Os investigadores paranormais Zak Bagans e Aaron Goodwin visitam um local assombrado para tentar desvendar o que motiva cada aparição. Para isso, contam com a ajuda de testemunhas, especialistas e técnicos.

Em meados do século XXI, todas as guerras na Terra cessaram. O súbito aparecimento generalizado de "heróis", pessoas com poderes sobrenaturais que desejam apenas a paz, transformou drasticamente o planeta. Em um mundo em que os heróis de cada país trabalham para manter essa paz recém-descoberta, quem protege o Japão é uma jovem chamada Shy, que é... incrivelmente tímida.

O Personagem principal é Loki, o deus nórdico da trapaça. Depois de causar varios problemas na terra dos deuses, Loki foi banido ao mundo dos deuses e transformado em uma criança. Para voltar para casa, ele precisa capturar "auras malígnas", e então funda a agência de detetives enjaku, especializadas em eventos misterios, para facilitar sua busca. Ele acaba atraindo Mayura Daidoji, uma adolescente fanática por misterios, que rapidamente acaba se convidando para fazer parte da agencia.

A série se passa durante o período Edo, no distrito Fukagawa do antigo Edo (atual Tokyo). A área é propensa a incêndios e inundações, os moradores alugam itens como panelas, colchões e roupa de lojas em vez de compra-los para que isso não os impeça de fugir quando necessário. Obeni e Seiji, uma irmã mais velha e irmão mais novo, dirigem uma loja de aluguel chamada de Izumoya. Entretanto, misturado em seu estoque, estão Tsukumogami, objetos que se tornaram espíritos após anos de existência. Os irmãos às vezes emprestam estes raros itens para os clientes. Tanto Obeni quanto Seiji podem ver e falar com estes espíritos, e outros Tsukumogami normalmente vão para a loja após ouvir sobre os tão famosos irmãos.

Based partially on such blockbuster American TV series as "The X-Files" and "CSI", "Mystic Detective Files" explores the themes of supernatural existence and unsolved mysteries, as a forensic investigator, a former undercover cop, and a police psychiatrist must work together to solve a series of unusual deaths that may or may not have to do with paranormal activities.

Kowabon, uma história de horror, vai ser animada usando uma técnica chamada rotoscopia. Os animadores irão traçar quadro-a-quadro a metragem como um live-action para recriá-lo como animação.

U.S. Navy veteran turned private investigator Jennifer Marshall investigates some of America's greatest unsolved mysteries.