El anime readaptará la serie principal del manga.
Han pasado diez años desde el final de Bakumatsu, una era de guerra que vio el levantamiento de los ciudadanos contra el shogunato Tokugawa. Los revolucionarios querían crear una época de paz y un país próspero libre de opresión. Ha llegado la nueva era de Meiji, pero aún no se ha logrado la paz. Las espadas están prohibidas, pero la gente sigue siendo asesinada en las calles. Los huérfanos de los veteranos de guerra no tienen adónde ir, mientras que el gobierno parece contentarse con llenarse los bolsillos con dinero.
Desde hace 18 generaciones, los samurais de la Casa Shiba han luchado contra los malignos Gedōshu, unos espíritus diabólicos que entran al mundo de los vivos a partir de grietas entre edificios y otras estructuras. Ahora, Takeru Shiba, el líder más joven del clan Shiba, debe reunir a sus cuatro vasallos como los Shinkengers, para luchar contra los Gedōshu, gobernados por el resucitado Dōkoku Chimatsuri. Sin embargo, tras unírseles un amigo de la infancia de Takeru, Genta, los vasallos descubren poco a poco que hay una razón para la forma de actuar de Takeru que le diferencia del resto de sus ancestros.
Con la ayuda de sus nuevos amigos, un conejo adolescente que anhela convertirse en un verdadero samurái lucha por proteger su ciudad de monstruos, ninjas y alienígenas.
Un señor samurai ha regalado los órganos de su hijo recién nacido a cuarenta y ocho demonios a cambio del dominio en el campo de batalla. Sin embargo, el niño abandonado sobrevive gracias a un curandero que lo equipa con prótesis primitivas, letales con las que el hijo maltratado usará para cazar a la multitud de demonios para reclamar su cuerpo pieza por pieza, antes de enfrentarse a su padre. En sus viajes, el joven héroe se encuentra con un huérfano que dice ser el ladrón más grande de Japón.
Sakazaki Iwane is a ronin who spends idle days in Edo. Until a few months ago, he was a promising son and successor to a powerful family in Bungo. He has came back to Edo, where he lived for a while for swordplay training with his two best friends, after a tragedy in the three's home domain—both of the two friends died, one of them killed by Iwane by command of the domain lord's chief retainer. Iwane left his home for Edo, leaving behind his fiancée, a sister of the friend he killed. Eventually, Iwane detects the conspiracy behind the deaths of the two friends and struggles to reform his domain.
Ran Tsukikage (月影 欄) (Seiyu: Yasuhara Reiko): Una chica samurái sin dueño (Ronin) la cual le gusta el sake y haría lo que sea por obtenerlo, y tiene una gran habilidad con la espada, su ataque especial es el "Ataque de Media Luna", le gusta que su vida sea sencilla, y siempre esta atenta a todo o quienes los rodean.
Myao (ミャオ) (Seiyu: Akemi Okamura): Se une a Ran en su viaje, es una maestra en las artes marciales de la escuela del golpe del puño felino, es muy alegre y despreocupada, ella siempre lucha por el bien aunque siempre se mete en problemas por eso y siempre Ran tiene que salvarla, aunque parezca la más inmadura de las dos siempre tiene que dar su dinero para darle de comer y de beber sake a Ran y siempre tiene que pagar los problemas que ocasiona Ran.
Continuing the tradition of the Yojimbo movies, Mifune Toshiro stars as Toge Kujuro, a wandering ronin searching for his own fame and happiness. With a sense of justice, he travels the countryside, with his motley collection of outcasts - a pistol-carrying ronin, a two-bit con artist and woman seeking revenge, following close behind, unwittingly righting wrongs and protecting the common man.