凯·艾尔来到地球之后，化名为克拉克·肯特，在大都会伪装成《星球日报》的记者，私下化身为超级英雄“超人”维护地球和平。他的妻子露易丝·莲恩同样是该报的知名记者。克拉克和露易丝养育了两个儿子乔纳森·肯特和乔丹·肯特，乔丹患有社交焦虑症。

克拉克一家从大都会搬迁至肯特农场。路瑟突袭摩尔多瓦的一个武器黑市，未能找到氪石。克拉克带着乔丹来到地球北极的秘密基地孤独堡垒，学习氪星的历史。露易丝和乔纳森前往市议会参加会议，她在会上结识《泽莫维尔公报》记者克莉丝·贝波。

肯特一家正在重新粉刷墙面，克拉克听到远在中国贵州省的平塘大桥出现坍塌事故，他化身超人及时赶到化解危机。被西恩·史密斯及其朋友霸凌数次之后，乔丹加入学校的橄榄球队，在球场上凭借自身的超级力量赢得教练和其他队友的好感。克拉克起初担心这样会暴露乔丹的超能力，乔纳森说服克拉克允许乔丹正式加入橄榄球队。

由于克拉克离开大都会，塞缪尔决定将罪犯赛迪斯·基尔格雷夫从该市监狱转移。基尔格雷夫于途中越狱，克拉克因被儿子分心而未能及时阻止。塞缪尔告诉乔纳森和乔丹，他们的父亲需要专注于超人所承担的责任。

肯特一家人为庆祝泽莫维尔的丰收节做准备。伊莉莎与乔纳森分手，乔纳森因此心烦意燥，希望搬回大都会。莎伦和儿子德瑞克来到《泽莫维尔公报》报社，德瑞克自称从昏迷中醒来，不记得此前发生何事。德瑞克的身体状况不稳定，他在社区服务中心控制不住超能力，发射热视线引发火灾。

克拉克希望帮助塔格，塔格受到惊吓逃跑。露易丝告诉克拉克，她怀疑摩根·艾吉是幕后黑手。艾吉提升拉娜为当地项目的主管。凯尔虽然没被任命而感到失落，但是他仍然相信只有艾吉能够帮助小镇居民走出经济危机。

超人的生父在孤独堡垒告诉克拉克，乔丹开始拥有超级听力。为了帮助乔丹适应超能力，克拉克夫妇要求他居家逐步适应感知到的嘈杂声音。乔丹无意之中听到乔纳森和莎拉在学校的对话，心生嫉妒。艾吉任命拉娜为“领导力计划”项目主管，寻找五名获选人。

塞缪尔·莲恩和超人在国防部审问艾朗，艾朗声称只与露易丝对话。露易丝和乔纳森进入艾朗的房车，找到他保存的照片和影像，其中包括邪恶超人、女儿娜塔莎和妻子露易丝。乔纳森独自在房车内发现武器，触发人工智能设备的防御功能，即将射杀乔纳森。

露易丝来到艾吉的公司，当面质问他是否正在进行将X氪石植入人体的实验。艾吉因此意识到拉娜一直在向露易丝提供情报。克拉克在国防部吸入了氪石毒气，传染给乔丹。乔丹的身体出现不适。克拉克带他来到孤独堡垒，使用热射线祛除残存在乔丹体内的氪石气体。

艾吉向凯·埃尔透露自己的真实身份是氪星人，他是凯·埃尔的母亲劳拉·凡·埃尔与前夫泽塔·罗的儿子。他稍早于凯·埃尔来到地球，降落至英格兰。随后艾吉被监禁，成为实验对象。

超人回忆起生命中的重要时刻，包括在北极发现孤独堡垒、入职《星球日报》、结识露易丝·莲恩、成为超级英雄击败原子人以及与露易丝结婚生子。在这些回忆片段之中，超人注意到始终有一个黑色阴影隐藏在他的周围，他推测这个阴影是塔尔·罗。超人从昏睡中醒来，发现自己被塔尔·罗带至孤独堡垒。塔尔·罗使用氪星技术探索了超人的记忆，得知与克拉克·肯特有关的一切讯息。

艾朗返回泽莫维尔，与露易丝和塞缪尔会面。当得知超人的思想已经被塔尔·罗转变之后，艾朗称必须消灭超人，以免造成无法估量的灾难。露易丝坚信超人的体内仍存善念，试图说服艾朗挽救超人。她将超人的真实身份告知艾朗，表示超人内心会念及他们母子三人，从而不会彻底失去自我。

莱斯莉·拉尔意欲攻入美国国防部解救艾吉，被超人与艾朗于途中联手击败。莱斯莉被关进国防部的军事监狱。露易丝与父亲塞缪尔交谈，露易丝想要将全部真相告知小镇居民，遭到塞缪尔的反对。克莉丝希望深入挖掘与艾吉以及国防部有关的新闻报导，露易丝建议她尝试关注其他主题。克莉丝开始怀疑露易丝对父亲抱有私心，两人不欢而散。

泽莫维尔小镇的经济陷入困境，民众不满国防部军队长期驻扎在此处，要求塞缪尔·莲恩将军做出详细说明。由于财务危机，克莉丝有意出售《泽莫维尔公报》。凯尔在布里斯索尔县找到工作，有意举家迁离泽莫维尔。

泽塔·罗利用乔丹牵制住超人，派遣塔尔·罗前往泽莫维尔，将六名国防部士兵转变为氪星战士。随后，塔尔·罗进入蕴藏有大量X氪石的矿场，企图恢复氪星。超人与艾朗联手对付泽塔·罗和六名氪星战士。艾朗击倒被体内泽塔·罗的意识控制的乔丹，将他带回肯特农场。露易丝使用塔尔·罗的氪星技术进入乔丹的意识之中，说服他利用自己的意志将泽塔·罗驱逐出体外。

露易丝和克拉克作为一对夫妻苦苦挣扎，而克丽丝则适应了和露易丝一起经营《小镇公报》。乔纳森在足球场上面临着新的挑战，而秘密可能会破坏乔丹和莎拉日益增长的关系。与此同时，凯尔越来越担心拉娜与一位新市长候选人的关系。最后，约翰·亨利·艾恩斯和他的女儿娜塔莉试图让这个新地球成为他们的家。

克拉克向露易丝坦白了他与幻觉的斗争，并承认可能只有一个人能提供帮助。与此同时，拉娜收到了一些意想不到的消息，露易丝和克丽丝之间的紧张关系开始升级。最后，莎拉打破了与乔丹共度娜塔莉时光的计划。

在与乔纳森和乔丹的激烈争论中，克拉克的视力变得更差，露易丝向莱恩少将伸出援手。与此同时，拉娜和凯尔分享了她的沮丧。最后，娜塔莉得知她的父亲没有履行他对她的承诺。

露易丝和克丽丝正在执行一项任务，寻找露易丝的妹妹露西、乔纳森和乔丹。随着克拉克痛苦的幻觉继续，他们变得越来越不安。与此同时，拉娜、凯尔和莎拉共享家庭早餐，讨论莎拉即将到来的五年节。最后，娜塔莉和她的父亲分享了一段亲密的时光。

拉娜、凯尔和莎拉为莎拉的五周年庆典做准备，但事情并不像他们希望的那样顺利。克拉克发现自己在为约翰·艾恩斯的遭遇感到内疚，而露易丝担心她可能对艾丽的看法是错误的。与此同时，乔纳森得知，雷特·塞缪尔·莱恩将军计划训练乔丹。最后，克丽丝去寻找露易丝的真相。

露易丝告诉克拉克，她和克丽丝计划深入研究反向社会，拉娜和莎拉在莎拉的昆切纳火山爆发后试图互相安慰。与此同时，乔丹注意到乔纳森书包里有可疑的东西。最后，米奇·安德森中尉发现自己因为国防部与超人关系的恶化而受到抨击。

超人恳求安德森中尉调查爱丽·奥尔斯顿，而露易丝收到了一些非常令人不安的消息。与此同时，露易丝帮助拉娜准备好打好这场比赛。最后，乔丹仍然对乔纳森撒谎感到恼火。

露易丝、克拉克和娜塔莉注意到约翰·亨利的行为有所不同，他们担心事情可能会非常不对劲。与此同时，凯尔在家门口接莎拉上学时遇到了拉娜的尴尬时刻。最后，当乔纳森和乔丹意识到父母的谈话即将到来时，他们做好了准备。

当一名足球运动员的母亲开始纠缠他取消足球赛季时，洛伊丝感谢拉娜为乔纳森挺身而出。与此同时，乔丹在市长选举日出人意料的离去让莎拉惊慌失措。最后，娜塔莉和莎拉想知道他们是否注意到约翰亨利和拉娜之间的火花。

超人跟随艾丽·奥尔斯顿穿过传送门，但当他到达另一边时，他发现这个平行地球上的一切都是那么怪异。超人在熟悉的面孔和风景中穿行，为了阻止艾丽的合并，他展开了一场疯狂的战斗。

我们在离开的地方继续前进，乔恩-艾尔对着 露易丝傻笑，他仍然和 Jordan 站在门廊上。 乔恩-艾尔看到了他的分身乔纳森，他站在不远处。 他冲向他，乔丹试图干预，但乔恩-艾尔似乎比他更强壮、更快。

我们在离开的地方继续前进，克拉克漂浮在拉娜面前。与此同时，乔丹和乔纳森质疑洛伊丝和克拉克是否在告诉他们完整的故事。最后，娜塔莉尽力让莎拉承认乔丹。

克拉克和露易丝在判断艾莉·奥尔斯顿是否进入逆世界的最佳方法上存在分歧。与此同时，约翰亨利有了一个惊人的发现，露西开始追踪露西。

疲惫的露易丝在超人的床边守夜。与此同时，乔纳森和乔丹继续担心他们的父亲，他现在似乎比以往任何时候都更加人性化。最后，约翰·亨利和娜塔莉一起找出抵御艾莉·奥尔斯顿力量的最佳方法。

经国防部授权的 Chrissy Beppo 向超人前传的人们传达了一个信息，行星的合并不仅是真实的，而且正在发生。

Lois' undercover assignment reveals a deadly foe that promises to change the Kent family forever. Meanwhile, the Kent boys find themselves being pulled in opposite directions.

Clark and Chrissy both notice a small crack in Lois' game face. Sarah and Jordan have an awkward encounter, and Lana receives a panicked phone call.

Lois and Chrissy pursue a new lead in the Mannheim investigation against Clark's wishes. Meanwhile, Jonathan, Jordan, and Nat face an unexpected obstacle.

Lois interrupts an intense conversation between Clark and John Henry. Meanwhile, Jonathan has a heated discussion with Candice's dad.

Clark and General Lane are both having a hard time giving Lois room to make her own decisions. Meanwhile, Lana and Sarah have a run-in with an old friend at the diner.

Clark finds himself in uncharted territory, and Lois bonds with a new friend. Meanwhile, Superman pays Bruno Mannheim a surprise visit.

Lois and Clark dig deeper on Bruno Mannheim, starting with his connections to Hob's Bay Medical Center, while Jonathan and Jordan panic at home over Lois' dire diagnosis.

After learning about Bruno and Peia, Clark works to reignite Lois' interest in taking Bruno down; elsewhere, Natalie meets Matteo's parents, with disastrous consequences.

Superman and John Henry clash over how to handle Bruno Mannheim, while Lois worries over upcoming treatments and confides in Lana about her early courtship with Clark.

Lois attempts to interview Peia in the hopes of unearthing the truth about an old case, while Clark struggles to spend quality time with the boys.

Clark helps Lois prepare for a procedure but must leave the boys with her to help John Henry and General Lane track down the Mannheims.

Finally, after seventeen years behind bars, Lex Luthor is set to be released from prison. Lois and Clark clash with Jordan over his carelessness around using his powers in public, while Jonathan struggles with Kyle's change in behavior at the firehouse.

All of Smallville comes together to view a meteor shower, and Lex Luthor makes his move to take down Superman and Lois.