Após o regresso de Mitsuru e Kokoro da reeducação, o Dr. Franxx confronta a APE pelos seus atos, recordando o seu próprio passado e a relação com a Terra.

Hiro e Zero Two viajam pelo espaço rumo ao planeta natal dos VIRM. Na Terra, os adultos e Parasitas que sobreviveram constroem uma nova sociedade.