鲁迪乌斯、艾莉丝和瑞杰路德应公会魔物调查的委托前往石化森林时，发现那里有两组同样接受委托的冒险者。在试图迅速完成任务的过程中，鲁迪乌斯被迫做出决定。另一方面，洛琪希访问了发生转移事件的菲托亚领地的鲁迪家…

鲁迪乌斯他们到达了魔大陆最南端的港口城市·维恩港。三个人打算坐船到米莉丝大陆。但是因为有斯佩路德族人在这种理由，被索要高额的渡航费用。有一天晚上，人神出现在了因为资金不足而烦恼不已的鲁迪乌斯的梦中，并给了他忠告。第二天，鲁迪乌斯在城市里散步的时候，遇到了饿肚子的谜之少女。

洛琪希寻找着失踪的鲁迪乌斯等人。 与鲁迪的父亲保罗的熟人艾莉娜丽洁，以及塔尔韩德一同来到温恩港后，洛琪希在寻找线索时，听说了关于恶名昭彰的Dead End的传闻。 另一方面，鲁迪乌斯等人与走私组织的贾尔斯做了交易，以解放藏身处的奴隶为条件，渡海抵达期望已久的米里斯大陆，然而……

鲁迪乌斯与保罗和解，在为了各自寻找家人而分别后，就与艾莉丝及瑞杰路德一同搭船前往中央大陆。 另一方面，洛琪希、艾莉娜丽洁及塔尔韩德也在寻找塞妮丝等格雷拉特一家。 洛琪希在利卡里斯镇与诺克巴拉重逢，并且在他的催促下，回到了故乡米格路德族之村。 身处离开时跟离家出走没两样的故乡让洛琪希深感忧心，究竟她与双亲的再会……

艾莉丝留下信后就突然不见了。 人生重新来过，鲁迪乌斯原本觉得自己透过各种相遇和经验有所改变了，但因为失去艾莉丝的冲击，使他再次跟前世一样闭门不出。 正当鲁迪乌斯准备放弃一切时，他的脑海中回想起了母亲塞妮丝……

自从鲁迪乌斯救了莎拉一命之后，跟她在相处上也产生了变化，两人之间的距离越来越靠近。鲁迪乌斯在莎拉说想买短剑的邀请下一起去约会。开心地逛了街，并在酒馆閒聊时，两人的情调也渐渐昂扬。儘管脑海中掠过艾莉丝的身影，鲁迪乌斯还是接受了莎拉对自己的态度并下定决心……！

为了一吐变得不举的怨气，鲁迪乌斯跟佐尔达特意气相投，也常会一起行动。当鲁迪乌斯待在丕平时，过去曾跟保罗待在同一个队伍，还跟洛琪希在旅途中相伴的艾莉娜丽洁出现在他面前。她替鲁迪乌斯带来了某个消息。

收到推荐函再加上人神的建言，鲁迪乌斯决定进入拉诺亚魔法大学。跟艾莉娜丽洁一起抵达大学之后，便被要求与在校生进行一场模拟战作为测验。对手是跟鲁迪乌斯同样使用无咏唱魔法的，名为菲兹的人物。而且，大学裡也聚集了许多个性鲜明的学生。

恋爱的季节到来…!?特别生克利夫拜托鲁迪乌斯给他介绍一位女性。另一方面，兽族一到秋天就会盛行求婚决斗，多尔迪亚族的公主莉尼娅和普尔塞纳为了避免决斗而躲在宿舍里。但是，不知为何出现了向鲁迪乌斯提出决斗的人…!?

鲁迪乌斯跟虽然不是转生，但跟自己是从相同世界来到这里的塞伦特·赛文斯塔，也就是七星一起调查转移事件跟召唤魔术。菲兹看着这样的两人，因为不明所以地感受到莫名的羁绊而不禁消沉。但另一方面，鲁迪乌斯也开始对身为男性的菲兹产生了某种心意。

这个世界结婚时会在会在自家举行派对，于是鲁迪乌斯便和希露菲一同进行准备。到了派对当天，艾丽儿和札诺巴等拉诺亚魔法大学的参加者出席时，艾莉娜丽洁却露出了和往常不同的表情。同时，鲁迪乌斯接受了爱丽儿提出的某个请求…

鲁迪收到了来自父亲保罗的信。他希望鲁迪可以照顾妹妹诺伦与爱夏，因此请了护卫送两人到鲁迪那边。同时，和鲁迪乌斯从相同世界转移而来的七星，为了回到原来的世界持续研究魔法，但始终找不到突破口而感到焦虑。

因为鲁迪乌斯对待诺伦的方式，以及在学校交到了朋友，诺伦也有所变化。鲁迪乌斯和家人以及在大学过着平稳的生活。但某一天，希露菲突然要告诉他的究竟是…？以及来自某人的信上所写的又是…？同时人神要给他的新「建议」…！？

鲁迪乌斯收到了基斯写着「塞妮丝难以救出，请求支援」的信。但赶去救援，就会留下怀孕的希露菲、诺伦和爱夏……烦恼不已的鲁迪还是决定前往贝卡利特大陆的迷宫都市拉庞。但是路途比想象的更加艰难，并且伴随着生命的危险。

到达迷宫都市拉庞后，鲁迪乌斯和艾莉娜莉洁很快找到了基斯，被带去了保罗和莉莉雅那里。由于无法救出塞妮丝，保罗身心憔悴，鲁迪乌斯温柔地安慰了。到了准备讨论如何攻略塞妮丝所在的迷宫时，鲁迪乌斯发现本该在场的洛琪希却不见踪影……

鲁迪乌斯和保罗等人救出了被独自留在迷宫的洛琪希，为了让她恢复体力，一行人暂时回到了镇上。鲁迪乌斯非常在意分隔许久的洛琪希，也与她愉快地聊起了往事。三天后，他们再次进入转移迷宫，并且开始提升攻略楼层的速度──！

鲁迪乌斯等人转移到了最终楼层，他们终于确认到塞妮丝的身影！但那里有着这个迷宫的守护者，巨大的九头龙挡住了他们的去路。那头九头龙是早应灭绝的传说中的生物，被称为「恶魔之龙」的强敌——！

在与魔石多头龙的壮烈死斗后，鲁迪乌斯等人救出了塞妮丝。然而代价却是鲁迪乌斯失去了左手，以及保罗牺牲了性命。更糟的是，塞妮丝还失去了心智……面对父亲保罗的死，鲁迪乌斯陷入了后悔与绝望。而此时洛琪希向他搭话了……

鲁迪乌斯时隔半年后回到了希露菲她们等待的家里。他描述了转移迷宫的始末、保罗的死以及塞妮丝的状态。接着他也说了洛琪希的事……而诺伦、爱夏以及希露菲对这件事的回应是……？