春天。進入高中的木之幡米菈，因為絕對要加入的天文社不見了而受到很大打擊。米菈在小時候和某個人約定了“尋找小行星”這樣一個夢想。聽說今年起“天文社”和“地質研”合併為“地學社”，就立刻加入了社團。在社團活動室等待米菈的是3名別具個性的學姐，另外還有一人……

今天在河灘邊舉行新社團成員歡迎會燒烤！在完成採石大會和星空觀察會，度過了豐富多彩的一天之後，大家開始製作會刊《KiRA KiRA》。在各自確定主題的過程中，米菈卻寫不出報導。儘管想盡辦法總結，可是姐姐米莎卻說“沒有感覺到米菈的風格”。這時，米菈被蒼請求繪製報導的插繪……

要進行補考的米菈和蒼，以及小鈴、米菈的姐姐米莎一起在米拉的家開了學習會。終於通過補考的兩人，在小鈴的麵包店經歷了第一次的打工。拿着第一份打工費外出“站前約會”的兩人，看到了並排走着的豬豬學姐和小鈴。對意外的組合感到吃驚，米菈和蒼悄悄跟在了兩個人的後面……

夏季集訓！目的地是地質標本館、日本宇宙航空研究開發機構等等。櫻觀賞了難得一見的礦物和化石，豬豬對這樣的櫻感到興奮。另一邊，夢露、米菈、蒼對人造衛星和火箭正情緒高漲。米菈和蒼為了得到尋找小行星的情報而四處打聽，可並沒有得到線索。在作為留宿地點的遠藤老師祖父母家享受了戶外燒烤和天文觀測後，遠藤老師拿出了……

地學社成員們為星咲祭做着準備。地質組的櫻與豬豬進行了正式的鑽探調查。另一邊，天文組的米菈、蒼、夢露在米菈的家裏製作太陽系的行星模型。接下來文化節終於開始了。鈴也過來幫忙的地學社的地學咖啡廳開業了。地學社成員們換上了女僕裝……

夢露和櫻退隱，米菈、蒼、小豬的新生地學社開始了。為了讓小豬擁有作為社長的自信，大家讓她擔任了兒童會的天文觀測會講師。米菈她們為了完成讓孩子們產生興趣這種普通手段無法做到的事情而努力着。隨後，在觀測獵戶座流星雨的第二天早上，蒼缺勤了。感到擔心的米菈和小豬前去探望……

小豬挑戰了“地學奧林匹克”的預選賽。這是作為社長為了能獨當一面而邁出的第一步。第二學期快結束了，地學社舉行了聖誕聯歡會。煮火鍋之後，是慣例的星空觀測。大家一邊歡鬧着一邊仰望着冬日的鑽石，突然從蒼的眼中流下了淚。雖然蒼說着沒關係，可是……

蒼沒有轉學，為了能在米菈的家住在一起，米菈和蒼說服了各自的家人。臨近情人節，櫻把在小鈴的指導下的製作的、第一次親手做的朱古力交給地學社的大家。而鈴得知米莎要去遠方的大學……

七海和櫻的妹妹千景加入了地學社。千景和櫻一樣希望加入地質組。另一邊，想要學習“氣象”的七海似乎對地學社的活動不太滿意。想要讓新生得到各種歡快體驗的米拉，提出了去年想到的舉行迎新戶外燒烤的提議……

米菈也被允許作為參觀者參加，閃亮星挑戰終於開始！參觀天文台等項目正進行着，到了晚上，和成為同一組的友利和蒔田一起，終於在天文台開始了小行星的探索。可是，雲層卻在天空擴散開來……

閃亮星挑戰第二天。天空萬里無雲，是觀測的好天氣。如果繼續確認拍攝的數據，就會發現像未知的小行星一樣的天體。大家非常緊張。今次真的是最後的機會，再次開始拍攝。米菈和蒼，以及同班的友利與蒔田確認了畫面……