Μέλη του Τομέα 9 αναζητούν έναν άντρα ονόματι Φίλιπ Κουκούσκιν, έναν Ρώσο που υποτίθεται ότι γνωρίζει πολλά για τη δημιουργία των μετα-ανθρώπων.

Μια αμερικανική ομάδα ειδικών δυνάμεων συνεργάζεται με τον Τομέα 9 στη μάχη ενάντια σε έναν αδίστακτο μετα-άνθρωπο ονόματι Σουζούκα Μιζούκανε.

Ενώ παίρνει πληροφορίες από τον Κουκούσκιν, η ομάδα του Τομέα 9 ανακαλύπτει κάτι σοκαριστικό για ένα πρόγραμμα τεχνητής νοημοσύνης της αμερικανικής κυβέρνησης.

Επειδή ανησυχεί ότι η Πούριν ίσως είναι κατάσκοπος των Αμερικανών, η Ταγματάρχης στέλνει μια ομάδα Τατσικόμα να ψάξει το κρυφό παρελθόν της.

Αφού εντοπίσει τον Τογκούσα, ο Μπάτο και οι άλλοι πάνε στο Τόκιο. Πίσω στο Φουκουόκα, η Ταγματάρχης μαθαίνει ότι ένας μετα-άνθρωπος επιτέθηκε σε ένα πυρηνικό υποβρύχιο.

Αναστημένη ως ένα σάιμποργκ, η Πούριν προσπαθεί να φτάσει με οτοστόπ στο Τόκιο. Η αμερικανική ομάδα ειδικών δυνάμεων αντιμετωπίζει την οργή της Μιζούκανε.

Ο Μπάτου και η ομάδα μαθαίνουν από τον Στάνταρντ νεότερα για την κατάσταση με τους μετα-ανθρώπους. Η Ταγματάρχης και η Πούριν συναντούν την υπόλοιπη ομάδα στο Τόκιο.

Για να ανακτήσουν τον έλεγχο του πυρηνικού υποβρυχίου που δέχτηκε επίθεση, η ομάδα του Τομέα 9 βάζει στο στόχαστρο τη Μιζούκανε και τον Τάκασι Σιμάμουρα.

Ο Σιμάμουρα ξυπνά και κάνει μια απεγνωσμένη κίνηση, φέρνοντας την Κουσανάγκι και την ομάδα της σε μια απίθανη θέση.

Η Κουσανάγκι και η ομάδα της κάνουν τα πάντα για να αποτρέψουν την επιβολή του αμερικανικού δρακόντειου σχεδίου να σταματήσουν το πυρηνικό αδιέξοδο με τους "Ν".

Τα μέλη του Τομέα 9 αρχίζουν να ζουν πλέον φυσιολογικά σαν να μη συνέβη τίποτα – η μόνη που νιώθει περίεργα είναι η Κουσανάγκι.