Asuka ve Shinji bir başka Havari ile karşılaşır, ancak Havari onları alt eder. Artık onu tamamen yok edecek senkronize hareketleri öğrenmek için altı günleri vardır.

Beşinci Çocuk Kaworu Nagisa, Asuka yerine Ünite İki'yi kullanmak için Nerv'e gelir. Shinji'ye dostça davransa da aslında gizem doludur.