mitsuru, e a atitude deles o leva a refletir sobre seu passado, as escolhas que ele e a humanidade fizeram, e os caminhos que tomou.

Hiro e Zero Two partem para o planeta natal da VIRM com o intuito de derrotá-los, enquanto o resto do Esquadrão 13 faz de tudo para que a volta na Terra volte a ser o que era.