Надто наляканий, щоб побачитися з Місато чи Рей, Сіндзі знову втікає і зустрічає Каору Нагісу, заміну пілота EVA-02. Відкритість і доброзичливість Кавору забезпечують так необхідний комфорт для збентеженого Сіндзі. Однак в оточуючих виникають підозри щодо неймовірних здібностей Каору до синхронізації.