W otoczonym wysokim murem mieście ostatni ocaleni starają się przetrwać ataki olbrzymów, które od wieków nękają ludzkość. Gdy pewnego razu potwory wdzierają się do miasta, jedną z wielu ofiar jest matka nastoletniego Erena. Chłopak poprzysięga zemstę i wraz z najbliższymi przyjaciółmi, Mikasą i Arminem dołącza do oddziałów obronnych. Kilka lat później młodzi żołnierze kończą szkolenie i właśnie mają dołączyć do jednej z jednostek specjalnych, gdy niespodziewanie olbrzymy ponownie atakują.

Po śmierci rodziców Shinpei Ajiro zamieszkał z siostrami Kofune, Mio i Ushio. Z czasem wyprowadził się i zamieszkał w Tokio. Powraca on jednak do domu, by odbyć żałobę po śmierci Ushio. Utonęła ona, ratując małą Shiori Kobayakawę, lecz siniaki na jej szyi tworzą wątpliwości co do prawdziwej przyczyny jej śmierci. Shinpei uznaje, że musi istnieć inne wyjaśnienie. Pomiędzy mieszkańcami rodzimej wyspy krążą zjawy. Ostatnią prośbą jednej z nich, widma zmarłej Ushio, jest: „Ocal Mio”. Utwierdza to Shinpeia w przekonaniu, że coś jest nie tak, a śmierć siostry stanowi jedynie element większej układanki. Z pomocą Mio i innych, Shinpei stara się ocalić siebie, rodzinę i znajomych. Jednak w miarę postępów w śledztwie, wizja ta staje się coraz mniej prawdopodobna. Gdy mroczne siły opanowują wyspę, przez ile cierpienia będzie musiał przejść Shinpei, by ocalić wszystkich?