史提芬·葛蘭特是英國倫敦一家博物館的禮品店的店員，他時常突然產生自己經歷另一種完全不同生活的記憶。2025年的某晚，他發覺自己在中阿爾卑斯山脈附近一處完全陌生的城鎮郊外醒來。葛蘭特在城內目睹亞瑟·夏羅正在對民眾傳教。夏羅見到葛蘭特，將他誤認作他人，稱他是僱傭兵，要求他交出口袋中的聖甲蟲。葛蘭特耳旁響起一個神秘聲音，並且他的身體遭遇神秘力量，阻止他交出聖甲蟲。隨後，葛蘭特的意識出現斷片現象，身體短暫被另一個人格控制，擊敗試圖圍攻他的教徒。葛蘭特在家中醒來，發現已經睡了整整兩天，錯過了與新結識的女子的約會。他回到家中，在牆壁的夾縫內發現一個隱藏的電話和一張鑰匙卡。一名自稱蕾拉的神秘女子打來電話，稱葛蘭特為麥克。轉天之後，葛蘭特在工作的博物館內見到夏羅，夏羅稱自己是埃及神明阿米特的信徒，希望藉助聖甲蟲的力量幫助阿米特重獲自由。當晚，葛蘭特在博物館遭到一隻與阿努比斯相關的胡狼怪物襲擊。危急之際，他在鏡子中見到自己的另一個人格。葛蘭特暫時將身體交由對方控制，變身成為身着白色繃帶戰衣的騎士殺死怪物。

轉天清晨，葛蘭特回到博物館，在監控影像中看不到昨晚出現的胡狼怪物。葛蘭特因損壞設施被博物館解僱。他通過鑰匙卡找到麥克的寄存倉庫，在其中發現武器、護照、大量金錢和聖甲蟲。葛蘭特的另一個人格是麥克·史貝特，一名美國僱傭兵，也是現任孔蘇的化身。史貝特試圖說服葛蘭特讓他恢復對身體的控制，遭到葛蘭特的拒絕。孔蘇現身追趕葛蘭特。葛蘭特被蕾拉·埃富里解救。蕾拉是史貝特的妻子，此前並不知道葛蘭特的存在。蕾拉向葛蘭特解釋，她曾與史貝特一起尋找聖甲蟲。葛蘭特被兩名警察逮捕。兩人是夏羅的信徒，將葛蘭特帶至夏羅的領地。夏羅自稱是孔蘇的前任化身，他選擇離開孔蘇，追隨另一名神明阿米特。夏羅希望在聖甲蟲的引領下，找到阿米特的陵墓，將她復活。屆時，阿米特將審判所有已經犯下或將要犯下罪惡的眾人，從而根除邪惡。蕾拉帶着聖甲蟲救援葛蘭特。夏羅召喚另一隻胡狼怪物追趕他們。葛蘭特設法召喚出一套類似於史貝特的魔法戰服對戰怪物。葛蘭特不敵對方，史貝特控制身體殺死怪物。他在打鬥之際將聖甲蟲遺失，被夏羅拾獲。史貝特為彌補過失，向孔蘇承諾在夏羅之前找到阿米特的陵墓，孔蘇便將史貝特傳送至埃及。

在聖甲蟲的指引下，夏羅及其信徒找到阿米特陵墓的埋藏地點。史貝特和葛蘭特兩個人格均希望控制身體，他們不斷更換主導權的同時，在開羅企圖從夏羅的信徒口中打聽到他的下落，以失敗告終。孔蘇冒險利用神力引發日食，逼迫九柱神召開議會審判夏羅。審判會在吉薩大金字塔內舉行，史貝特作為孔蘇的化身指控夏羅企圖復活阿米特。夏羅在議會上否認孔蘇的指控，並稱孔蘇一直利用史貝特的多重人格缺陷控制他。會議首領歐西里斯等諸神聽信夏羅的辯詞，認為孔蘇在誣陷他人。眾神釋放夏羅，並警告孔蘇，若他再在世人面前濫用神力，將把他囚禁。音樂與愛的女神哈托爾的化身葉琪暗中告知史貝特，可以通過法老侍衛山福的記錄檔案找到阿米特陵墓的位置。史貝特在集市上遇到蕾拉，她稱古董收藏家朋友安東·莫加特藏有山福的石棺。史貝特召喚出葛蘭特研究石棺旁的記錄布帛，但之後被安東的手下包圍，夏羅也隨後趕到，並當面摧毀石棺。史貝特和蕾拉聯手擊敗莫加特的幫眾，帶走石棺的剩餘碎片後驅車逃進沙漠之中。葛蘭特將碎片布帛拼接成約為兩千年前的星象圖。孔蘇使用神力將天空星象短暫撥回至當時時刻，葛蘭特和蕾拉參照布帛找到阿米特陵墓的確切地點。孔蘇因濫用神力而被眾神囚禁於巫沙布提俑之內，被囚前要求葛蘭特告訴史貝特去拯救自己。

塞利姆將囚禁孔蘇的巫沙布提俑與囚禁其他神明的提俑放置在一起。葛蘭特和蕾拉擊退追趕而來的莫加特幫眾。儘管在孔蘇被囚禁之後，葛蘭特與史貝特均失去超能力，他仍然決定與蕾拉同去追蹤夏羅，尋找囚禁阿米特的巫沙布提俑。葛蘭特不願再將身體交由史貝特控制，並告訴蕾拉，史貝特是為了保護她不受孔蘇控制才故意疏遠她。葛蘭特與蕾拉找到夏羅及其信徒的挖掘地點，進入陵墓。兩人發現陵墓是根據荷魯斯之眼設計而成的迷宮，他們還見到夏羅的許多信徒被守墓的古埃及祭司殺死。為躲避祭司的攻擊，葛蘭特和蕾拉分頭行動。蕾拉設法殺死追趕的祭司，遇到等候在此的夏羅。夏羅稱史貝特是殺死蕾拉的父親考古學家阿卜杜拉·埃富里的僱傭兵之一。葛蘭特發現陵墓的主人是亞歷山大大帝，他是阿米特被囚禁之前的最後一個化身。葛蘭特在亞歷山大大帝木乃伊食道內找到囚禁阿米特的巫沙布提俑。蕾拉與葛蘭特會合，向史貝特質問關於父親死亡的真相。史貝特稱是他的搭檔殺死了蕾拉的父親以及在場的其他人。他自己也被殺死，之後才被孔蘇復活，成為孔蘇的化身。夏羅率領信徒趕到，史貝特為掩護蕾拉帶着巫沙布提俑逃走，被夏羅開槍擊倒，墜入水中。史貝特在精神病院中醒來，發現治療自己的醫師是夏羅。史貝特企圖逃離此處，途中遇到被困在石棺內的葛蘭特。兩人均擁有了獨立的身體，他們在繼續逃離途中還看到另有他人被困於石棺之中。隨後，他們正面遭遇一個長著河馬頭的神祗。

史貝特的精神世界在兩個完全不同的場景之間來回切換：一是在精神病院與治療醫師「夏羅」談話，二是與葛蘭特共同面對長著河馬頭的神祗塔威蕾，她是埃及分娩和生育女神。塔威蕾稱兩人已經死亡，當前身處古埃及冥界杜埃之中，「精神病院」其實是一艘正在駛向蘆葦平原雅盧的駁船，雅盧為古埃及的天國樂園。塔威蕾將兩人的心臟放在正義天秤的一側，另一側放上羽毛砝碼。如果天秤達到平衡，死者的靈魂便可進入雅盧，否則將被拋下駁船。塔威蕾發現心臟並不完整，建議兩人尋找內心中的隱藏記憶，設法使天秤平衡。葛蘭特見到被史貝特殺害的大量罪犯，並目睹幼年時期的史貝特無意之中導致弟弟藍道·史貝特溺水而亡。母親溫蒂因此時常遷怒於他。葛蘭特還見到史貝特作為僱傭兵執行任務時，被貪心的同伴勞爾‧布殊曼槍擊，瀕臨死亡。他隨後被孔蘇復活，成為孔蘇的化身月光騎士。塔威蕾見到許多靈魂正在接受審判。史貝特和葛蘭特說服塔威蕾幫助他們回到現實世界來阻止夏羅，調轉船頭前往歐西里斯之門。史貝特向葛蘭特坦承隱秘，幼年時遭受母親虐待的他為迴避現實，創造出另一個人格葛蘭特。葛蘭特因此得知自己不是主人格，而且母親早已死亡。兩人和解之後，天秤仍然無法平衡。駁船遭到冥界中的鬼魂攻擊。兩人聯手擊退鬼魂，葛蘭特掉下船被杜埃吞噬。天秤達到平衡，史貝特發現自己置身於蘆葦平原。

塔威蕾告知蕾拉前往神廟釋放孔蘇以便讓史貝特與葛蘭特復活。夏羅則從史貝特的屍體身上取得了阿米特的提俑，而後前往神廟殺害了其他埃及眾神的化身並釋放阿米特。在冥界，史貝特拒絕獨自留在蘆葦平原中，返回杜埃試圖營救葛蘭特，在塔威蕾的幫助下，兩人成功透過歐西里斯之門逃離杜埃並復活。與阿米特交戰的孔蘇感應到了史貝特的復活迅速讓其恢復神力，並承諾在任務結束後還給兩人自由。瀕死的塞利姆告知蕾拉再次封印阿米特的辦法：將阿米特封印到凡人的身軀並將其宿主殺死，蕾拉暫時成為塔威蕾的化身獲得神力。獲得阿米特神力的夏羅以及信徒前往開羅試圖審判世人，史貝特、葛蘭特、蕾拉與孔蘇趕到與其交戰，一番交戰後史貝特與葛蘭特不敵夏羅，此時史貝特忽然斷片，再次恢復意識時發現夏羅以及其信徒都已被重傷。史貝特與蕾拉將瀕死的夏羅帶至神廟，施咒將阿米特封印在夏羅體內。史貝特拒絕孔蘇殺死夏羅的命令，隨後孔蘇便釋放了兩人。史貝特與葛蘭特在精神世界中的療養院醒來，但拒絕承認此景象後回到了現實的新生活。而被囚禁於療養院的夏羅某日被史貝特與葛蘭特的第三人格：積·洛克利帶走，其在孔蘇的命令下將夏羅處決。