Spojené státy v roce 2045. Major a její tým žoldnéřů, mezi kterými nechybí nováček Stan, brání opevněné město před psanci. Togusa přijme něčí pozvání.

Útočníci vyzbrojení štědrým mecenášem zaútočí drony s umělou inteligencí na skupinu Duch. Togusa přijímá nové poslání od japonského premiéra, který usiluje o mír.

Togusa se ponoří do kyberprostoru, aby pátral po bývalých členech svého týmu. Skupinu zadrží tajemná americká organizace, která z nich chce udělat svoje zaměstnance.

Togusa vyšetřuje zmizení týmu a taky Johna Smitha. Dobře přitom zváží možná rizika. Členové skupiny Duch začínají pochybovat o skutečné povaze svého poslání.

Aramaki svádí závod s časem, aby dostihl Kusanagi. Skupina Duch začne plnit úkol, ale kybernetická ochranka Patricka Huge je donutí změnit plány.

Batou je po šesti letech zpátky v Japonsku a chce si při čekání na opožděný tým trochu oddechnout. Zábavu mu ale zkazí amatérští bankovní lupiči.

Major má konflikt se Smithem kvůli novému poslání Sekce 9, kterým je lov post-lidí, a pověří Togusu vyšetřováním podezřelého špiona, který se pohybuje kolem premiéra.

Sekce 9 se dostává do problémů. Jeden ze tří post-lidí v Japonsku zavraždí několik politiků a potom se zaměří na premiérova tchána.

Sekce 9 vyšetřuje post-lidského hackera, který na internetu vybízí k fyzickým útokům na lidi. Stopa vede ke studentovi střední školy.

Pudding pomáhá analyzovat program Thinkpol. Major s Togusou pátrají po stopách, které by je dovedly k post-lidskému studentovi Takashi Shimamurovi.

Togusa dostane při analýze dat zabavených Shimamurovi podivný záchvat. Když se probere, pustí se s Batouem do vyšetřování.