어느 날 밤 이상한 꿈을 꾸고 난 사쿠라는 아빠의 서재에서 꿈에서 본 책을 발견한다. 책 속에서 발견한 카드를 읽는 순간, 신비한 빛이 쏟아지면서 봉인된 카드의 파수꾼인 ′케로베로스′를 잠에서 깨운다. 그러나 카드 집을 열면서 크로우 카드의 봉인이 풀려 다시 카드를 모아야 하는데....

방문한 사람의 소원을 들어준다는 신비한 가게의 여주인 이치하라 유코와, 요괴나 마물 같은 정체불명의 것들이 눈에 보여 이치하라의 조수로 일하게 된 고등학생 와타누키 키미히로의 이야기.

거대 학원도시 CLAMP학원을 무대로 학생회장 노코루와 그를 보좌하는 스오, 아키라 3인방이 펼치는 좌충우돌 코미디라고 할 수 있는데, CLAMP 학원은 다른 작품들에도 등장하는 배경이 되고 있다. "20면상에게 부탁해!"라든지, "학원특경 듀칼리온"등이 그런 작품들이다. 후에 X에도 등장하는데 이때 노코루와 스오,아키라는 성장하여 등장한다. 츠바사 크로니클에도 셋이 모습을 드러낸다.

1993년, 도쿄 타워에 학교 단위로 견학 온 여중생들 중 각각 다른 학교의 세 사람이 세피로라는 이세계로 갑작스럽게 소환되며 이야기가 시작된다.

재수생인 히데키는 시골에서 상경한지 얼마 안되는 처지로, 대유행중인 인간형 퍼스널 컴퓨터를 무척이나 가지고 싶어하지만 여건이 되지 못해 구매를 하지 못하고, 어느날 그는 버려져 있던 여자 어린아이 모습의 퍼스널 컴퓨터를 발견하여 집으로 가져오게 되면서 일어나는 이야기를 그린 애니메이션

중학교 입학을 계기로 상경한 스즈하라 미사키는 전광판에서 엔젤릭 레이어의 시합을 보고 거기에 빠져든다.

그 뒤 공식대회에 출전하면서 다양한 강자들과 만나게 되는데⋯.

방문한 사람의 소원을 들어준다는 신비한 가게의 여주인 이치하라 유코와, 요괴나 마물 같은 정체불명의 것들이 눈에 보여 이치하라의 조수로 일하게 된 고등학생 와타누키 키미히로의 이야기