进入大学的森里萤一对即将开始的大学生活充满了信心，但实际上，社团活动和恋爱方面的烦恼一直纠缠着他。一天，同宿舍的前辈们要萤一看家并且还要做堆积如山的工作。所有事情做完后，萤一要打一个电话给学长。但是，就在电话接通时，却从听筒里传来温柔的女声：“你好，这里是救助女神事务所。” 萤一急忙挂掉电话，女神却出现了……

女神贝璐丹迪声称可以实现萤一的一个愿望。女人缘极差的萤一认为自己一无是处，而贝璐丹迪却一一指出萤一的优点。被感动的萤一试探着说出了他的愿望是——希望像贝璐丹迪这样的女神可以一直陪在自己身边，不料，天神受理了这个愿望。正当萤一不知所措时，外出的前辈们回来了。一场误会，萤一和贝璐丹迪被前辈们赶出了宿舍，二人该何去何从……

在汽车内度过一夜的萤一和贝璐丹迪决定找一个可以长住的地方，一心想帮助萤一的贝璐丹迪向精灵祈祷，结果两人被引至一座寺院。在“帮寺院工作来换取当晚的晚饭和住宿”的条件下，寺院住持同意了二人留下的请求。工作时，萤一不小心从房顶摔下，贝璐丹迪情急之下使用魔法救了萤一，而这一幕恰巧被住持看见。贝璐丹迪的身份引起了主持的注意……

贝璐丹迪和萤一一起来到了猫实工业大学，贝璐丹迪一出现便吸引了众男生的目光，因此，引起了被称为“学校的女王”的三屿沙夜子极度的不满。沙夜子想要联合学校的大泽教授，将贝璐丹迪从学校赶出去。但是，在汽车部的前辈们的帮助下，他们的阴谋没有得逞。然而，沙夜子并不死心，她将目标转移到了萤一身上……

贝璐丹迪帮萤一取落在家里的东西，在萤一等待贝露丹蒂回来的时候，遇到了沙夜子。经过跟沙夜子的谈话，让萤一意识到一个问题——他和贝璐丹迪到底是什么关系？晚上，萤一为了怎么向贝璐丹迪告白而烦恼。正当萤一准备向贝璐丹迪告白时，由于紧张过度，被贝露丹蒂误认为他生病了，要强行为他治疗。要想办法解决这个误会，萤一该怎么办？

萤一的妹妹森里惠出现在萤一家门口，她为4月开始的大学而来找公寓。惠以从老家北海道带来的“新鲜的食物”作为帮她找公寓的交换。但是，惠对房子苛刻的要求让萤一实在很为难。尽管如此，还是勉强找到了符合惠标准的房子。但是，当贝璐丹迪进入房间后，察觉到这房间有问题。原来是因为房子压住了地脉，而使三级地灵失去了力量……

萤一因为没有在情人节收到贝璐丹迪的巧克力而感到伤心。贝璐丹迪从惠那里得知，情人节的巧克力要在有情调的地方送给对方。她做好巧克力后，向沙夜子询问什么是有情趣的地方，却被借机介绍给了校园第一花花公子青屿，险些被侵犯的贝璐丹迪最终使用魔法阻止了青屿的恶行。事后，惠建议贝璐丹迪带萤一去看“摩托车展会”。贝璐丹迪的心意能够正确的传达给萤一吗？

贝璐丹迪的姐姐乌鲁德来到萤一家里，并告知萤一世界树系统产生错误，而这导致的最坏结果就是贝璐丹迪被强制遣返天上界。乌鲁德还说，解决问题的方法就是，要萤一和贝璐丹迪有物理接触——接吻。萤一为难的答应了，却一次次失败。这时，贝璐丹迪察觉到，这一切都是姐姐乌鲁德的诡计。正当两位女神的战斗一触即发时，天空降下一道闪电，将乌鲁德击倒在地……

在“猫实工大小姐”的比赛中，贝璐丹迪获得优胜，沙夜子曾经的光辉不再。心荒意乱的沙夜子喝得酩酊大醉不小心从行人道晃到了行车道，碰巧经过的贝璐丹迪使用法术帮她解困。此事之后，沙夜子再次对贝璐丹迪产生怀疑，于是她与青屿联手策划出种种诡计，结果却屡次受挫。最后，沙夜子把萤一邀请到地下STUDIO，想要从他身上揭露贝璐丹迪的秘密……

汽车部拼命为招收新部员而努力，然而却无踊跃报名的迹象。实际上，是因为青屿建立的“四轮部”抢占了部员。面对四轮部的讽刺，汽车部决定参加青屿挑起的“大学对抗拉力赛”，约定败者解散。为了此次拉力赛，汽车部的大家日以继夜的开发赛车。比赛当天，赛车终于开发完成，萤一和贝璐丹迪登车，揭开了决战的序幕……

玛拉的封印解除了，获得自由后的玛拉立即准备贝璐丹迪蒂复仇。她把萤一定为复仇的目标。贝璐丹迪感到了玛拉的波动，为萤一设下了结阵。但还是晚了一步，玛拉把萤一变成了摩托车。乌鲁德和贝璐丹迪想尽一切办法，还是无法使萤一恢复原样。原来，恢复萤一需要“解除魔法的密码”，于是二人开始寻找可以封印玛拉的媒介。

在“打倒贝璐丹迪”的目标下，玛拉和沙夜子最终结盟。沙夜子趁萤一和贝璐丹迪散步时，用演歌节目催眠了乌鲁德，并将神之CD夺走拿给了玛拉。作为报答，玛拉把“操控萤一的心的天枰”给了沙夜子，并怂恿她“如果笼络了萤一，贝璐丹迪就会自动消失”。面对态度突然变得冷漠的萤一，贝璐丹迪深受打击，深夜独自向街上走去……

萤一和贝璐丹迪回忆起曾经的一幕幕，从二人的相遇、签订契约，到乌鲁德和斯库鲁德相继来到萤一家中，以及玛拉解除封印后带来的危机，直到最后二人确认心意。每一段经历都是难以忘怀的记忆，最初萤一的一通电话，改变了他之后的人生，而与贝璐丹迪共同生活的日子，还将继续下去。

森田家从清早就开始陷入恐慌，为平息事态而来的是第三位女神斯库鲁德。斯库鲁德开口就断定会发生错误是因为萤一的愿望，并要求萤一解除契约，让贝璐丹迪返回天上界。而这其实只是斯库鲁德想要姐姐回去的诡计。但是，因为乌鲁德的一些细微失误导致“错误去处机”大爆发。错误大量发生，恐慌急剧扩散……

敌视萤一的斯库鲁德，想把萤一的摩托车拆了。但是，作为机械狂的她却把萤一的摩托车改造了。然而，惠在看过之后，指出了其中的不足，这让斯库鲁德顿时怒气冲天。这时汽车部的前辈突然到来，他们向萤一介绍了即将举行的“机器人搬桶大赛”。于是，斯库鲁德和惠决定，二人各自制造机器人，并最终在这场大赛上一决胜负。

斯库鲁德为了贝璐丹迪而精心研制的万能机器人终于诞生了，这个被称作“万便君”的机器人不论是做家务还是对付魔族都近乎完美，只可惜只要一启动它萤一家里的电源开关就会跳闸，使家里一团糟。在贝璐丹迪温柔的鼓励下，斯库鲁德决定为万便君重新安装设置，意想不到的是，万便君竟对贝璐丹迪产生了爱意。

没有放弃复仇之心的玛拉为了更容易接近萤一，占据了惠的身体。萤一和贝璐丹迪在校园遇到了被玛拉附身的惠时，萤一察觉到妹妹与平时不同，而贝璐丹迪被玛拉的护盾遮挡，没能发现。高兴不已的玛拉召唤出了灾难之神仙贝，仙贝虽然外表单薄，但是操控着幸福量保存的法则，拥有能使对方不幸的可怕力量。接着，不幸接二连三的落在萤一身上……

汽车部的前辈为长谷川报名了仅限女司机的车赛。不过，长谷川自知驾驶技术很差，对自己不抱任何希望，贝璐丹迪见状，提议让她住到他力本愿寺来强化训练。但是，曾经有着“杀人厨师”绰号的长谷川，料理也很差劲。面对失落的长谷川，贝璐丹迪投以温柔的微笑，并提议进行料理特训。次日清晨，两人一起开始了在路上的训练……

从惠那里得到了温泉旅馆的住宿券，萤一和三位女神去了海边。萤一本想和贝璐丹迪有更亲密的接触，但由于态度不自然，反而让贝璐丹迪感到不安。就连“一起去洗温泉”这一步都没有迈出，萤一的态度继续摇摆不定。乌鲁德看不下去，告诉萤一了一个奇怪的占卜结果；另一方面，斯库鲁德不想把姐姐拱手相让，竭力阻止着这场恋爱……

在海边，萤一和贝璐丹迪完全没有进展，乌鲁德很为他们着急。便计划让萤一喝下从“恋爱种子精华”中提取的药。不料，药里被斯库鲁德混入了其他药品，而准备好的药却被贝璐丹迪喝了。第二天萤一醒来，发现穿着背心的贝璐丹迪躺在自己身边，感到非常惊奇。得知药出差错的乌鲁德急忙制作解毒剂，但性情大变的贝璐丹迪，让萤一不知所措……

为了维护主系统，乌鲁德和斯库鲁德需要回天上界。乌鲁德期待着贝璐丹迪和萤一的进展，而斯库鲁德却不能容忍，她施计将萤一变成了女孩。之后，萤一在调和复原剂时一时失误，使贝璐丹迪被病毒侵入而身体虚弱。第二天，田宫、大泷、长谷川和惠来到了萤一家里，四人不愿离开，贝璐丹迪只好起身迎接，但是，身体越发恶化的她，最终失去意识倒下了……

斯库鲁德入迷的听着贝璐丹迪和她的天使圣贝璐同唱的和声，期待着自己也能够拥有天使。不过想要拥有天使，必须要修成相应的法术，没有法术才能的她因此情绪低落。一旁的乌鲁德却指出斯库鲁德的不成熟。当斯库鲁德得知乌鲁德也不能召唤天使时，终于又有了干劲，她计划着自己要先于乌鲁德召唤出天使，于是，斯库鲁德和萤一开始了特训……

玛拉找到了能够唤醒魔族继承者的力量的神魔之魔壶。整个城市开始笼罩在一种不祥的恐惧中。另一方面，乌鲁德因为力量被封印而情绪低落。极度消沉的乌鲁德抵抗不住魔壶强烈的诱惑，终于解放了魔力成为恐怖代行者。得知这一情况的贝璐丹迪，向萤一讲述了乌鲁德的秘密。原来，由于和魔族有血缘关系，乌鲁德极有可能成为恐怖大王的后继者。

乌鲁德作为恐怖大王而觉醒，其影响波及天上界。贝璐丹迪为了得到对抗恐怖大王的力量，解除了被封印的一级神力量。而乌鲁德为了解开将程序实行的保护，使得东京的上空完全笼罩在黑暗之中。贝璐丹迪判断束缚住乌鲁德的元凶是魔壶，并用法术将其破坏。然而，壶的破坏反而导致了程序实行保护的解开。最终究极破坏程序——菲尼鲁，现身了……

乌鲁德恢复正常，但苏醒的米德加尔德企图解开被神封印的“冥府之门”，让魔族降临地上界。贝璐丹迪再次使用米德加尔德的笛子，封印了恐怖大王。当众人回到家里，以为风波已经平息之时，萤一突然夺走了笛子，原来，恐怖大王早已附身萤一了。为了歼灭恐怖大王，从头到尾都关注着的天神大人，最终下令，派战斗天使琳顿奔赴地上界……

在与恐怖大王激战后，由于系统功率下降，乌鲁德变成了小孩子的模样。暂时无法使用法术的乌鲁德来到公园喝酒，却误打误撞认识了少年正平。之后正平成为了乌鲁德的玩伴，虽然两人认识不久，但乌鲁德还是感觉到了正平对自己那淡淡的好感，然而，在不得不和正平分别的事实面前，乌鲁德陷入了烦恼……

受到世界树系统的影响，非常讨厌别人把自己当小孩子看待的斯库鲁德，终于如愿以偿变成了大人的样子。高兴不已的她决定和萤一一起上街，却在路上被青屿搭讪，并在青屿的引诱下答应了他的邀请。青屿突然转变的态度让斯库鲁德感到恐惧，最终萤一及时赶来帮她逃离了青屿。感受到萤一的温柔的斯库鲁德心里会泛起怎样的波澜……

恐怖大王的威胁已消除，他力本愿寺再度恢复到稳定的日常生活中。但是因为这一连串的事故，天上界大部分数据资料受损，而损坏的数据正是助人女神事务所的登陆文件。要恢复萤一与蓓儿丹蒂的契约效力，需要将萤一的愿望再次输入系统才能修复。一年前的愿望要一字不漏的准确说出，萤一自己也记不清了……

猫实工大的女王——三屿沙夜子，在圣诞节即将到来的这天，一如既往地收到了众多男生的邀请，但她心里还是觉得有些失落。当意识到原因在于那唯一没有对自己献殷勤的萤一时，沙夜子便立刻找到独自来到学校的萤一，并向他发出邀请。然而，却是听到了萤一倾诉对蓓儿丹蒂的心意。被萤一的真诚和温柔打动，沙夜子心里一片混乱……

圣诞节即将来临，萤一想起来，蓓儿丹蒂来到身边已经快过一年了，可自己到现在都还没有为她做过一件符合男友身份的事，于是他决定送蓓儿丹蒂一件圣诞礼物。可是，看上的礼物价格过高，萤一打算找其他的兼职，最终，在兀儿德的帮助下，萤一终于赚到了足够的钱。满怀欣喜跑去买礼物的萤一和兀儿德，却在商店碰到了沙夜子……

萤一受到沙夜子的邀请参加由三岛家主办的圣诞派对，于是他与蓓儿丹蒂以及汽车部的朋友们一同前往三岛家。萤一虽然惊讶于那从未见过的豪华场面，但让他更头疼的是汽车部等人，以及兀儿德和诗寇蒂在摆满料理的餐桌前胡吃海喝的混乱场景。派对开始，沙夜子出现在主持台上。虽然萤一受不了她那夸张的登场方式，但总感觉沙夜子另有图谋……

下课后，萤一与蓓儿丹蒂正沉浸在二人世界中，田宫与大泷却突然出现，原来是为了制造出短程高速赛用的赛车而必须筹集资金。汽车部众人为了筹资，在学校里寻找有困难的人，给予他们帮助以换取报酬。结果，发牢骚抱怨的、拒绝付修理费的人相继出现。就在这时，大泷遇到了一名被青屿搭讪的女生，帮助女生脱困后，大泷的心境也发生了变化……

从储物柜里收到了有生以来的第一封情书，萤一因此倍受冲击。然而蓓儿丹蒂却丝毫没有表现出嫉妒的样子，这一点让萤一感到不安，但他还是相信了蓓儿丹蒂的话，打算做出答复而前往信上所写的场所。出现在眼前的女孩确实如兀儿德所说，是个可爱的女孩，但是，她似乎并不是要向萤一告白，而是有着别的理由……

萤一与蓓儿丹蒂一起坐在走廊旁，二人看着用从小惠那里买来的照相机拍下的照片，一喜一忧的两人就这样陷入了二人世界里。萤一认为都是托了小惠的福，于是想让小惠也看看这些自豪的照片。萤一打电话给小惠，然而电话的另一端却再次接到了天界。又一位女神来到了萤一家，萤一想拜托这位女神回天界，而对方则表示，一定要实现萤一的愿望才肯离开……

被佩欧丝的言语激怒的兀儿德和诗寇蒂，不顾蓓儿丹蒂的阻止，与佩欧丝开始了一场“谁是最有用的女神”的竞争比赛，并要求萤一做评委。三人用三种不同的方式把萤一送到了大学，三种法术混合在一起，萤一的情况越来越糟。然而三人并不打算放弃，依然在用自己的方式向萤一证明着实力。眼看萤一快要承受不住三人的法术，蓓儿丹蒂及时赶来……

佩欧丝邀请萤一约会，并在公园等待着萤一。然而和预想不同的是，来的不只是萤一一人，其他三位女神也一同前来了。萤一解释说这是团队交际而骗过了佩欧丝，不过兀儿德和诗寇蒂似乎另有想法。然而，佩欧丝并不死心，为了达成目的而继续前往电影院、水族馆，本以为会按计划发展，却因其他三位女神的存在而状况频频……

佩欧丝仍然缠着萤一不放，希望萤一向她说出愿望并定下契约。看不下去的兀儿德以过去的某件事来提醒萤一，要考虑到蓓儿丹蒂的心情。另一方面，佩欧丝也察觉到，无论她用什么方法都无法动摇萤一，这样下去只会没完没了。于是她对萤一做了一个提示，毫无防备的萤一正中佩欧丝的圈套，因此使得佩欧丝的计划再次展开……

田宫和大泷在看完一封寄到汽车部的信后，没有告诉萤一任何理由，只留下一句“我们要暂时出去躲躲”就离开了。在这之后，萤一在组织剩下的部员进行活动时，一个未曾相识的女生来到了汽车部，自称是田宫和大泷旧识的藤见千寻，原来是前汽车部部长。萤一认真的样子引起了藤见的兴趣，并被其邀请进行一场比赛。面对前社长，萤一开始为比赛做准备……

蓓儿丹蒂正在安慰着因电视坏了而大感不满的诗寇蒂，在森里家这样的日常景象中，兀儿德却独自一人在寺院内的梅花树下陷入沉思之中。此时，大量梅花花瓣飞舞飘落，兀儿德的前男友梅精突然出现，他声称想要与兀儿德重归于好，被兀儿德拒绝后依然不放弃。然而，当梅精注意到萤一后，大生醋意，萤一成为了他的眼中钉……

看到蓓儿丹蒂满足而欣慰的骑着自行车回来，诗寇蒂对自行车产生了兴趣，却被一旁的兀儿德指出她不会骑自行车的事实。在兀儿德的挑衅下，诗寇蒂与兀儿德约定以三天为期限学会骑自行车。多次从自行车上摔下的诗寇蒂哭着跑出了家门，却在河堤上遇到了正在骑车的少年川西仙太郎，受到仙太郎的影响，诗寇蒂对骑车的态度也改变了……

诗寇蒂和仙太郎无意中看到了蓓儿丹蒂与天使的合唱，对此感到好奇的仙太郎向诗寇蒂询问是否也拥有天使时，好面子的诗寇蒂夸口第二天给仙太郎看她的天使。于是，诗寇蒂立刻买来天使卵并想办法让其孵化，却不小心将其误吞了。终于在蓓儿丹蒂与兀儿德的帮助下天使成功孵化出，诗寇蒂兴奋的带着天使去见仙太郎，然而，兀儿德却感到不安……

来到温泉旅馆的萤一和三位女神，在那里遇到了恶魔玛拉。原来，玛拉与兀儿德是旧识，却一直水火不容。面对冷嘲热讽的二人，蓓儿丹蒂提出这一天双方要和平相处，忘记恶魔和女神的身份，违反者将受到惩罚。众人在温泉旅馆渡过了快乐的一天，然而，玛拉却是另有目的。没有防备的兀儿德被玛拉所擒，玛拉更大的阴谋展开了……

萤一家里出现了神魔分离的两个兀儿德，纯魔化的兀儿德，将会成为拥有神之力量的极恶恶魔，并且最终将因力量过大而自我毁灭。知道此事的蓓儿丹蒂想要阻止魔属兀儿德，却无奈戴着封环无法使用全力。神属兀儿德尽力抵抗着魔属兀儿德的攻击，然而魔属兀儿德的力量越来越强，眼看快要达到自毁的程度，玛拉突然出现，将魔属兀儿德带走……

神属和魔属两种性格在兀儿德体内不断的互换着，然而，随着神属的侵害，兀儿德魔属的记忆正在渐渐消退，而最终她会忘记半魔半神时的所有记忆。不愿失去与大家共同的记忆，兀儿德无奈之下只能召唤大魔界长——菲尔德。兀儿德一通电话则顺利召来了菲尔德，众人仍在惊讶之时，菲尔德现身，而兀儿德与菲尔德似乎关系匪浅……

在大魔界长菲尔德的鼓励下，玛拉再次燃起斗志，来到他力本愿寺，打算正面攻击三位女神，却遇到守门的哨兵小弟，屡次失败。重获邪教之魔壶的玛拉，企图以此分裂蓓儿丹蒂的人格，不料魔壶却对蓓儿丹蒂无效。然而，在远处目睹了这一切的菲尔德，证实了自己心中所想后，开始了她的计划。而萤一与三位女神还浑然不觉……

玛拉的手下木灵想要利用萤一使蓓儿丹蒂误会，从而激起她的愤怒。不料，蓓儿丹蒂对萤一完全信任，任务失败的木灵秉持忍者精神打算自杀，却被蓓儿丹蒂救了下来。被蓓儿丹蒂的善良感动，木灵在他力本愿寺住了下来。正当木灵渐渐融入蓓儿丹蒂和萤一的生活时，同为玛拉手下的另外一位忍者火狩出现在他力本愿寺……

由于宿舍改建，汽车部的前辈们将堆积如山的行李寄放在萤一家里，接着萤一又接二连三的收到了更多的东西。为了存放这些东西，诗寇蒂用她制造的机器使房间的面积扩大。然而，当萤一想要使用机器再度扩大房间的面积时，由于操作失误，导致房间面积无限扩大。遭到停职处分的蓓儿丹蒂无法使用法术，面对无边的房间，二人要如何走出去……

恢复职位的蓓儿丹蒂回来了，但由于菲尔德和玛拉暗中做了手脚，蓓儿丹蒂原本的女神执照变成了魔族执照。兀儿德和诗寇蒂返回天界解决这件事情，另一边，一直在外修行的他力本愿寺的住持回来了，不同于以前的蓓儿丹蒂身上散发着邪恶的波动，发现这一点的住持立即将二人赶出了寺院。而受到影响的萤一事事不顺，情况越来越糟糕……

清早，菲尔德突然出现在萤一家里，并且与萤一十分亲密，而萤一也没有拒绝。令兀儿德十分不解的是，萤一并没有被菲尔德操纵，也没有被魔族附身，完全自愿与菲尔德亲近。正在担心萤一是否变心的蓓儿丹蒂发现了菲尔德的诡计，为了抢回萤一，她与兀儿德和诗寇蒂三人一起进入到了时之缝隙中。一场蓓儿丹蒂与菲尔德的萤一争夺战开始了……

蓓儿丹蒂在整理房间的时候找到了萤一爷爷的日记，而日记中标注的“藏宝之地”正是汽车部此次的合宿之地。来到合宿地，迎接他们的是女仆装的少女本田智慧子，她声称自己与萤一在很久之前便有了约定。萤一对此一无所知，但是智慧子却因蓓儿丹蒂与萤一亲密的举动而对蓓儿丹蒂充满敌意。感受到智慧子身上非常人的气息，蓓儿丹蒂默默观察着……

佩欧丝声称身负任务来到萤一家，她向萤一询问是否有对蓓儿丹蒂告白过。不明白佩欧丝为何这么问的萤一，被这个问题困扰着。他从千寻那里得知，对女生的感情是一定要说出口才能传达到的。然而面对蓓儿丹蒂，萤一却迟迟说不出口。佩欧丝看不下去，对萤一进行告白培训，原以为会按计划成功告白，却因为兀儿德的插手，情况超出二人意料……

天上界战斗神凛德来到了萤一等人的面前。 女神们的天敌、会吃掉女神的天使的「食天使兽」不知道被什么人从天上界偷出并放到了地上界，而凛德就是前来追捕食天使兽的。 只要不让天使出现，天使就不会被吃掉，因此女神们并没产生太大的警惕，但是……。

这次事件的元凶就是希露德与玛拉。凛德受到她们的袭击，好不容易才得以脱身，\n\n但是却陷入了只剩下凛德与萤一还有斯库璐特三人而已的绝望状况。于是，凛德为了救出其她女神，而开始实行了一个方法。