The Teenage Mutant Ninja Turtles are back in an all-new animated series on Nickelodeon! Surfacing topside for the first time on their fifteenth birthday, the titular turtles, Leonardo, Michelangelo, Raphael and Donatello, find that life out of the sewers isn't exactly what they thought it would be. Now the turtles must work together as a team to take on new enemies that arise to take over New York City.

這隻正值青春期的兔子一心想成為真正的武士，他和新認識的戰士朋友組隊，合作保護城市不受妖怪、忍者、邪惡外星怪物侵害。

由於「惡魔契約」曾經引發了一場禁忌的戰爭，使人們過著塗炭生靈的生活。現在已經恢復平靜的大陸視其為禁忌信仰，並過著和平的日子。生性正義的瑟希莉繼承父親的職業，成為大陸自衛騎士團的一員。她的願望是將代代相傳、殘破不堪的劍鍛造成一把鋒利堅韌的劍！她在無意間遇見擁有一把力量強大的劍，且鍛造技術神乎其技的路克，希望他能完成自己的心願。然而這個路克渾身充滿迷團，不但不輕易鑄劍，還對「惡魔契約」異常瞭解！他到底是個什麼樣的人......？悄悄甦醒的「惡魔契約」又會在大陸上掀起怎樣的風暴呢？

江戶時代末期（本作的20多年前），被稱為「天人」（あまんと）的謎之外星人來襲，人類與天人之間的戰爭瞬即爆發，為數眾多的武士和攘夷派志士均參與戰鬥。

幕府見識到天人強大的實力後，立刻低頭，放棄武士不管，並與天人簽訂不平等條約，准許他們入國。之後「廢刀令」頒發，使武士們已經忘記怎樣去貫徹自己的武士道。自此，幕府為天人所控制，形成「傀儡政權」，造成權利的腐敗，幫派和惡徒也因而肆意猖狂。

在這樣的時代，一個仍舊保留著武士之魂的男人坂田銀時與同伴志村新八、神樂經營著萬事屋（只要有錢什麼工作都接），愉快地過著異想天開的生活。